+Marker Data: est_rbw01l06

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_12
Marker Type SNP
Map Position 96.8
Annotation
Source Name RBW01L06
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd GTTTGCTCAAGAGAATATTGCCCC
STS_primer_rev ACTCATGGCTAGAGCCCCCACAT
amplicon_seq TAGGTGATAGACAATTATTTCCCTAAGGTATGCGCTATATTTGCTTTCGTTGTCTGAGGTGTTCTATCAAGTATCAACAAAAAAAAATGATATTTTAACTCTGTTATTCTTGTCTATCAGGATGTTAATTTGTGGAAACTAATGGGGGACTTTAATCTCCATGGTATTACGGTGCCAGGTAAGCTTTTGAATCGTAATCTCTTTATCGATTTTGATGTGATATTATAGGGCCAAGAGAGGGCAAACAAAAAAACTACTGACACTCCTCTTGAGTGCTATACTTGAAACTGAAAAACCTAAACACAGATTTCCCCTGACAATCCCAAAAGTTTTGTGTCTGAAATTGCTTGCTTGTCTGTGTAAAGGAATATGGGGGACTTGGCCTTGGTTATCTATATCACTGCATAGCCATGGAAGAGATTAGTCGAGCGTCAGGGTCAGTTGGCCTATCTTATGGTGCCCACACGAACCTATGCATTAATCAGTTGGTAACTGTTTTTTCAACTCAAGTTATACATAGGTGGTCTCTCAGTGTTGAGTACCAAATAATTAACTACTGATGATTTTGTAGGTTAGAAATGGAAACCATGAGCAGAAGCAAAAGTATTTACCAAAGGTGTTCTTCCACTATCACATTTTTGTTTCCAGTTGTATATTTACACTTCCTGCCAGCTACTGTATTTTTTCCAATATACGTGATTGGACATCTGTGATCTTCAGTAGAGCACCCTTTATATTGACTGAATATTATATTCCTTAAGGATATCTCGATTCACCAAAATATATCTCATAAATGCTTCAGATCTTGGTGGATCCATTTAGTCTAGATTAACTGATAGCGGTAGAATTGGTTTTTTATCAGCCAAAAAAAAAAAACAGCCGGAGGGTAGGCCATAGGTTTATGCAGCAACAACTTCACATAGTAATGACACAAGCTTGATAGATGAAGAGTTGGATATGTGGGAATACTAACTTATTGATGCTTCAAATACTTTGTAACTTCCAGTGATGAATTCTAAAGACTTTTATATCCAGCATGTTATATGGATCTATAATTTAGAACACTGGGAAATATGCAGGGCTTCAAGTTATAGATGACATTGGTTCACTCGGTTGGAATGAATTTACTAGAGCAATCTTCCCTTTATGAAGTTATACTAAGAGCAAATTAAGCTTTCTTTTGCTCAAACATAACCCAGACTTATTGTGGCTCTCACTTGGTCCTGTTTACATTTGTTCAAGAGTTTGTCTTTGAATGTAGGGGTGCAAAAAATATAGCATTATCCTAGTATCTCTGTTCTGTTAATGTTAATCTCTTCTATTATTTTAATGAAATGTCTGAAGGGCGTAAATAGCAGCTCACTCTTTGTAACTTGATTGTGAGCTATAGA
SNP_position 1035
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCATGAATTCTAAAGACTTTTATATCCAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCATGAATTCTAAAGACTTTTATATCAAG
Common_primer GCCCTGCATATTTCCCAGTGTTCTAAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_12 96.8
ALF2 AL12 108.1
LW2010 E_12 97.0
LWA2010 LWA_12 95.997
LWAE2012 E_12 92.915
LWF2_2022 E_12 108.1
NAF2 NA12 101.0

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain