+Marker Data: est_pla02f24

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 60.7
Annotation
Source Name PLA02F24
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd attaagccattcgatgcttgttcc
STS_primer_rev cagcatcaacctctcctcttcctc
amplicon_seq NNNNNNTNCGTTGTGCTGCCAGAAGGACATGTCTTTTGCAAAGAATGCATTCTAGAATGCCTTTTGTCCCAGAAAAAGGATATCCAAAGGTACCTATTTTCTGTACTTTGTAAACTTTCTCAATTGATCTTTGGTAGATTTGAAAGAAAAAGATGTTATATATGAGTTGTGCAGTTTTTTTCAATGCTTAAGGTGCTTTTGGTATGAAATTATATTTTTTGGTGCTGAGATGTGGTTAGATTGGGAATCTCATTTACTTTGTTATGTGTCCGGGTCTGTAAAATTGTGCTTGTGAATTCTATTTCATTTCATATATGAAATAATAATATAAAAAGGAAAACTATTTCAGCTAATATGTATGGTTCTTTCGCGGGGAGTGATATGTGGAGGTTGGCTTTAAGTAAAATTTTCCGTGTAGATTGGTAACAACAACTCCTTCTAATGCGGTAAGGCTCATTGTTTGGAAGGACACTGCAGTAAGGTGCCAAAATTAGCAACTTTGAGAGTACAATGGCCATAACTAGTGCTTTCATCTGTTTGACATCAAAACAGAGAATGTCTCATTGATTAAGAGACTCTTAGTTTTATGTCCTTACCCCTTAGTATAGCTCTATTTGGATTAGATTGAGATGTGTGATGTCTGCGGTTGTACGCTAGTCTTATGATTCAGTGCATCTTGAAGAGAACCCATTGGATGTGTTTTTNGTGTATGTTGTGATGAGGATAAATGTCGCATAGATGANGATGTTGAGATGGATGTATGGTCACACCAGAGTGATAGATNNNNTAGATGAGACCATTCGNNNNNNNNNCTGACGTGAAAACTATATTGTAGTCCCATGGTNAACATAAAAATATTGGTGTNGGATCTCTTACAAGGCTAGAGTCTCCCGGTACTTACAAATTGCTATAATTTGATAACATGGTTAGTTTTGCGAAGGGTGCTGTCATTTTTCAACTTTTTCTTTAATGCTATTCTTTACTATTACCAAAATACTAATATGCAAGTACAACAACTATGACTAAATCCCACAGCAGGGGAGTTGGCTTTTTGAATCCTCACAGTGCATGTCATTAAGCTCATCTCAGTCCAATACTAATATGCAAGTCAAAAAAAGAAAAACTAAAAGGATAACACTGAATTTTCATGAGCCACTTTACTGTTTGCCTTCTATTGTTGTAATGATAATATGCAAGTTAAAATTATTTCAATCTCCAACTCCAACTATTGTGTCCCATAAAGTAGTGGATGAAAGGAATAAACTAGCTACTAAAAAGGTCTTCATACTGACTTGTGGAATACTTGTTTGGAATCCCTTTTAAGTGAAAACAGCAGCCTTTCTGAGTATATAGTTTTAAGTTGTGATGCATGTCGTTAGTTGCTTCTATTAATAAAACAGTTATCCGTATTTCACCTGGAAGGAATAACATTTGACTAATACATTTGTCAATTGTGCTTCAAGCCTGCATTTCTCTGAAAAAAAGAGAAAAGGGCAGTGAGGATTGGAAGATAGGGATGGGGATTTGGTAACATTCTTGTTTATAATCTTAGAATTGTCCTGCGAGAAATTTTATTTGATAATCTGTTACTTTGTCTTGCAGAAAGTTAATGCTCATACTGCCNNNN
SNP_position 315
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCCCTTTTTATATTATTATTTCAT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCCTTTTTATATTATTATTTCAC
Common_primer TCCGGGTCTGTAAAATTGTGCTTG
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I
Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 G G
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 A A
Population Linkage Group Position
AL2010 E_02 60.7
ALF2 AL02 62.6
LW2010 E_02 45.5
LWA2010 LWA_02 46.625
LWAE2012 E_02 47.448
LWF2_2022 E_02 74.9
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain