+Marker Data: est_cpa04b03

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 93.1
Annotation
Source Name CPA04B03
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd CCGATGAGCTTGGGTTTATCTCAC
STS_primer_rev ATTAGGTTTGCCCTTAGCAGACCC
amplicon_seq TGACAGCTAAAGTTAGCCCTGACAGGTAATTTGCTATGTTGACTTATTTATTTCATGTTCTACATGGTTTCATTCTGGATATTCTTATGTAACAAATACTGAAATAATGAATTGCCATTGAAAAAAAGAAAAGGTAGTTTAGTGTATGGAAGGGAATGATAGCATATGAAAGGACTCTCCACCTTCAATAATGAGTTTAATCCAGCAAGGGAAAATGGTGAAAAAGGACCAACATAACTCTTGGGTAAGGGGATTTGGGGGGTGACCTTATGAAAATCTATTGCTACTGAACACTTTGGTTTTGTATGGTCTAGCTTGTATTCTTCTGCTAAAGCTTGTGTAGTACTGCTATTTTCTTTAATTTGAGATTGTAATTTGTTGTTGGATGACGTTACCCTATATGGTTTCTGATGATGCTCTATGGTCATTATTAAAATTTTACATACTGCAAATTATTTGGTTTAACCCTGGAAATTGTCGATTCTGATACTTGAAATTAAATTATGTCATGCAACTGCAACAGAAAGTCTAAAGAGTATACATTTATAAATATTTGGAATAATGTGCTCCATAAAGCATGCTGATGGTGCAGCATGTAGGCTGGCAATTTCATTGTTTACATGCCATTGGTATGCTCATTACATATGTGTCACATATGATGCATCACATGTAATTTGAGTGGTCACACACTGTGGTTGTGTGGTTTCCTGAAATCTGACAGTTTCTTGGCATTACAGGTTATGTAAAT
SNP_position 217
allele_1 G
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCATGAGTTTAATCCAGCAAGGGAAAATT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCATGAGTTTAATCCAGCAAGGGAAACTG
Common_primer CCCAAATCCCCTTACCCAAGAGTTATG
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 G G
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_09 93.1
LWA2010 LWA_09 91.513
LWAE2012 E_09 75.624

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain