+Marker Data: est_cpa03j24

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_08
Marker Type SNP
Map Position 36.7
Annotation
Source Name CPA03J24
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd TCTCCCAAAAGATGGGTTTCTCAG
STS_primer_rev CTGAATAACCTCCTCAGGCTTTGC
amplicon_seq ATGAGAGTGAGTGGGTGTATCCTTTTTAAGCCATATGCTTTTAATTTGTACTAAAGATTGAATCTTTAACAAAAAAAAATGATGATAAAGGTTAAATTAAGTTATTGAGTTCTTGGAAGAATGTTATTGATCTTGTGAATTAAGTTATTTGTTCAAAGTATATGCTTATTACTAAAGCTAAATAATGGTGTTTATAAACTCACCTTACTATGGAATTATATGTCACTAAAATGTAAACTTATTACTAATGCCAAATAATGGTAAATTTAGCTGTGACTTATTTGATATTTCTGTTAAAGATGAAGTCTTTAACCTTAAAAATTATTCCCTCTGTTTTGATTTTGTTTTGGCTTGAAACTAAATAATATTAGGCTATGAATTGTGACATAAAATCGTCAATTTTTATGAAATATGATTTACATATTTAGGAACCACATTGAAAATACTATAAGTAACAATGGTGGCAATTGACTTGAGCTCGGGGTTTGCTCCCTTTCAAGGTCTCAAGTTCAAAAGCCACTGGGTGCAAACAATTTCTGAAGTCCACTGGTGGACTTGGTAAAACCTGAATTAACCGTGGTGCACTTGCAGGAAAGTCTTTATCGAGGGCTTGTGCACCCGTGGGATTTCTCAGGGCTCAAAGAGACTCGGACACCCGGTGCGAAACAAAAAAAATTTCAAAATAGCTAACCATTTAAAATAAGTTACAATACTTAACAATTCCAAAAATATTTTAG
SNP_position 102
allele_1 T
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCAAAATGATGATAAAGGTTAAATTAAGT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCAAAATGATGATAAAGGTTAAATTACGC
Common_primer TTCACAAGATCAATAACATTCTTCCAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 T T
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
AL2010 E_08 36.7
ALF2 AL08 42.6
LW2010 E_08 42.7
LWA2010 LWA_08 38.062
LWAE2012 E_08 38.881
LWF2_2022 E_08 44.4

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain