Typing_Method |
Tm-Shift
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Marker_Class |
EST-misc
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STS_primer_fwd |
TCTCCCAAAAGATGGGTTTCTCAG
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STS_primer_rev |
CTGAATAACCTCCTCAGGCTTTGC
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amplicon_seq |
ATGAGAGTGAGTGGGTGTATCCTTTTTAAGCCATATGCTTTTAATTTGTACTAAAGATTGAATCTTTAACAAAAAAAAATGATGATAAAGGTTAAATTAAGTTATTGAGTTCTTGGAAGAATGTTATTGATCTTGTGAATTAAGTTATTTGTTCAAAGTATATGCTTATTACTAAAGCTAAATAATGGTGTTTATAAACTCACCTTACTATGGAATTATATGTCACTAAAATGTAAACTTATTACTAATGCCAAATAATGGTAAATTTAGCTGTGACTTATTTGATATTTCTGTTAAAGATGAAGTCTTTAACCTTAAAAATTATTCCCTCTGTTTTGATTTTGTTTTGGCTTGAAACTAAATAATATTAGGCTATGAATTGTGACATAAAATCGTCAATTTTTATGAAATATGATTTACATATTTAGGAACCACATTGAAAATACTATAAGTAACAATGGTGGCAATTGACTTGAGCTCGGGGTTTGCTCCCTTTCAAGGTCTCAAGTTCAAAAGCCACTGGGTGCAAACAATTTCTGAAGTCCACTGGTGGACTTGGTAAAACCTGAATTAACCGTGGTGCACTTGCAGGAAAGTCTTTATCGAGGGCTTGTGCACCCGTGGGATTTCTCAGGGCTCAAAGAGACTCGGACACCCGGTGCGAAACAAAAAAAATTTCAAAATAGCTAACCATTTAAAATAAGTTACAATACTTAACAATTCCAAAAATATTTTAG
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SNP_position |
102
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allele_1 |
T
|
allele_2 |
C
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ASP_primer_S |
GCGGGCAAAATGATGATAAAGGTTAAATTAAGT
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ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCAAAATGATGATAAAGGTTAAATTACGC
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Common_primer |
TTCACAAGATCAATAACATTCTTCCAA
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enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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