+Marker Data: est_ae005k03

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 131.2
Annotation
Source Name AE005K03
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd GGTTGGAATTTTCGGGGTGTG
STS_primer_rev CTATGCCACTGACCAGGTTTAGGC
amplicon_seq ACGATGATTCGATGTCTGTTAAGCTATTGAATTGAATCATAATTGTGATACTTGTACAGGAATGGAGGACAAGAAGGCTAACGGCATGTTTGTATCAGTTCATGTTAGTTTGTTGAGCAATTTTGGATTTGATTGGATGGTGTTCCTTAGATTTTTAATTTTTCTAATATCTTATTTCACTGACCTTTGTCTCACTCTCTTATCATTGTGAGTCTGCTATTGTTCTACTGATTCCATGTGGTGTATGAGGCTTGGGTGAGCACAACTTTTTGGTAGAAGTCGTTGAGAACTTGGTTGAGAATGAAGCTATTTTACTTTAAAATATTTTTAGGACCAGAATGATAGAATCTGGAAATTGATATGCGATTTTGTTGGTTCCCCACATTGGTTGGTTAAGGGGTACTTGGTCTCTCTTGGGTTCCCTTCATGAGCTAACTGTTTGGGTCCATCCCAATTCATTGTTTAAGATGTTGTCCTCCAACACCTGGTCTTATATTGTGTGCACTCCAGATGCCCGTCCTAGGTAGGCGTGTGCACGCGCGCTTGAGTCCCACATCGGTGGGTTAAGGGGTACGTGATCTCTATATATGGTCTTGGGCAATCCTTCCGTTAAAAGCTAGCTTTCGGGGTTGAGTTGGGCCCAAGACCCATTTCTTTAACAATTTCTGAATTATGTTCTCTTTTTTTGAGAAATCTCATAACTCCAAAACTTTAGCCAAATAAAGGAAGCTGTTAGATCATCTATTTTTAATTTTTAAACCAAAAATGTCAAGGATGGTGGCATAATTTATCTTTGCAATTTTTTTGTCTGTTTTGTTTTTGCGTTCTAATGGATAGACCAACATAAAGACATGAATTTGTTTGTGACAGGCTATTATATGCGGCAAAGTTGGTCAATCTCCTGTGCAGAAGATATTGAGAAATGGACGAACTGTCACTCTCTTCACAGTTGGAACAGGTGGCATGTTGATCAGAGATCCCACATAC
SNP_position 891
allele_1 T
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCAATATCTTCTGCACAGGAGATTGACCA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCAATATCTTCTGCACAGGAGATTGAACG
Common_primer TTTGTGACAGGCTATTATATGCGGCAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 T T
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
AL2010 E_01 131.2
LWA2010 LWA_01 111.784
LWAE2012 E_01 111.764

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain