+Marker Data: SOL8804

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_08
Marker Type SNP
Map Position 30.5
Annotation
Source Name AE002N06F
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GCAGCTGAGGTTGAAAAAGC
STS_primer_rev TGCTCCGGTTCTTAAAGCAT
amplicon_seq ACCTGGCCTCAATTTCATTAAAAATTGGGGTCAATTGTATGAATCCTTCGGACATGTTCCTCTTTGTTCGGACCCAAAATCATTGGAACAACTGACATATCTTGCTACTATAATTCTTGATGTATTTTGGGAGGTATCTTAGATCATGTAAATAATTAGAGATAATAATGTATTTCCTCTGAAAGAACTGGTTAGAGATAATAAGCTCAGAGATGCTTTAGATGAAAACTGCATTTGATCCTATTGGTCTGCTTGAGTTCTGCATATTTTCCTTACATTTTCCTGGATATTTCCACTTTAAAGGAACGAACATGGTTTTCTTGCTCACATCAGCTTAAGCTAGTCTGNTGGTTGTGATTTCCAGCTTTGAGTGAAAAAGCGAAGCAATTCACTCGAGAAAAAAATAAGAGGGGTATGATGTCCTGAAAATCATTTAATTTTTCATATGTAGTTCCTTGGTCAAGATATGCTTACATTAATATTTCTGTTGTATTAAGAGTCCTGTTTTTTCTTTTCGGCAACATTTTTGATGAATTGTTTGTTCTATGTTCAGCTGCAATACAATGTTTGAAAAGGAAAAGGCTCTATGAACAGCAAGTCGAACAGCTTGGAAATTTCCAATTGCGTATCCATGATCAGGTGCTCTTGATGTTCTGTTAGATTTCATATCTTTGCACATATTTTGTGTTATAACATCACAATAAGCATAGGCATTTTGTTGGATTTGGGTTTCAGATGATACTGCTAGAAGGTGCAAAAGCCACAACAGAAACCGTTGATGCTTTAAACCCCGAAAAAAAATTTAAACAAATATAGTATATGTATTGGTACCTTTGTGAACTTATCGTGTTATCCTTTCTGATTTTCTGCTTTGGGGATTTGGGGAGATACATGAGGTTATCCCTTGAGGTCCTTGTCGTTTCACAAATTCCTTTATTCTGCTTAAAGCCTGTTTAATGTTTCAATTTAACTATTTGAAGCAAGGAACAAAATGGAAAGGAAAGGTACGGGTCTTTGATTTCTAACCTCTTTTTATTTTAGAAAGCTTTTCTTTTAATTGGATAATGGGTCACCCTCTCTACCCTTTTCTCTAACTACTTTATCTACTTATTTTTAAGGAGGGAATGTTTCAAAAGAATATTTCATAGTTAAAACTTAGG
SNP_position 931
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCAGGGCGGCTTGAGGTCCTTGTCGTTTCACAAATTC
ASP_primer_L GCGGGCTTGAGGTCCTTGTCGTTTCACAAATTT
Common_primer TGAAACATTAAACAGGCTTTAAGCAGA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 T T
Nakate Shinkuro C C
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
AL2010 E_08 30.5
LW2010 E_08 39.1
LWA2010 LWA_08 33.029
LWAE2012 E_08 33.865
LWF2_2022 E_08 40.9

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain