+Marker Data: SOL8371

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 55.2
Annotation
Source Name SEP03O01F
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ATGCTTGTTCCTGGAAAGATCCAA
STS_primer_rev GGTCTCAGGGTAACGTGTCTCCTC
amplicon_seq TACNTCTGCATTAANGTGAGTGTTCGTTTTTTCTAGCTTTTTATTAATCAAAATTTGTATTACTTGGTCGCTTTAGATCGTTAAAGCTAATTGGTAGGATAAATTAGAGATTTATGCTAACTTAATGGATTATTTTTTGTTTGCCTATCTGCTAATTCAACTCTGATGGAGAGATTGTGAGGCTTCTATGCTGGATTAGTTATGTTCTTCCTTTACGGGATGCTGTAGAGTGAGATTTTCCTTTGGAAGAAGATAGAACCCTAGAATGATTTTTCTTTGGTTGCATTGTTTGCATTTTTCGAGACTCTACTCTCCATAAAAAGTTGACAAACTTTGGAGAGGATTTTTGATAGTTAAATTTCTTCAGTTTTGTGCTGCCAAGATACATTTTAGTAAACTAAGTGCAACAACTGTTTAATGTTTGGTATTCTTTTCCAATATTGTTGCTACCATCAGGATAAGTTTGTCTAGAGAAGATAGGTTTCTTCCGGTGGAAGAAGTAGTTGATTTTCTTTTCCAGCAAATAATTCATATTGAGAAATAAATGGACTCAGACAGGATTTGGCGAAACTTGATCTCACTGAGGACATGACCTTAGATAGAAAGGAGTGGAGGTCCCGAATTAGAGTAGTAGGCTAATTAGTTGATAGGGTTAGGTGGATGTCTGGCCATGGGGCATGGATGTCTGGCCGTGGGGAATGGTAGAATGTCTGTCATTATAAGTTGTATGAGAGTTAAATTTATCGTATTTACATATTGTTATGTGCTTTCCGTTATTAGTCACCCTTGCTATTCCCTTTCCTTTCCTTTTTGTCATATCTAGTTTATTCTGCTTATGGGTTTTTGGGACGAGGGTTTCCAGGAAACAACCTATCTACTTCTGGGAGGTAGTGGTAAAGGTCTGTGTACATTATACCCTCCCCAGACCCCACTTGTGGGATTCCACTGGGTCTGTTGTTGTTGTTGTTGAGAAANTAAATGGACTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAGACCATCTNAAATTTCAGAATCAATTGCATGATGCAACTTTAAATTTCTAAATNGTGGGTGGTCACTTTTCTGATGCTATAAATTTCCAATTTCTATTCCTAATCATGAACATTTTCATCTTNATTTGCTTAATAGTTGACATTGCGTTTGCCGACAATATTTATTCTGGGTGTTGCCTTTTTCAAGACGAAAGCTCATGGATTAGTTCTCGTTTATTTGTTCAAGAGACGTTTTTATGAAGATCTAATAGACAGTTGCTGAGCTAGTTTTTCGTAAGATCCATGACTTGAAGCCTTGGTGTCTCCACTGAAGTGCTGTCTAAGGAGGCGAAGCACACAGTTTGCGCGTGCCTGACTTCATTGTTTAAGCATGCTTGAAACCACACCTTTGACGATACTGTTCTATCCTGTGCACCTGAGGAGAAAAATTGCAGATTCAAATTGTCAGTTCTATGTTATGAGATCAAGTTATGACTGTTTCTATGTTCTTGTAAATCTGAAGTAGAACGCCTGAATAGTCAATCTAATGCTTGTATTGGAGTAATTAGTCATTTGATAGGCATCTTTTTAGTAAACCTTGTAAACTGTAGAATGAAGACCTTGCTCCTTGATTTATTTAGGAATTTCAAATGCATTTATTCTATCAGTACTGTTTTATCTGTAGGCTACTTTTACAATGTGCTCTAATTACATATTGTGCTTCTAAGCTGTATTGAGCAACTTCTAGGCATAACCATTCCTGTAGTTTGTCTGATATCTTTTGCCTTAACAAATTCATTGTGATTTTTACTCCCAATTACACCACTTCGTAAGTGCAGACATTCATTTTCTTAGTCTTTTAGCTTCCAACTGAGATGTAGATTCTTTATGAAAATGTATTGACTGCCTCATCCAAATTACAATTGCAGGAGGTTCATGATTCTTTATGAAAATGTATTGACTGCCTCATCCAAATTACAATTGCAGGAGGTTCATGATTACTTAAAGACTCTTTGTCCTGACTGCATAT
SNP_position 1856
allele_1 G
allele_2 C
ASP_primer_S GCGGGCCTACATCTCAGTTGGAAGCTAAAAGAG
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCTACATCTCAGTTGGAAGCTAAAAGAC
Common_primer ACACCACTTCGTAAGTGCAGACATTCA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 G G
Nakate Shinkuro C C
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_03 55.2
ALF2 AL03 51.3
LWA2010 LWA_03 81.835
LWAE2012 E_03 86.914

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain