+Marker Data: SOL7333

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 0.0
Annotation
Source Name PLA08B16A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGGGTTTTAGAGTTCAAGCTCCAC
STS_primer_rev CGTATACCCACTCCTCTGCCATTC
amplicon_seq ATCTTTTGACTTTTTTTTCTTCTGTTAATTTGTTTGATTAATGCCTTTTTCTTGAATTACCCTGATGAAATTTCCTGGTTAATGAGCTGCCTTGGCTAGAATTTTTGGTATTTTGTCTTGTTTCTTAAGGTACCCTGATGAAAATTCTTGGTAAATGAGCTACCTTTTCTGGAATTTTTGGTATTTGTCTTGTTTGTNGAGGTGCTCTGATGGAAATTCTTGGTAAAGGAGCTACCTTGGCTAGAAATTTTTGGTATTTGTCTTGTTTCTGGTGGTACCCTGATGAAAAAGGAGCAATCTTTACAATTACAAGAATTTTTGGTGTTTGTCTTGTTTGTTGAGGTACCCTGATGAAAATTCCTGGTAAAGGAGCTACCTTAGCAACAATTTTCTGTGTTTAGTTTGTTTCTTGAAGTACCCTGATGAAAACTTTTGTTAAAGGAGCCAAGAGTTTTTGGTATTTAGATTGTTTCTTGAGGTACCCGGATGAACATTCCCGGTAAAGGAGCTATTTTGATAAGAATTTTTGGTGTTTAGCTTGTTTCTTGAGGTACCCTGATGATTTTTTTGGTTAAAGTTTTAATCTTTCAAGGATTTTTGGTACTTAGCTTGTATACATTCTGGGTCTGTCTTAATTTGTCCTTTTGCAGCTCCAGTTGACATGAAAATTGGGAGTTGTCCAGGTGAATTCTTGCTGAATTTGCTACTTTTCAAGGGGCTCTTTGAATTTCCCCCCCTCTATTGCTATCAACATGCTTATTGGGTTAACGTGTCGTGTGACGGGTCTTAATCGAACATAGCGCTTGCTTAGTGAGATTAGTTAAGAAATAAAGTCATTCCCTTGTTAGCATCTATAATTTTTGGCATGATGGTAAGCGTGATCCTAACAAGTGCTATAGCTTTTGACACGATGGTGAGTGTTTGATCTTACAAGTGCTATAGCTTTTGGCATGATATTAAGCACTTGATCGTAACAACTTGGGCCAGGGTTAGAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAAAGTATGAAGAAGATGTAGCACTATTACTCGGATTAGAACCAATTNNAATATAGGTCTGTAGTAAATGACCTTTCAAAGTTTTAAAAGGNNGTTTACCAATGAATTGGTTTGTACAATGCTGAAAAATAGGATCNTGCATTATTAGAGCTGTCTCATACACTTGGAAAGTCAAAATTAGGTTACATTGCTGTAAAGCACAATGGAACAAGTGTCCATCTTGTGTATCTCCAAAGTATTTTTCCTTTTCAATAGTTTTATATTGGAGTAACTGGTAAAGTTGCTGCAATGTGACCAGGAGGTCACGGGTTCAAGCCTCGGAAACAGCCCCCGACAGAAATGCCAAGTAAGGCTGCATGCAATAGACCCTTGTGGTCAGGCCCTTCCCCGGACCCTGCGCATAGCGGGAGCTTTAGTGTCCCGGCTTGCCGTAATAGTTTTGTACTGGATCTTCCCAAGAATAAATGGACAAATCTTTTTCTTAGGCACACTGAAAGAACTTATACTAAAATGATTATTGAAGTGAGCTGATATATTTTCTGTAGGGCTACTATATNAGCTCTTAGCTGATATATCTGCTATTTGGTTACATAATTTAGATTCGGTGTTTATACGTTGTCCAGGCACTATGCTTTCTCAAACTCACAGTTAATGCATATTTTATCCTTATTTCAGTTTTCCTGCTAGTATTTGTTAGCTTGTGATACTTGTCAGCTGCTAGAATATTCTAAATTAGTAAGCATTTGCAGGTTGATTCCGTGTCATGTTATTGCAAGGTTGACTCAGGGTTTAAGACAGTTGCAGGGGCAAGAAAATTTGTCCCAGGATCGAAAATTTGCATCCAGCCAGACATTAATCCTCATGCACACAAGACTAAAAATTCCCGTAGAGAGAGGTCAAGAGTGCAGCCACCTCTTCTGCCTGGTCTACCAGATGATCTTGCAATTGCTTGTCTAATTCGTGTTCCTCGTGTTGAACACAACAAGCTCCGTTTGGTCTGCAAAAGGTGGTATCGGCTTCTTGCTGGAAACTNNNNNN
SNP_position 247
allele_1 A
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCTGGTAAAGGAGCTACCTTGGCTAGAAA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTGGTAAAGGAGCTACCTTGGCTAGCAG
Common_primer CATCAGGGTACCACCAGAAACAAGACA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I
Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 A A
Population Linkage Group Position
AL2010 E_01 0.0
ALF2 AL01 0.0
LWA2010 LWA_01 0.0
LWAE2012 E_01 1.876
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain