+Marker Data: SOL7204

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_08
Marker Type SNP
Map Position 46.3
Annotation
Source Name SmFL01F06C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGGGCTTTTGTTTAGGGAGAGGAT
STS_primer_rev AGCTTCAATTGGGGACATGTAACG
amplicon_seq NGATGACTTCTTTGCTGATGGTATTATTAGCCAGTTGTTGTTGCTCGATGCTATTGATTCGACTAAAGACATTAAGCTCTTTATTAATTGCCCTGGTGGCTCTCTCAGGTATCTGTATTAAGTAATTTTACACTGGATAATGATTAGTTGAACATAGGATTAGGATTTTTATGTAAAAATTTATATATTAATTTTGAAGCTTAGCTTTAGTTGGTTTTGTGACACATTTGTCCTACAAGGCGAATTATTGAGTACCGGAATGAAATGAGCCCAATGATTCACATAGTCGAGCTCAGTTAATTTGGGATTTAGGTGTAGTGCTGTAGTATTAGCAGTAATTGTTGCCTGAAAAGGTGTTACTGTTTGGGCAGCGGGTGGTTGTTCAGGAGGTGCAAGGTACTTTTTGGTTTTATTTTTATTTATCTTAATTGAATATGCTGCTGAAGATTCATTTTATGAAGGTGTGTTCGGTATTGTGGAGATCAGACTGATGAAGCAGTTCTGTAGCTAGCATGATTATTTAGGAGCAAAGACATATGTCTCTTCATAATTTGATATGGTTGGATATTTCATACTGTTAATAAAATACAGACTCTTCTGTTGTTTATGTTGAATATATGCGGGCCATGTGTGCTGTTTAAGACATGTAACACACATGTATGATGATAAGTTATTATTTGATAGGTAAATGTGCTGATAAGTTATTTTCCTGCCGCAAAANCATCATGGCCAGACTTGAGATGATACAAGAACTCTGACTTTCATATAATGTAGTTGATTTTGAGTGATCATGAAGGAACTTGATGTTTTCAGGAACTTTTGACATGACCTATATGTAGAATACAGTGGTAGTGTGATAGATCCTAGAGTGAGACCATATTTAACCTGCATTCACTGAACAAGAAATTCTGATGCAAGACCTCAAGGTGTATCTTCATTGTGTTGTTCCGTTAAGACCACTAGATAATTTTAGGAATACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTCTTTAACGATAAAAGTCCTAATTCTTTTGGAANTTAGTTTCTGTTCTTTCCNAAACAGCTTTTCTGATGTCTGCAATATATGAAGCAGATAAGGATGAAGATAGCTCCTCTATATGACATGTAGCGGTGAAAATAAATTAGGTTCCCTTTGAGCGTGGCAATTAATATCTCAAGTTACTATCTCCATTGTGAATCTGCTATTTCTTTGTTCTTGTCATGGATTGCATAATGACCAATCGTTGTAATTTGTTTTCAATTAAGATACATATCAAATTTGATTGAAGGGTCTATGATCCTCTTTTGATAACCTTATTAGGACAGATGACAACTCTTGCTCTCTCATCTTAGGATCCATTTCATCTTAAGTCGATTCTCTTATGATTATTAATGTGCCTTTAATGTTCATGACCCACTCACTGAAAGGGTAGAATAGGCAGATTGTAATTTTTATACATTAATAATAAATAGGTTAAAAGAGTGTTACAAAGAAATTAAAACAAGGGAGGTAGCGCAAAATTTCAGTTGTGTCAAAATTTACATATTTCAGTTCACAAATTTCAGTTTTGTCAGCATTCTCATGTTTATCTTAGCTTGTCTCCACGCATTCATGTCAATTTGTTAGTAAAAGTGTTGAATCTTTTGTAGAAACACTTTCGCCTTCGCTCTTCTGATGTGCCTCTTTCTGTTTACCAGCGCAACAATGGCTATATACGACGTTGTGCAGTTGGTGAGGGCCGATGTATCCACAGTTGCACTTGGCATTTCAGCGTCCACAGCTTCAATTATCCTTGCTGGGGGCACCAAAGGAAAACGTTACGCTATGCCTAATACTCGAATTATGATACATCAACCACTTGGAGGTGCAAGCGGGCAAGCAATAGATGTAGAAATTCAAGCCCGAGAAATAATGCATAACAAGGACAATGTTATCAAAATCTATTCCAATTGCACTGGACGATCATAGAACAAGTGAGAAAGA
SNP_position 460
allele_1 A
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCTATGCTGCTGAAGATTCATTTTATGAT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTATGCTGCTGAAGATTCATTTTATGAA
Common_primer TCAGTCTGATCTCCACAATACCGAACA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 A A
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
AL2010 E_08 46.3
ALF2 AL08 58.8
LW2010 E_08 52.1
LWA2010 LWA_08 47.681
LWAE2012 E_08 48.484
LWF2_2022 E_08 57.6

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain