Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
TGGTTGCCTCCAAAGATGCTAAAT
|
STS_primer_rev |
CTCGCAATGAACTCTTGCATTTTC
|
amplicon_seq |
NNNNNNNNNNNNNNNGTTTGTGTTATTTCTTCCCAATTTATCTTTTGCTTTCGCTATATCTGCACTAATACCGAATTTACCTTGGATATTGGTACTGTTGAAGCTGGTCGGTGTTGATTTTAAGGATTTGAGNNTTCTACTGATTTGTATGTTGTGGTGTTACTGTTGATGAAGAAACAATATAACAATTCTTTTTAAGATATATTTGGATAATGGTACTGTTGAAGCTACGCGGTTTTGATTTCTAAGATTTAAGCTCTATTGCCTAGTCATACTATCTTGGAAAATTTGAGGTTGATTTTGGCTTGATGCTTAGCTAGTAAATTTTTCAAGGTGAGTTGGCTCAATGAATTTCTCCCTAGGGAGTATCTCAATTCTCATGTTCAATTAAACTAGTCCTGCTCTCCTATCCAAAAATAAAAATAAAAAAATACAACAACATTTCAGTGTAATTTAACGAGTGGGGTTAGGGGTGGATAGAGCATACGCGGACCTTACCCCTACCTCGTTTAGCATAAAGCATATCCAAACAGTTTGAAAAAGTTAANGAGTAGTAACAACAATGAAATAATGTGAAATGAAAAGAGGAACGAACAGTATGGCAAAAAAAACAATATGATATTTGAAGCACGATAAACACATGTGATACGCGAGAACAGAAAAATACAAGAATGGTGCTAATACTACTTGTAAGAAAGGAGGTCCAAGTACGACCACCAAGCCTATCCCATTGGAATTTTGAGAGAGTGCTCAACTACGAACTAACCATCTCAAATGCATTCCTCATCTTGTTCACAGCAAAGGCAACTCCTACCTTGTCCCAGAGCTTATTCCTGTTAAGCTAACTGATCCACGTCAATATCCTCATCTTGCAACTTTTATCTTCTGAACATGTGAATTCTTTGAGCTCAGTTTGAGATGGAGTTTCTGTGCTTTTCATTAANGGCTTTAATTGGTAGTAGCACAGATTACTGCAGATAGNTGATGGTCTTCCTGCAAANTTTCGCCGACCATTGTATCGTAAGTAGTACTCTGTATTGATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNATTAGANCTTGACCCGAGCCCTTGCTCTTGAGAAGGTAATGGCATCTGATCTNGTTATTCTTNACCAGCTAATTGTGCATCTTGTTCAGTTTTTTAGCTTATGATCTATTTCTAGTATCTATAATCGAATGACTGTAATAAAAGAGAACCCGTGCATGCATTGCTTGGTTTTTTTGATGCAAATAGCAATTAGAAAGTGTAATATTTTCTAATAGAACTCTTATTGCCCTCTTCTTAGTACCAACATCTCCAGTCAGCCTCCAATCCTCTCACCAAAAGGAAAATAATAGACCTTACAAAAGACCAGTTAAGAACCCACAGAATCAAGATAGCAAAGATTGAGATGGGGGAAAACAATTCAAGTACTTGCACCTTTTAAAAGTTGATCCTGAATCATATGTGAGAAGAGATTGAGATGGGGATAGGGAGAAATTTATTCAGGTGCTTGCACCTTTCAAAATCTAATCCTAAATCATGCATTAAGAATCTGATCATAGTCTAACATCAAGATTGATAAGTAATACTACATCAGTTCCAGTTTATGTAACACTTCCTTTTTTATTCTGCCTAAAATATTCTTATGTATTGGGAAAAGAATTAACTTTAAATTTCTCTGTGTCTCCTCGATGTCATGATTTATAGTCACAAAAATGTCATGGGATGTTAAGATCCCAAGCTCCATAAGTCTTTTTTCTACAGCTCTGTGTGCAGTCTTTAACTCTTTATGTCCCATAAAAACTAAACAAGAGAGTGCAAGGCTATGGCCAATTCCCAATGGTGGCCGTATTCTCAAATGAAGTAACTTGCCTAAAGTTGAATATCTGAGTTAGTCTCCAACTTAAGTGATCCACTTAAATCTTTTTAATATTTCTTTTAGCACAAATCCTGCAGCCATCTTGTACGTGACATGCAACTTAAAGTTCTGGTTGTACATGGATTATTTGCAATGTATGTAGTCTATTTCACTCGTGTTGGTGTGTTATTGTCATTTCCAGGAGAGGGCGCACGAGTATTATGA
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SNP_position |
1828
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allele_1 |
G
|
allele_2 |
T
|
ASP_primer_S |
GCGGGCCACCATTGGGAATTGGCCATAGA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCCACCATTGGGAATTGGCCATCGC
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Common_primer |
TGTGTGCAGTCTTTAACTCTTTATGTCCCA
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enzyme |
Stoffel frag.
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dye |
EvaGreen
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