+Marker Data: SOL7143

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 53.4
Annotation
Source Name SmFL01N05C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd TGGTTGCCTCCAAAGATGCTAAAT
STS_primer_rev CTCGCAATGAACTCTTGCATTTTC
amplicon_seq NNNNNNNNNNNNNNNGTTTGTGTTATTTCTTCCCAATTTATCTTTTGCTTTCGCTATATCTGCACTAATACCGAATTTACCTTGGATATTGGTACTGTTGAAGCTGGTCGGTGTTGATTTTAAGGATTTGAGNNTTCTACTGATTTGTATGTTGTGGTGTTACTGTTGATGAAGAAACAATATAACAATTCTTTTTAAGATATATTTGGATAATGGTACTGTTGAAGCTACGCGGTTTTGATTTCTAAGATTTAAGCTCTATTGCCTAGTCATACTATCTTGGAAAATTTGAGGTTGATTTTGGCTTGATGCTTAGCTAGTAAATTTTTCAAGGTGAGTTGGCTCAATGAATTTCTCCCTAGGGAGTATCTCAATTCTCATGTTCAATTAAACTAGTCCTGCTCTCCTATCCAAAAATAAAAATAAAAAAATACAACAACATTTCAGTGTAATTTAACGAGTGGGGTTAGGGGTGGATAGAGCATACGCGGACCTTACCCCTACCTCGTTTAGCATAAAGCATATCCAAACAGTTTGAAAAAGTTAANGAGTAGTAACAACAATGAAATAATGTGAAATGAAAAGAGGAACGAACAGTATGGCAAAAAAAACAATATGATATTTGAAGCACGATAAACACATGTGATACGCGAGAACAGAAAAATACAAGAATGGTGCTAATACTACTTGTAAGAAAGGAGGTCCAAGTACGACCACCAAGCCTATCCCATTGGAATTTTGAGAGAGTGCTCAACTACGAACTAACCATCTCAAATGCATTCCTCATCTTGTTCACAGCAAAGGCAACTCCTACCTTGTCCCAGAGCTTATTCCTGTTAAGCTAACTGATCCACGTCAATATCCTCATCTTGCAACTTTTATCTTCTGAACATGTGAATTCTTTGAGCTCAGTTTGAGATGGAGTTTCTGTGCTTTTCATTAANGGCTTTAATTGGTAGTAGCACAGATTACTGCAGATAGNTGATGGTCTTCCTGCAAANTTTCGCCGACCATTGTATCGTAAGTAGTACTCTGTATTGATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNATTAGANCTTGACCCGAGCCCTTGCTCTTGAGAAGGTAATGGCATCTGATCTNGTTATTCTTNACCAGCTAATTGTGCATCTTGTTCAGTTTTTTAGCTTATGATCTATTTCTAGTATCTATAATCGAATGACTGTAATAAAAGAGAACCCGTGCATGCATTGCTTGGTTTTTTTGATGCAAATAGCAATTAGAAAGTGTAATATTTTCTAATAGAACTCTTATTGCCCTCTTCTTAGTACCAACATCTCCAGTCAGCCTCCAATCCTCTCACCAAAAGGAAAATAATAGACCTTACAAAAGACCAGTTAAGAACCCACAGAATCAAGATAGCAAAGATTGAGATGGGGGAAAACAATTCAAGTACTTGCACCTTTTAAAAGTTGATCCTGAATCATATGTGAGAAGAGATTGAGATGGGGATAGGGAGAAATTTATTCAGGTGCTTGCACCTTTCAAAATCTAATCCTAAATCATGCATTAAGAATCTGATCATAGTCTAACATCAAGATTGATAAGTAATACTACATCAGTTCCAGTTTATGTAACACTTCCTTTTTTATTCTGCCTAAAATATTCTTATGTATTGGGAAAAGAATTAACTTTAAATTTCTCTGTGTCTCCTCGATGTCATGATTTATAGTCACAAAAATGTCATGGGATGTTAAGATCCCAAGCTCCATAAGTCTTTTTTCTACAGCTCTGTGTGCAGTCTTTAACTCTTTATGTCCCATAAAAACTAAACAAGAGAGTGCAAGGCTATGGCCAATTCCCAATGGTGGCCGTATTCTCAAATGAAGTAACTTGCCTAAAGTTGAATATCTGAGTTAGTCTCCAACTTAAGTGATCCACTTAAATCTTTTTAATATTTCTTTTAGCACAAATCCTGCAGCCATCTTGTACGTGACATGCAACTTAAAGTTCTGGTTGTACATGGATTATTTGCAATGTATGTAGTCTATTTCACTCGTGTTGGTGTGTTATTGTCATTTCCAGGAGAGGGCGCACGAGTATTATGA
SNP_position 1828
allele_1 G
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCCACCATTGGGAATTGGCCATAGA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCACCATTGGGAATTGGCCATCGC
Common_primer TGTGTGCAGTCTTTAACTCTTTATGTCCCA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 G G
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_01 53.4
LWA2010 LWA_01 44.69
LWAE2012 E_01 43.59

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain