+Marker Data: SOL5201

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_07
Marker Type SNP
Map Position 0.6
Annotation
Source Name ROL02E04A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ACTGGTTGACGTTTTCCGATCCAC
STS_primer_rev GCATGCTGATGAAGGTACTGAACA
amplicon_seq CGTAGCTCACATACCTGATCATAAGTCTGGCAAGGTTAATACTTGTGCTTTCTAAAGTACTAGTCAAAAGAATCTCTGGTCTGTCTGATACACATCAACACATGCATGAGCCAAATATTTAAATTAATGTGCATGCAACCACAGATATTATGGCCAAGAGACAAATAAGATGATAAAAGATAGCTCATTATTAAATTGATTATTTCCAGTTACGCCAGAATAACATAGTAAGTGATATAAAGAGTTCCTTTTTGTTTCATTTGATCATACTGGTACAGGCAGATAATGATTTGTGAGTGATTAGTTCATGGCGAACAAGCTGAAACTTGGTGAGAGCGTCACTGGCTGCTAAGTGAACTAAATTAATGTACTACCTACCAAGTATTATTCTTAAATGTTCTGTGGATGCAAGTAAATCTCATTGGTTGATATGATATATTATCATCAATTACATCTTCACCTTTGCCTGTAGCATCATCTTTTCCTTCAGCGTCATCAATTCATGTAATGTTCATTACATCATTCGGTGCAATGTTGAGCCTTATAATTGAACACATGGACTTGAAACATTTAATCGCTGTTGCACTTTAAATTTATTTTTTTACTTCAATTCCGGCTAGTGTTTGGGGATATTGTGCTAATTCCAGACTCCTTTATTCACACACAACTCAAAAACTAATAACCTTATGAAAGATACATTTGTGAAGGACAGGTCTATTTGTTAAGTTTTCTTGAAAATGTTCGCAGAGGCTTTACTTTCTATCCGACAGGCATGCGCTTAGCGAAGACAATGTGTGGTTCATCTAGATTTCTGGTTTCTATTATTTTCAATATTAATGTTTCAGATGATGCTAATGTGGACAGTTTAAAAATCTCAGTTTATTTCTTCACAATCTCTTTTTCTCCAGTTTAATGGAGTGGAAAGAAAGCAATTGGACCTATCGTGTCAATTAGAGGAGCAAGCGTTACCTGTTATAAGATAATGTCTGGCTTTCAATATAACAACCTCACGTCACTCAAAAAAATACTGTGATTCATGCACATACTTGGAAAAGTCAAATCTATTGAAACCTTTAGTTATAGTATGTCGTACATGTTTTTTCCAATGTGCTATGATTTCAACCTGTATCTTATTAGGCGGTTATAAAAAAAATCTGTATGTTATTTGGTTTGTGGATATGTGCTATGATTTCAATGTATCTTATTAAGCCGGTATAAAAGAATCTGTATGTTATTTGGTTTGTGGATTCCATATCAATATCTGAATCATCTTTTGAT
SNP_position 1173
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCTACATTGAAATCATAGCACATATCCAT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTACATTGAAATCATAGCACATATCCAC
Common_primer CCTGTATCTTATTAGGCGGTTATAAAAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_07 0.6
ALF2 AL07 11.3
LW2010 E_07 30.6
LWA2010 LWA_07 28.047
LWAE2012 E_07 39.782
LWF2_2022 E_07 32.3

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain