Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
ACTGGTTGACGTTTTCCGATCCAC
|
STS_primer_rev |
GCATGCTGATGAAGGTACTGAACA
|
amplicon_seq |
CGTAGCTCACATACCTGATCATAAGTCTGGCAAGGTTAATACTTGTGCTTTCTAAAGTACTAGTCAAAAGAATCTCTGGTCTGTCTGATACACATCAACACATGCATGAGCCAAATATTTAAATTAATGTGCATGCAACCACAGATATTATGGCCAAGAGACAAATAAGATGATAAAAGATAGCTCATTATTAAATTGATTATTTCCAGTTACGCCAGAATAACATAGTAAGTGATATAAAGAGTTCCTTTTTGTTTCATTTGATCATACTGGTACAGGCAGATAATGATTTGTGAGTGATTAGTTCATGGCGAACAAGCTGAAACTTGGTGAGAGCGTCACTGGCTGCTAAGTGAACTAAATTAATGTACTACCTACCAAGTATTATTCTTAAATGTTCTGTGGATGCAAGTAAATCTCATTGGTTGATATGATATATTATCATCAATTACATCTTCACCTTTGCCTGTAGCATCATCTTTTCCTTCAGCGTCATCAATTCATGTAATGTTCATTACATCATTCGGTGCAATGTTGAGCCTTATAATTGAACACATGGACTTGAAACATTTAATCGCTGTTGCACTTTAAATTTATTTTTTTACTTCAATTCCGGCTAGTGTTTGGGGATATTGTGCTAATTCCAGACTCCTTTATTCACACACAACTCAAAAACTAATAACCTTATGAAAGATACATTTGTGAAGGACAGGTCTATTTGTTAAGTTTTCTTGAAAATGTTCGCAGAGGCTTTACTTTCTATCCGACAGGCATGCGCTTAGCGAAGACAATGTGTGGTTCATCTAGATTTCTGGTTTCTATTATTTTCAATATTAATGTTTCAGATGATGCTAATGTGGACAGTTTAAAAATCTCAGTTTATTTCTTCACAATCTCTTTTTCTCCAGTTTAATGGAGTGGAAAGAAAGCAATTGGACCTATCGTGTCAATTAGAGGAGCAAGCGTTACCTGTTATAAGATAATGTCTGGCTTTCAATATAACAACCTCACGTCACTCAAAAAAATACTGTGATTCATGCACATACTTGGAAAAGTCAAATCTATTGAAACCTTTAGTTATAGTATGTCGTACATGTTTTTTCCAATGTGCTATGATTTCAACCTGTATCTTATTAGGCGGTTATAAAAAAAATCTGTATGTTATTTGGTTTGTGGATATGTGCTATGATTTCAATGTATCTTATTAAGCCGGTATAAAAGAATCTGTATGTTATTTGGTTTGTGGATTCCATATCAATATCTGAATCATCTTTTGAT
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SNP_position |
1173
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allele_1 |
G
|
allele_2 |
A
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ASP_primer_S |
GCGGGCTACATTGAAATCATAGCACATATCCAT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTACATTGAAATCATAGCACATATCCAC
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Common_primer |
CCTGTATCTTATTAGGCGGTTATAAAAA
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enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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