Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
AGAAGCAAAGAAGCAGTTGGGATG
|
STS_primer_rev |
GGCTGCTTAAGAGGAATTGCAGAC
|
amplicon_seq |
NNNNNGTNNNNCTTANCACAGACTGGANTTATTCANTCTTCTGGACNATTCGTCCTAGACCGTATGTTTCCCATGCTTCTCTGTTTTCCCCTTTTTTGTATCTTGTCTTTTGGGGGTCCTCATTTTTTGTCTGGTTTACTTTTATTTATTTGCAGGAGAGTTAGAGGTGGTAATGGTTGCAAAGTTGGAGATGACAATGGTAGCTTGTGAGTATTTTGCTTTTGTTGGCCATTTTCCACACTAAATGGGAGCAAGAAAATGGGGTCTAATCTCTATTCTTCTAGCTTAACTTGTTTGGGATTGAGATGGAGTTGTTGTTGTTCAAGAAAAAGGACTTCAATCTNTCTTTCTTTTAGCTAACTTGTTTTGGGATTGAGGTGCAGTTATTGTTTCAACAAAATGGACTTCAATCTCGTGGGGTTTTGTATAGTTGATCCAACTTGTTTGGAACTGAGATGTAGTTATTGTTNNNCAAAAAAATGGACTTCAATCTCTTNTTATAGTTTGTGTCAATAAAGAAAGAAGTGGGGTTTTGTATAGCTGACTCAACTTGTTTGNGATTGAGGTGTAGTTATTGTTGTTCAAGAAAATGGACTTCAATCTCAAGAGGGTTCATATAGCTGACCCTAACTTGTTTAGGATTGGGNTGTTGTTAGTGTTAAAGAAAGTGCTGCTAATGGGTTTTTGATACGAGTGTTATGTGAGGTAGTGGTAAGTTCTGTCTACATTCTACCCTCCCGACCCCATTTGTGGGATTCCACTGGGTATGTTGTTGTTGTGTCTATAAAAGGAAAAAGAAAGGGGAAAAAGATCTCTTTTTTAGCTTAANGATTGTAACTTTGGTTTCNTTTTGTGTTGATTTATGAAGGATGTTGATGTGGGAAGATGGGTTCTGCAGAGNGAGAGGAACAGATTGCTTGGANGAGATGGATGGTGAAGATCTTGTGAGAAAGCCTTCAGCAAANTGTCCATTCAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTTCTNGTTTTATTTACAAAGGAGNAGCCTTGACATAACTAGTTCGAGTTATGGAAACAACCTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCCNCTNNNNNNNNNNTGTGGTTTTGGCCCTTTTTCGGACCCCGCACGTAATGGGAGCTTACTGCACTGGGGTTGCCTTAATATAAAGACCTCTTGTGGTTCTGGCCCTTTTTCGGACCCCGCACGTAATGGGAGCTTACTGCACTGGGGTTGCCTTAATATAAAGAGAACAACAACAGTATAGCCANTTGAATCTCACAAGTGGGGTTTGGGGAGTGTAGAACGTACGCAGACTTTACNACTNGCTTACAAAAGTGGAGAGGCTGTTTCTGGGCCTTAATATAAAGAGAGAAAAGAAATAATCAATTTCTTATGGTTCTTGGCTTGTTTTGTATGCCATTATTTGCTTAGCTTTATGTGTGTGTGNNACTNTGTACTGTTTTTACCTTGCAGACTATTGCTGTGATTCAAGCTGGACATGGCCTACTGCAACTGGGATCCTGCAAGATTGTAAGACTCATTTTTCTATTTTCCCTTAAAAANTTAAGTCTTGTTTATTTTAATTGTCATCATTACTATAGTCTTTGTTTCTCCATGGACATGTAATTACTGTTCTAGAATGCAGAGAAAGAGTAGCAACCAAAACAGTTACTTATTCATTCACTTTTTCAAAAAATGATNATCTATGTTGCCCACTGTTTTTCGAAAAAAATGCCAATGGGTATGTGTCGGATGCTTCAAAAGTAGTGCATCTTTTGGAGTATGACATGNGGGGTGTGGCAACGTTTTTGGATAGTCCGAGCAACATAGTTGATCACTTGGTATGAATTNGGCNCTTTGATCTAATTTGGATAAGAATGTTGTGTTNTTCTCAGATACCGGAAGACCTCCATTTTGTGTTGAGAATGAGGCACACGTTTGAGTCTCTAGCCTATCAGTCTGGCTTCTATCTGTCACAGCTATTCTCAACA
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SNP_position |
266
|
allele_1 |
C
|
allele_2 |
T
|
ASP_primer_S |
GCGGGCACTAAATGGGAGCAAGAAAATGGGGTT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCACTAAATGGGAGCAAGAAAATGGGTTC
|
Common_primer |
CAACAACTCCATCTCAATCCCAAACAA
|
enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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