+Marker Data: SOL5115

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_01
Marker Type SNP
Map Position 54.3
Annotation
Source Name CPA02N12A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd AGTTGTGGCTGAAGTTCCATGGTT
STS_primer_rev TTCCAGTCACCCTCAATTGGTTTT
amplicon_seq ATCTCTGCTCCTTTTCTAGTTTTATGTAGTATGTGGCTATTCTTCTGCATTATTTTGTTGGCCACCCTAAAACCAAGAGAACACCAACTCTTCCCTTTGAACAATTCAACAAAAATAATATAATTGATAGTTCATTTATTTTGTAAAACCTCATTAACAAACTTCCATGAAAATGAATTTAGCAAGACATTGTGTTTCCTTGCAAATAAATGCTAAGCTGTAAAGCCTGCTTCTTATACTCTTTTAACAACGACATAACCAATGTAATTCCAAAGATGTGGTCTGGGAAGAGTAGTGCATACAAAGTCCCTCAGCAATATTTAAAACCTGCTTCTTATAGTCTTTTAACTGTTCCCAAAAAAGAACTCTCTTTTAAAAGTTAAATAATAAGATAATGAAACAATCATTTCTTGATCTTAGCAAGATCCATTTTTCTCTCTCTGAAAATGGGATCGAAAGAGTATATGTTGTTATTTGTTGTCATGTTGCTTCCCAGTTTTTGGATTTTATTATCATATTGCTAATGTTGTCTAGCACTTGGTGTTGACTAGGTTCGGAATAGAACAAGAGTACACCTTACTCCAGCCAAATGTAAAGTGGCCCTTAGGTTGGCCTGTTGGAGGCTACCCCGGACCTCAGGTAATTCTTTTGCACAAAAGAATGGTGCACAGCTCAAAAATCATCCAGCACAAGTGCAATCCTAATGATGCTGTAGAATCTGTTCAATTTAATTAACTGTTGGACAACTACTTATCTGTGTGGAAACTTTAGGGTCCTTACTACTGTGGTGCTGGAGCGGATAAGTCATTTGGCCGAGATATATCAGATGCTCACTACAAGGCTTGCCTGTATGCTGGAATTAACATTAGTGGTACTAACGGAGAGGTTATGCCAGGACAGGTACCATTTCCATCACATTTCTTTGTAATACAATAAAATCACTGTCACATATAGTATTCTAATTGGAGAATCAACTTAATTGGTTGTTTCAGTGGGAATTTCAAGTAGGTCCTAGTGTGGGGATTGAAGGTGGAGATCATATCTGGTGTGCTAGATACATCCTTGAGGTAATTTATCTTCCCAAGTCTACATAAACGTCTTTTGCAGGTAAGGGCATCTGGCAAGCATATAATCCTAAATCAACTAACAGTACTTGAATACCTCATCAACTCAGCTCTAGGTCCTCTTGGTGGGGATTAAGGAAATATATTTCTAGTGGCATGAAATGAGCGACTTATTACCTAAATTAGTTTCTTTGACTATTGCAGTGGTTTATGTCATTCTGTTTTTGAAGGTTGCTGAACTAAGAAATCAAATTATTGATTCTTTTTTATTCCTTGATCTAACAGAGAATTACAGAACAAGCAGGAGTGTTTTTCCTTT
SNP_position 260
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCCCAGACCACATCTTTGGAATTACATTA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCCAGACCACATCTTTGGAATTACATTG
Common_primer AATGCTAAGCTGTAAAGCCTGCTTCTT
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 C C
LS1934 C C
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
AL2010 E_01 54.3
ALF2 AL01 47.9
LW2010 E_01 51.1
LWA2010 LWA_01 45.618
LWAE2012 E_01 49.374
LWF2_2022 E_01 136.1

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain