+Marker Data: SOL5076

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 60.5
Annotation
Source Name SmFL40D19A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd TTGAGATCAAAAAGTGGAACGCTG
STS_primer_rev AGCCATCGACTAATGCAGTGAAAG
amplicon_seq GTAAAGGCTTGGGGTCGCTAATATTTTCTAGTTTATTATCGATCAACGGGTAAGAAATTAGTGTTTAGCTAACGTGATTTGTGAGATTGTTGATGCATATATCGTTGTAGACAACTGCGCTATTTGCAGGAACCATATCATGGACCTTTGTGAGTTTTTCGAAAATTTTGGTTTAGCTAAATTCGACACTTAATCCTGTATTTATTGGTCCGTGTTGTGAAATTGTTCTCAGGCATTGAATGTCAAGCTAATCAAGCTAGTGCTACTAGCGAGGAGTGCACTGTTGCCTGGGGTACGCAAATTTCATAAGTTTTTATGTATATCTGATTAATTGAGAATTTGATACTTGGTGATAGTGAGCTGAAATAATCTCACCTAGAAGTTGTTTGTTGATTCTGGAATTTCTTCTTAATGGGAATTTATAAGATAGTTGATTGCTTGCTAACAGACTTGGGTGTTGTCTTGCTTTAGTATTTGTGTATTTAACTTTCCATGCGCAAATTATCTCTTGCAGTTAATACATGTTGTTTCCACTTTGAGTTTTTGCAAATTTCCTGGTTCATTGAATTGATTATTTGTGAGTTTATATATGCTGAGTTTTGGTCTTCTGATTCCATACCAGTACGGTTTTGTTTATACATCACCTAGTGCCTTGTAAAGAACATATATTTATTCCATATTGCTAATCATTGGAAAGGGATAAACATATGTCATGGTAAAAAGATGCGTGTATTGTTTTTATGAA
SNP_position 214
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCACTTAATCCTGTATTTATTGGTCCGTA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCACTTAATCCTGTATTTATTGGTCCTTG
Common_primer AGCTTGACATTCAATGCCTGAGAACAA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_06 60.5
ALF2 AL06 65.7
LW2010 E_06 64.6
LWA2010 LWA_06 63.287
LWAE2012 E_06 68.904
LWF2_2022 E_06 79.2

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain