+Marker Data: SOL4058

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_05
Marker Type SNP
Map Position 9.4
Annotation
Source Name LS503F16A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd TCATGTCTTCTCCTGAGATTTGCC
STS_primer_rev TAGGTGGCTTTGCATTGTTTGATG
amplicon_seq NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGGCTGATATAACCAATGAAACTAGGAAACTGTCCACGTTGATATGTGCTCGCATATTTACCAGCAGATATGAAAGTTGCCCCCTGTTGCTCAATGAGGTCATGCACATGCTTAGTCGTGACTATCCTTGTGAATACCACATTTCTAGTTTATTTGGCTTTTGTTTGATATCGAGGTCTGACCCTTCTGTCAAAATACATTTGGCTAAGCTATTATGCTAAGTATGCTTAAAGCAGGAGCTGATGGTTGGAAAATAGAGAAAAAGAAGAGAGCAACATGGAGAACTGTTATTTCTTGGGCTATGTGGAAAGAACGAAATGAGAGATGCCTTAAGGATAAAAGTACAGTCATATTTTATTTCAAATGTTGATGTCTGCAGTTGTTAAAATCCTGATGTAAATTGTCTTTTGATATTGATCTAAACTCTACTACTGATGCCATTTTCTTACGTTTAGCATTTGTGATGGGCACTGGATTTAATTGTTTTGGAAATTTCTTGTACTTAGGTTATAGTATTACTTTGTTGTAGATTCTGTTCCTTTTCTCAGAATGCTTTGTCATTCTATCTTTAGTATTTTGTCTCTGTTTCTTCTTCTGTTATATTTTTCCCGGGGCTTTATGTTTTTTCTTGAACCGAGGGTCTATCGGAAACCATCTCTCTAACTCCCAATGTAGGGGTAAGGTATGTGTACACACTACCCTCCCCACACCCACTTGTTGGATTACACTGGGTATGATGTTGTTGTGTCCAAACAAATGTGTTATATTTCTTGATCATTATGTCTTATATGTTGATTAACTGCTTCCTTATCTTGTGATGCACGATGATTCTTATTTGGACAGCTACATCAGTACAATTGGTGTTGACTTTGTAAGCCAAAATTAATAGTAGTGAATTACATGTATANTACTTACAGTCGGTGAAGTTCCTAATTTATGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
SNP_position 105
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCAACCAATGAAACTAGGAAACTGTCCAT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCAACCAATGAAACTAGGAAACTGTCAAC
Common_primer GGGGCAACTTTCATATCTGCTGGTAAA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 C C
Nakate Shinkuro C C
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
AL2010 E_05 9.4
LWA2010 LWA_05 12.369
LWAE2012 E_05 12.383

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain