Typing_Method |
Tm-Shift
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Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
AGCTTTTTGTCCTCTTCATTGCCA
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STS_primer_rev |
TGACACGTTCAGCCAATGGAGTAA
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amplicon_seq |
TGGGGCTTTTTGTCTCTCATGCCATCCCTATTGCCATACTTGCTCATTACAAAAACTTTGGAGAGTAAGTTTTCTATTGTTTTCTTCATTTTTCAAAAAAAATAGTATCTGAGTGGATAAGAGATTGTTTCGGATAAAATTTCACCGTCTTCCAATAAAAAAAAAGGTTATTTCTTTTCACATGTTTAGGCCATTTTAAAAGGAGTCAGTTAGATAGACGTGAAGGCAAATGGTGGAGTCAGATTTTTTCAAAAACAAATTAAACAACACATAGGTAAAGACAATAAAGGAAAATATTCAACACCTATTATATACATTAAAATTAATTTAGTTGATGAAAATTTGGATGAATCCCTTTCACAAGCTTAGCTCTCCTATGAATTAAAGAGCGTGTTGAATACGTAATATAATCAAGTAAATAAAAATATATATTTTTTAATAGCTTTAAGTTATTTAGATAGAGATAATGGTTATGAAGTGAATGTGACATTAGCACAAAATATTTAAAAAAGAGTCTATTCAAATTAAGCTTGAGCAATATTTTATTATGCTTACTTTTTGTAGCAAGCAAGGTTTTCTTTTTCTTTTCCTTTTTTGAATAACTAAAAGATCCGTTGAATGATATTCATTCTTTAATTTTTTTTCTGATTTTTTGATTAATTTATTTCATAATACTGACATTTGTTTTTCAATTTTTCTTTTTTAATAATATCAGTCATGGGTTTTTGGTTTGAGTTTACTTGGACTTATCTG
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SNP_position |
280
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allele_1 |
G
|
allele_2 |
A
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ASP_primer_S |
GCGGGCTGTTGAATATTTTCCTTTATTGTT
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTGTTGAATATTTTCCTTTATTGTC
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Common_primer |
CAAAAACAAATTAAACAACACATAGGTA
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enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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