+Marker Data: SOL3147

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 38.7
Annotation
Source Name PLA02J05C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CAAAGGTCCAGAGACTTCGAGGAA
STS_primer_rev GTACTCCCAATCTTGCAAGGCATC
amplicon_seq CGGCATGATCCTCTGTTCACTTGGAGAATCACTGAAGAGGAGTTGAAGAAATATGATGGGTCTGATCCCGATAAGCCTTTGTTGATGGCTATTAAGGGTCAGATCTATGATGTTTCCCAGAGCAGGTATTCTTCTTTATCTGCAAGTATTTTAAGCTATTTTGCCTTCTGGATGTGTGGTAATTTGGCATTAGCTTCAGTTTCTGTTTCTTTTTGGTGTGATGCTTTTGGATTTCTGTTTAGATTCTTGGTCCCCTTCTTGATTGTTAATTTAGGTGTTTTCTCTTGATGATTATGGAAAATCCCAGAACCCAGTATTCACGCTCATGTGGCAAAGCATAAGATTTCTTGAAGAGTTTCCACATGTACTTTATGTTTATTTCAAGTACATTGAATTGCTTTTTGTTTGTTCTTTACTGAAAAAGACTTCTTTTGCTGAAGATTTGAAGTCTGGTATTTTACGCGCTGTTGCCTAATATTCTGGATTTGGCATGGAATTTGTGTAAATTAGGCTGATATGAGACCTGGCAATCAGTATCCACTCTCTTTTCTTGTGGTGCTTGGCTCGATTGGGAAGTCTTTGGGTGAAATGCTTACTTTTTCTGAATGTTTTCGAACGTCCATTAAGTGTGCTAGTCTCCTGGTTAGGTCGTAATTCTTGTCGAAGGATGAGAGTGTCTTAGCTTCAATTCCTCAAGATGGCAAAGCTGATCTGTGTGTAATCTTAGACAATTGGCTCAAGTTCTCCATGTTAAATTCGAACAGCTTTGCAAACATCACCGTTTGGATAGTAATCAACTTGTCTTAACAAATTGATTCATTCTTATTCTGTTGCGGTTTTGGGGAGACAGAAAACATGTTTAGTTTGTTGTTTATTTAGTTTTACTTACGTCTAGTAAAGTCCAGTTGGAGTGGATAAATTGCTTAAGTTGAACTTATGGCTCTTGGATTTGGAAGTGTTAAAATTTATCCTTGCAGCGGACGAATCATCAAATGAAGATTCCTTATAGAATTATGAGGTCAAATGGCTTTATATGTGGTTTTGTTAGTCTCATGTAACATTAAATTCATCCACAATTATATTGCCTGATAGATCAAATATCTTGATACGAGTCTGAATAAGTTCCTTATGAAAATTTTAGAACTAGTTTATCATAATCAACCATTAAGTTTTATGAAATGCTTGAGGACTTGTTAGTTTTTCTGTAGTTTTTCTACAGTAGGTGCTGACCCAACATCTTTGTATTTGAATGTGCCTCTTCCCGCAGAGGGTTCTATGGACCTGGGGGTCCTTATGCCTTGTTTGCTGGAAAGGATGCTAGTAGAGCTCTTGCCAAGCTGTCCTTTGAGGAAAAAGATCTCACAGGGGATTCTCTGGCATGTGCTG
SNP_position 735
allele_1 G
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCTTCGAATTTAACATGGAGAACTTGAGA
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTTCGAATTTAACATGGAGAACTTGCGC
Common_primer CAAGATGGCAAAGCTGATCTGTGTGTA
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 T T
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_06 38.7
ALF2 AL06 44.1
LW2010 E_06 36.2
LWA2010 LWA_06 37.262
LWAE2012 E_06 43.904
LWF2_2022 E_06 42.5
NAF2 NA06 38.9

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain