Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
GACTGTTATCTCCTGTGATTGGC
|
STS_primer_rev |
GTTCAACTTGCTCAATGCATTTCC
|
amplicon_seq |
NCATGTGACACATATAAAGTTGACATTGACAAGGTAAAAAAGGATTTTCCTGGTGTAATATCTCTTATTCCTTTCAGGAAACTTTATTAGTGTGCCATGGAACCTACTCTTCTGGGGTGCTGATACATGTCAATTGTCTCTTTCTTTTCTTTTTTCTTGGATAAGTTGAAAAAATTTGGTGGTCATATACAAAAGGAAGCTACATCAGACCACTAAGATGTATCATATACTGAAGGACAATATCGGATCGTCTACAATGTAGTGTAGTCATTTGTTTGCCAGATAACAACACATAACAGTGACTTGAGACTCCAGATTGTTGGTACTGTGACTATCCAGATCATCAGCACTGTTTCAATTGTTATCGACAACTAAATCTCTAACCAAAAGCATACTCATTTGCCTCTGCATCCCAACTGGCAAATGAATACCCAATATCCATGGATTCCTGTTTTCACTCGATTTTACTGCCTCTATGATCATAGAGATGCTGTTAACTGTTGTAGTTCCTACTCTCGTTTCAAACAAGCATAACCTCTTCTCTGTTATTTATAGAACCTAGAATCATAACTATCACCTTCTTATTCAGTAAGGTGCCTAGCTCCCCAGCAGTTTCAAGTTACTAAACAACTATTCCTATACCTTCATAACCCAATGAATGTCAATCTCTTAATTCCAACATGTTCCTCTCTCTCCTTTCAGATTTCTGTTTAGTGGCGGGTTTACTATTCTTCCTTTCTTGATATGCAACAAGTGTAACTAGTTGTATTTGGTCTCACTATAATTACTGGGTGGCCTGAAATATTTAGTTGATACCCATAAGCTAATCGTGAGACATTGACTGTCCGGATTCCAATTAATTCAGTGTTGCTTTACTTTGATACATATGTCACGTACAGTTACTCCATGTTTGAGTCTTTTGGTGAATCTTCTGTTATGCCTCATTTATTGAGAAAATACATTGGAATTGGATTAAAAAGTTATAAAAAAAACATTNATACCAGGACTTGGATGGGTTCATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACATTAGACAATGGGAAAAATCAACTGTTAAANCCAAACTGGAGGAACCCTTTTTCTGGACAAGTTAAAATGGAATCCTGAACTACTGGTTTTATTGGCAAAANCAGCTCTTTTTTGTTGGTGCNTAGGTTGCATTGAATTCCAGGATAATATTTGAAAGTTAGGGTGGCTTTAGTGACCCTCATAATGATCTGTAGCATATCTACGTCATTAAAGTTGTAGGCTCATAGTCAGCAGTAAGTCATATCTACCTGATCTTATTTGATGTCAGAAATCCCCCCTGAGATGGAACCTGTTATTGGCACTGTAGGATGTTTGTTGTTAATCCTAGGTTCTGCTTCTTGTTTATAATGCCAGTCAAACAATTGGCTCCAGGTCTTATTCTTGTGAATGTTGATTTTATTTTGATATGCTGGCGGGTTGAATTGCTGAAATAATGCTTGTCATTTTCTATATTAAAAACTTTCACCTAAAGGAAAAGAGAGTGTTCTTTGTTTGAATAATTGAGGTATCTTGGAGCTATACCTTTCCCTTGGATATGTTTATATGTTCTGGTTGGACATTTATGAGTTTATATGCCGGTAGCAATTGAAGTACTTTTAATACGTTTAGCTTGGACATTATGAGTTTGTCTGCAGATAATAATTGAAGTACTCTTAATATGTTTAATTTGGACATGAGTTTATCAGCTGCATATAGCAAGTGATGAATTTATTCTCACAATTTGACAAAAAGGAAGATTGAGAGAAAGACATCATGTCTAATTCCTTAAATTTGTGGGTTTGACTTTTGATGAAAGATGAAGTCTATGCTGTGTTCTAGTTCGAACACTTTTTGTTAATATCTTATGATGCTTAATTTTGTTAATTTTTAGCCATTAGTTTCAAAAATTCCTTAGGGATTAATTTCTGTAATTCCTTAGGACTCTCGGTGCATTTTGTTTCTCCAGTTTAGTGGTTGATCCACTTGCATTCAATTAATCTTATCCACTTGTATGCTGAGCATGTNNNNNNNNNNNNNNNN
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SNP_position |
856
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allele_1 |
A
|
allele_2 |
G
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ASP_primer_S |
GCGGGCGTGAGACATTGACTGTCCGGATTCCAA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCGTGAGACATTGACTGTCCGGATTCAAG
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Common_primer |
CGTGACATATGTATCAAAGTAAAGCAACA
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enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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