+Marker Data: SOL2079

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 37.6
Annotation
Source Name SmFL33G17A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd TCATGGCAAAATGCTCATGCTACT
STS_primer_rev CATGGCAAGATCGAAATGAGTACG
amplicon_seq GGGCGCGAGCTTCTGGTACTATGGGTACGTTACTCGAATTTTAACTTATGTATACTGACAGTATTGCATTATGGTCGGAGTAGACAATGCTGGTTGCAGGTTTGATGGAACTTAGTAGCTTTGGTTCAAATACTATATGCGCGTTCACCTAGATAGCAGAAATTCATGAACTTAAAATTCTGACTCCTCTCCGAATTATGTGCATGTTTTGACATGTTGTAAGGAGCCATTTAAGGTGTAAACTTTTTTAAGTTAATTTTTAAGATAAAGTTAAAGAGTATAGGAGTTAAAACTTTAATGATTTGTTGATATTTGTGTATGATAATGTGCTTAAAATGCTATGTTATGATGCAAAACAATAATGCATTTTACTATTTACTGTTTTTGTTTTTATTTACTCTCTTTGTTTTATGTCACATCTTTTTATTTCTTACAATGTTTAAGAAAAAAAGCAAAGATCTTTGAAACACATGGTCCAAAAATTATTCTTAGATATTTGTGTGATTATGAATAAGAGAATTTTAAAGGTAAATTATTTTTAATTTAAATAAAGTGATATTGTTTTTGGAATGAGCAAAAAAGAAAAAAGATAGACGGTACAGTGACTTTGGGTTTTTGTTCTGTTTTTTAAATGCAAATCTGTGTCTACTGTTGATATCATGTGAGTGTTGGAAACTAGAGTGAGAGATGTTGAATTTTGGTGCAGGCGGGGCGTGTGGATACGGTAACCTATACAGCCAAGGGTATGGAGTTAACAATGCAGCATTAAGCACAGCATTGTTCAACAATGGCCTAAGTTGTGGAGCTTGTTTTGAGATCAAATGTGATAATGAACCACAATGGTGTCACCCCGGAAGTCCTTCCATTTTTATTACTGCAACTAATTTTTGTCCTCCAAATTATGCATTACCAAATGATAATGGTGGTTGTTAACCT
SNP_position 66
allele_1 G
allele_2 A
ASP_primer_S GCGGGCCAGCATTGTCTACTCCGACCATAATGT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCAGCATTGTCTACTCCGACCATAATGC
Common_primer GGTACTATGGGTACGTTACTCGAATTT
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
WCGR112-8 G G

Population Linkage Group Position
AL2010 E_06 37.6
ALF2 AL06 35.4
LW2010 E_06 32.7
LWA2010 LWA_06 34.755
LWAE2012 E_06 41.206
LWF2_2022 E_06 34.6

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain