Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
AGGAGTGGATGCTGCCTGAGTTGT
|
STS_primer_rev |
GCACAACCCTTCCTTTCCTCTTG
|
amplicon_seq |
NNNNNTGATGATTAATTATNTATNGAGAAATTTTCAAAAATATACAAACTAATACAAAATATTGCACCATGTATCCCAATATTCAATATTATACAACACTATGAATGGGGAGAGTATTACACCTAATTATCAACCTTTGTATAGAAGTATATAATAGTGTATGAAAGGTGTATACACAATTATGGGCTAAACCAGGTAACAAAACCAAAATATGGGCTATGTGGTGTAAATATTTTTCTCCCGGTAGACATAGAACATAGAACTAATTTTCCAATGATTATATATTTGTGGATAACCTAATAATCCCTCCATTTCAAAATAAATAAATTGCTGGGGTATTGCACACCCTTTAAGAAAAGGATATTTAGACACTAATTAGACATTACTTTTCACTTTTACCCCTTTTAATTACTCCTTCAAAGTAATCAAAGTTTCTTGAACTCATAATTTGAACTACGAAAATGCCTCAATAATTCACTTATTTTGAAATGGAGGGAGTACAGTTTTGAAGAGAGATTTCTTTCGTCTATATGTATAAATGATAAGACATTATGATGTTGCAGAACATATGATGTGGATCAATAGGAACATTTTGTTGGAGTTGTGAAATCGTGCTTCTATAGCTTTCTATTTTGAATTTATCTGGATGAAATTTGGATTATATTGGGCTTAATCTACAGTGGGTCATGTCAGGAGGAATCAGATTGGATTACATTTCCTATTAATTGATTTTTTTTCGGTTTCTTCTCCTGCCTTGTTTTGCACTACACTCCCCTGAACACCTATTTTCAATAGGCGTTGTGAACTTCTTGAAGATTCAAGTTATTAGAGTTTTCATCTGATTTCTCTTCATAGTCTTCTATGAAGCATGTTTGGCACCTTAACTTGNAACAGTACTCCGTGTTGATTTTCTTGTTGATCTTGGTAGANCTAGTGCTGCTGGTTTTATATTCTTCGATAAAAACTGGAAAGATGTAAGTGTTCTCTCATTCATGACTTCACTTTCAANCTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNGATGTTGGNCATGGTCCATTNGAAAGTCATGACTGACTGCGGGCTTGACCATATTCAGTATAAGATTNGTGGATACAGCAGAGTTCCAGTATAACACCGAGTGTCAATCCCAAACTTGTAGGGCTTAGCTATATGAGTCTCAATCCTTGTCTTAATCTTTTTTTGAGCTGAGACTTATTTGCCTTAATCTTCTCTGAGTCTTTCTCAATTTTGGCCGTTTACATGAGTTGCAGGCTCTTATATTCTTACTGGCCCTCACAGTAAGGGCAGCAAACAGACCAGCAGACTATGATAGTGATGATGAGTACATAGGTGGTCCCAGACAACAAATCCGACAGCCACTGATCAACAATAGGGCACCAGCAAATCCTGCAACTGGTGTCCCTGTTACTGGTACCCTTGATAATCGTCCAAGTAGAAATGATGCATGGAGTACACGTATGAGGGAAAAGGTTTGCTCTCTGTTAATTGTTTTTTCTTGCATGTTGATGTGGATCATGATGTTTAACCTTCTCAGTTGACTGCTTGTTACCAACTGCACAATCTTCTTCAGTTACTTTGAACTCCTCATGATGGTTTTCCTGTGTTTATTTGTGGTATTCTATTTCTTTTGACCTTTTCNCGGGACTTCTAGATATGATTTTTCTTTTCATTCTCTTATATTTTCAAAATATCCCGTCACAGCAAGACCTTTTCTTTGCATCACAGGACTTTTTTTGACCATGAGAGGATTTTCACTTTGAATGTCCTTTTAAGTTTTTTAAGAACTTCCATGTGACAGCATACGGATTATTGTTCCAGTAGTTAGTGCCAGTAGATTGGTATGGTTTTTATCTCGTCTACGTGCTTGTAACTTATAAGTGCACTTAAATTTTTGCTAGTCTGGTGAAACCTCTTTCCTGTTTAGTACTGGCTATTAAATTTTTTTTTCTGACTTGAATTCTTGAATGGCTGTAACCCAGTATGGGCTCGATACATCGGAGTTTACTTACAACCCATCAGAGTCAAACAGNNNTN
|
SNP_position |
1608
|
allele_1 |
T
|
allele_2 |
A
|
ASP_primer_S |
GCGGGCGTTACCAACTGCACAATCTTCTTCAGA
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCGTTACCAACTGCACAATCTTCTTCAGT
|
Common_primer |
CAGGAAAACCATCATGAGGAGTTCAAA
|
enzyme |
Stoffel frag.
|
dye |
EvaGreen
|