+Marker Data: est_rot03g01

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_02
Marker Type indel
Map Position 0.6
Annotation
Source Name ROT03G01
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method indel
Marker_Class EST-misc
STS_primer_fwd ccgttgcaggatcttccaatttta
STS_primer_rev aacacagccatgaagttttcccat
amplicon_seq GGGGTTAAATAATTTTGTTTNACTAATTGCCGTTTTGTATTTGAGTACATGAATGGCGAAAAAGGCAAAACTTTTNGCTTCATTGTTTCTTTCCATGAGGACCATTTTGGTCTTTGCTATCCGGTAGAATGAAATGAAGAGTTCATGCTAATCAATCAACTATCTCTTAATTCCACATTTGTTGAGGTCCATCAAATCTGACAGATACGTCTTTTTCCTTTTGGGAGGATACTCCAAGTAGTCGGTACCTCTGCACTTGGGTGGTTGTTCCAAATCCAGAGGATTCTTCATAGTTTTGGCTATATTATGCTGGTTGTCAACCTGCCACCACCATCCTTCTTTATCTGCCCTTGGGACTGACTGGCCTGAGCAAACCGCACACATAAGTAGCCCAAAATCACTAGAAAAATTTATATATGTAATTAGAGGATATTGTACTTCACCATAAGCCTAAGGTCTTGAATTATTATGTCATTTATTAAACATGTTTTTTGGATTATTTTGAGCTTGAATGGTCATAATTGCAAGTTAATCCACATTGGATGCAAATTTTATGCTATGAGCAGAATATTATTGCGACTGTTGATGTTTATTAAATCAACTGCTACAAGTGTTTGAAGTAATGTCATAAGACCGAAATGTTCACCATTGAATTAATGTCATAAGATGGAAATGTTCTCGATTCCTAATAGAGTATGAGTTTCTTTATCATTTTCAATCCAATTTTACAGAAGATGTAGCTAGAGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAAAGTGTACCAAACAAGGTACTACTAGTACACCTGATTAATGCATGCATTATTTTTGCTAATACACTCTACCAAATGACCTCTTAGTCTCAATATTAGCCAGCTGACATTTGCTTTTAATCACTGAGAAATCTGCTGTTCAAGTGTCGAAACTTGGTGGAATAATGGGGCCTGCCTCTACCCTTCACTCAAATATTAGACTTGGCCCACCAACCAGACTTGAACTCGTGATGTGCTCTTACCTTACATCCCGTATTGTACTATCTTTACCAATGAACAAAGCTCTCGGAGCTTCAGCAGTGCTAATTTTTTGCAAGCAATGTCACATAATTGTGTCTTGTACTCTATTTGTTTCAAAATTATGGAACATTTTGGACCTTGAGCTAATTGTTCCAAAATTATGGATCTTGATATGCAAGATAATTTATAGTAGTGATGATGATGTATCTAGAAATTTTTTCAAAGTGTCTTATCTGTTAAACTAAATAATTGTCAAAACTATGATATTTTTACAGGAGCACATTCCCNAAGTCATGTTAAGTTGTTATTCAGAATGATGCCG
indel__position 460
Indel_primer_fwd CTGAGCAAACCGCACACATAAG
Indel_primer_rev GCATCCAATGTGGATTAACTTGC
Line allele-1 allele-2
AE-P03 wt wt
LS1934 DEL1 DEL1
Nakate Shinkuro wt wt
WCGR112-8 wt wt
Population Linkage Group Position
AL2010 E_02 0.6
LW2010 E_02 2.0
LWA2010 LWA_02 1.71
LWAE2012 E_02 2.396
LWF2_2022 E_02 13.2
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain