| typing_method |
Tm-Shift
|
| STS_primer_fwd |
gccaatctttgaccctttatgctg
|
| STS_primer_rev |
ccagtggtaaggctgagttcatgg
|
| amplicon_seq |
NTGGCGCTACTAAGAAAGTTGTTGNNNTCCTTAAGGGAAATTCTAATGTTGAGGGGGTTGTCGCTCTATCTCGAGATGATGATGGTTGTTTGCTTTTCTGCTGTTTTCTGCTTTAATTTGCTTCATATTTGTGAATTTGACTTGAAGATGTAATCTTGATTACTAATGGTGCATACCCTTTTAGCTGAATCTTTATTTGCTTGCATTTCTACCCCTTTATCTGAATCTTTATTACTAATGTTTCATAGCCTGTTATCTGATTTCCTTTTTCTGTTTGCATTTCCAACTTTTTGTGCTCTATTGTCTCATTTGAATTGCGAACTTAAGAGTCTAAATGGTAATGTTTATTAGGTATGTTTTATACCCTTTAAGCTGTCACTTCTCGCAAGCCCCTCGCTGTTGNTGCTGCTACTAAGAAAGCCTGTCCTTAAGGGCAATCGTTCAGGGTGTTGTCACTCTATCTTAAGATAATGATGGTTGTTTACTTTTCTGCTTTTTATGCTTTAGTTTGCTGTGTTTTTTTGGGGTCATATTGTGGATTCTGACTTAAAGATGTAATCTTTATTACTAATGTTTTATCTGAATCTTTATCTATTTTTGTTTCCANCTTTTTGTGCTCTAATTTGCTCTTCGATTGTCATATTTGTGATTGTGGCCTAAACATGTAAGCCTTTCCAAGTATNCTTCACTCCCTTTTATCCGAGTCTTTATCTGTTTGCATTTCCACCCTTTATGCTCTAATTTGCTTTTCTGTNATCAANTTTGTGGGTNGTGACCAAAANGATATAAGCCTTTNCGAAGCANTATTTCANCTCCCNTTTTATCTGAATCTTNATNNGTTNATTNGTCCGCCCTTTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNTATGCTTNGGCTTGTGTGCGTCGTGTGTAGCATGAATATGGTGACACTACAAATGGGTGTATGTCTACAGGTTAGCTTCTGATTTAGTTTGAACTTTCTGTTAATTGGAATGTTGGTCAATTGGAACTCCTCTAGTAATATACCAAAACATTTTTCGGAACTCTTCTAGTAGCTAGTTGGAAATGACGTTTTTACTTCTAGTTCCGCTGGTACTAGGTTGAAATTTGTTCCCTTTTGTTNCACTGCAGGAGCCCATTTCAATCCTAATAATTTGACACATGGAGCTCCTGGAGACGAAATCCGTCATGCGGGTGACCTGGGAAACATAACAGCCAATGCCGATGGTAATGTACTTGTTTTCTATTCTTTCATACCGCATTGACTCTATTTTTGTTTGTTTAGATGGATGATGACTTTCTGTATNCTTGCGTATGCTTACTGTATGCAGGCGTGGCTGAANCAACAATTATTGNTAATCAGGTTGTTACATCCACCTTGTCTGGTCATTCGATCTCNCTTTTTGTGCTCTATGTTTGTTACTGTTTTAAGTTTAGGATAATTTACTGACTCTACCTTTTGTGCACCAAGTAGATACCATTGACGGGTCCAAACTCAGTTGTTGGAAGAGCACTTGTAGTTCACGAGCTTGAGGATGACCTCGGAAAGGGTAAAAGTTCTACATTTCGTATATTGATCCATTTAATCTGTGGATTTGAAAATGTTACTTCTGCGAGTGTATCAAATCTATTTGCTACACTGCTTTACTTACCTTTACATTTTGGGAGGTCTTNGCGGTGCCTNCATGAGCTAATCGTCNN
|
| SNP_position |
1360
|
| allele_1 |
A
|
| allele_2 |
G
|
| ASP_primer_S |
GCGGGCCTTACTGTATGCAGGCGTGGCTGAAA
|
| ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCCTTACTGTATGCAGGCGTGGCTGAAG
|
| common_primer |
TCGAATGACCAGACAAGGTGGATGTA
|
| enzyme |
Stoffel frag.
|
| dye |
EvaGreen
|
