| typing_method |
Tm-Shift
|
| STS_primer_fwd |
GCGGAGAAACTGGCTAGGAAGAAA
|
| STS_primer_rev |
CCTTCGATTCACTTCCTTTTCCAA
|
| amplicon_seq |
NNTTACTGGCAAATGGAGGTACTGGAACATTCCATAATCCCCAAACTCTTCTTCTTTTGGGACTTAAATTTTATTGTAATTTTATTTCTGTTTCGAGTGTAGGGTGGAGAAGTTCCTTTTTCCGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTCTCTGTTGGTGCTGCTGTAAGTTCCATTTCTGTCTTATTATGAGCTAGTAATTGTAAGATTAGATACTGGCCTAATTCATACCCCCAAAAGAGCTAGCCGATGAGGAGAATATTGTTCAAGTCCGACCCATATCATTAACCATCAATATGGACTTTTTTATTAATAAATTAGTCGGCAAAAATATTGTAACGGTTGAAAAGTATTATTCCGTAATTACTGGAGAAACATTAATAAGTCGAAATTCAAATTACAAGTGGTTTAAAAGTTTGAAATTTTCAAAAATATTTTTGAATCATTCTAGAATAGTTAACAAGAGAGTAACTAGAAATAGCAGAGTTGGTTCTTCGGTGATCGATTTTAAAATGTCTGATGAAAATTGAATTGGAATTTCAGGTAGGAATGGAGTTTTGGGCTAGGTGGGCACATAAAGCGCTATGGCACGCCTCTTTATGGCACATGCACGAGGTTTGTGTGCTACTTATATGGNATAGTAATTAAATGCCTTATTTCATTCTTGATGAGAAAAGAATTACTTAAGATAATTTAGTACGTACTTTATATTAAGATTACTGTCGTTACATTAAATTGTTGCAGN
|
| SNP_position |
305
|
| allele_1 |
T
|
| allele_2 |
C
|
| ASP_primer_S |
GCGGGCTCATTAACCATCAATATGGACTTTTTT
|
| ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCTCATTAACCATCAATATGGACTTTTTC
|
| common_primer |
TTTCAACCGTTACAATATTTTTGCCGA
|
| enzyme |
Stoffel frag.
|
| dye |
EvaGreen
|
