+Marker Data: CSN201

Crop cucumber
Population CSRILs
Linkage Group 3
Marker Type SSR
Map Position 109.1
Annotation
Source Name 010520C
Source Type cucumber_genomic
Source Sequence ccgcgaattcactagtgattgtttagccttgtagcagaag ctcttctcttttcaacccttcattcttacaatgctgattt aattaaagattggttttaattgtacttaaaaaaagaagga ttgagtttaataattattgactttccaattcttaatgaac tgcattcattttatcaacttACACACACcCACACAaaata tttatacacaaaagGTGTGTtaaaagtaagttaaaatttt agtttagccctaagtttttaaTATATATATAcatacatAC ACACACatACACACACaTATATATATATATATAttaactt ctaagaagtgtaattctttgtcatgtttatatttttttta ccattaaaattgtcatctaatttcaaataaactggaatga cgaaccacaaaatataatagtaatgaaaaatcatttaaat tatgttttaaattttcctttacaattaaatagttaatcgg gaaattctaaaaaataacaaatttaacgaaatatttacaa tttatagtaaaatgctatatcctatTAATAATAAataaat attgatagttgacttctatcattaatataattcaaaactt ttttgctataatttgtagatattttaatttattttattat ttttaaaatgtccctaattaattatcttttatgaatcctt atgtacgtgattaattcatgaaaatttcttaaaacttcca accaaattcagtatgataaaatgtcacagatagttactta aactgttcatacatacatttcataggtctattttaatcta caatattacaatcacatgcaacaaaacttcaagcaattaa gacattttgattctccaggcttctgctacaaggctaa
Developer NIVTS
Document Fukino et al. 2008

motif (ta)5catacat(ac)4at(ac)4a(ta)8
PCR product (bp) 235
fwd primer CSN201-F
fwd primer seq. tcaacttACACACACcCACACAaaa
rev primer CSN201-R
rev primer seq. gtggttcgtcattccagtttatttg
fwd primer_for postlabel CSN201-FG
fwd primer seq._for postlabel gtttcaacttACACACACcCACACAaaa
rev primer_for post label CSN201-RG
rev primer seq._for post label tttgtggttcgtcattccagtttatttg

Line allele-1 allele-2
AR_5 - -
Harukei3 - -
Nou4 - -
PI 239 239
Santou 241 241
hardwickii 239 239

Population Linkage Group Position
CSRILs 3 109.1

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain