+Marker Data: CSN172

Crop cucumber
Population CSRILs
Linkage Group 5
Marker Type SSR
Map Position 84.0
Annotation
Source Name 010623C
Source Type cucumber_genomic
Source Sequence gccgcgaattcactagtgattgtttagccttgtagcagaa gccttaggttataaacccataaaacctatcatttgctata aacttctcaacccagatttgacctaccaaaaTATATATAT AgggttcagaatagtttTAATAATAAactataagATATAT tatttggtTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGttgggcttga gattgtaaaggaatagactggattcaattaatacgcacta ttacaaatttccttttaacgtcagtgtcacctttacttcc aggggcgtagaaaaatggactagcctaaaataatacaatc ataattgtgtaggcatattatatcactttttttttttggt taaattatgaaatagataatttttagcatcacaacaacgt gtaaaatattccacttctcattttcttagaatctacaaag attattatcaaattgagaTATATAaacatACACACaattt ggtaattatacttttaaattttcaaatttttaaatgctac tcgattagtaaACACACcggaacaagttaactggaattac actaacattaacatcctcttaatattagtcttactacttt taacaaatttaaatttacccactcaaagttaaataattgt tcaaaatttgtagtaaagatacctaaactctaaaatttag caacggaaagTATATAaattatgtaatttgaaacaaacat tatgccccaaaatagaaatttaacacagatgtttaattgt gttttatttagtttgTATATAgaagtattttttttttaaa ttaaccaatatttttgctcacgtcaaataaaattagataa aggaaaagaaactagattttgttatgtaaggcttctgcta caaggct
Developer NIVTS
Document Fukino et al. 2008
motif (ta)5gggttcagaatagttt(taa)3actataag(at)3tatttggt(tg)11
PCR product (bp) 201
fwd primer CSN172-F
fwd primer seq. tctcaacccagatttgacctacca
rev primer CSN172-R
rev primer seq. cccctggaagtaaaggtgacactg
fwd primer_for postlabel CSN172-FA
fwd primer seq._for postlabel atttctcaacccagatttgacctacca
rev primer_for post label CSN172-RA
rev primer seq._for post label tttcccctggaagtaaaggtgacactg
Line allele-1 allele-2
AR_5 216 216
Harukei3 216 216
Nou4 216 216
PI 198 198
Santou 206 206
hardwickii 206 206
Population Linkage Group Position
CSRILs 5 84.0
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain