+Marker Data: CSN069

Crop cucumber
Population CSRILs
Linkage Group 3
Marker Type SSR
Map Position 86.0
Annotation
Source Name 030260C
Source Type cucumber_genomic
Source Sequence TATAGAATACTCAAGCTATGCATCCAACGCGTTGGGAGCT CTCCCATATGGTCGACCAAGCAAGCGGCCGCGAATTCACT AGTGATTGTTTAGCCTTGTAGCAGAAGCATGGATTTCCAT TTCGGATTCTCTTCAAATTCCAAGGGCTTTTTTGAAATTT TAGTCATTAATTACGCTTTCCGCCACTCCCTTACTTTCTC CCTTTATAATATATACACATATGGAATTTCTTTTTAATTT CCACCAAAGTTTTGAGTAATTTTACACATTTTGCCACTTC TCTCTCTAATAAATATTTTTGTTTTTTTCTTTCGAATATT TCCAGCTGGATTTATAAAAGTCATTAATATGTCCCTTCCA TTTAATCTTACATATATATATACACACACACACACCCCCA AACGAATACAGACTTTATTTCATTTGATGTATGCTTATTT ATACCCAAAAAGAAAAATTAAATTAAATACAATTTAAGAT AATATaAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGgtct tgattaattttcttgttaagcttttcacttaatccgaaat taaatcattatgtatttggactaaacTATATAttttttat ttaagtttttatccaaagttaaaggctattaaaagacaaa taaattttgaagatgggttcataccttataattttattaa tctaaagtggtcccacagctcataatactttcaaATATAT tgaaattcaaattaagggctttaactttctttaaaaataa taaaagaaaacaaagaaaaatgaaggcaagaaagctacat tttatccgtattaaaattgaatccacttcaattaagttaa agactctattacgtttaagaaacaaATATATtcgaaaact attctaatttttggttctcaaaatttaaggaaggtttcta ataattggaaaaagtatgcTATATAaaggaagtatactaa agttgatattgagatatttgtaatgtaatgagtaattgat atttgaaagatggttaaccgaaattggcggtgggggaata cgtagaattatgggataatttaggggttggttttagtttt agaattaaATATATttttcctttcaaagaaaagtcttaag agaaggacacgtgtctttgcagatttcgtgtgcttctgct acaaggctaaa
Developer NIVTS
Document Fukino et al. 2008
motif (ag)15
PCR product (bp) 108
fwd primer CSN069-F
fwd primer seq. GATGTATGCTTATTTATACCCAA
rev primer CSN069-R
rev primer seq. agaaaattaatcaagacCTCTC
fwd primer_for postlabel CSN069-FC
fwd primer seq._for postlabel cttGATGTATGCTTATTTATACCCAA
rev primer_for post label CSN069-RC
rev primer seq._for post label tttagaaaattaatcaagacCTCTC
Line allele-1 allele-2
AR_5 - -
Harukei3 - -
Nou4 - -
PI 104 104
Santou 110 110
hardwickii 101 101
Population Linkage Group Position
CSRILs 3 86.0
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain