+Marker Data: SOL8697

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_10
Marker Type SNP
Map Position 28.1
Annotation
Source Name SmFL38C24C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method DirectSeq
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd ttaatggtcatggaatgggaaagg
STS_primer_rev tgaagtctgtttcaacccatggaa
amplicon_seq GCATTCCCGCTGATGACAGAGTGCCTGATATGGAGAAAAGGAACCTCATGAATTTGCTTCTATTGGGTGCTCTTGCTCTTCCAACTGGTGGAATGCTTGTACCTTATGCTACTTTCTTTGCACCTCCTGGGTTAGTTCTTACTTCCTTTGCTCAAAAATTAGTTTCATTGTTTTGTTTTTGTTGAAATTAACTTGAAGTTTTACATTATTAGGACAAGTTATTCGTGTATTAATTTCTGTGTAAGTTCGACAACATTTTATAGCTAGTTAGTGAAATAGTGATTTTTTAGTAGTGGACAAGCTTTAATTGTGAGATAGCACACAATTTGTGGGCACCGGATATGTTGTTGTTATTGTTGATAATGAGTGACAATGAGATTTGAATTCAGGTCTCTTTTGATATCATATTGAAGTATGTTACCATGAGCGCATTCTTATTTGTTTAATTGTATCTTGAATATGTTGAAATATTGACTCGTTGAAATCAATCATTCTCATACTAAATCATTATCAGTCGAATCACTTTTTCAAAAAATATGAAACTCATGTATTACTAGAATTAGGTCTTATATTAGGGGGTCCAAGAGGAGCGGTATTATTTACCTAATCCAATTGATGCCACCTTCTCCTTGGGATTGTATACCATTAGTATGTTGTTATTCTATATTCTATCTGACTCCTATTTTGTGnnnnnCTTGGATCTAAACTTTATGGGTTCGACTAAGGGTGTCAAAAATGAACCCAAAGGATAGCTAACCCGCTTAAACTTTTATGGGTTGGGCTCAAGATAATTTTAGTTGGGTTTAATCTCAACCTGTTCAAGGGTCCAATCCATATCAAAAGAATCTTCAATTGACCGCAATTTAATCTCCAATTTTAACTCGTTTTAAGACTCTTTACTTGCATTGATATAATGTATGTTTTCTATCTATTTTATATTTTCTATCAATTATATATCAATTTGTAACTTTTATTTTTATTTTTTGAGTTGAAATGCAAATTGTGATTATAAAAAATAAATAATAGTATGTTAGAATTATTGAGATTGAGTGGTTTGGGTTGACCGGGGGATCATAATCCAACCCAATTTCTATTTCAACCTATTTTAACATTTTCAATTTCAATCCAACCCGCCCGTTTGACATCCTAGGTTCAACCTTTAAAAAGGTTTTTAGCATTGCACTTGTATTTTTATTAAAGTTATGCGTTCACATCCACCAATTCATGCAATTTTCATGGATCTTTATACATAAATTTATTTTTCGTCTCAAAAGTACTAGATTCAGATGGACTCGACAATAACACTAACATTGTGTTTTGTTGTTGGCACAGTCCTTGGCATTGGCTCATG
SNP_position 340
allele_1 A
allele_2 G
Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 G G
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 G G
Population Linkage Group Position
AL2010 E_10 28.1
ALF2 AL10 22.3
LWA2010 LWA_10 26.511
LWAE2012 E_10 30.806
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain