+Marker Data: SOL8578

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_10
Marker Type SNP
Map Position 39.3
Annotation
Source Name SEP08D04C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method DirectSeq
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GAGATCCCAGAAACACCGACTGA
STS_primer_rev AGCTTCATTTCCAAGTGCAATGGT
amplicon_seq NNNTACCATATGCGGGGCTGGCAGCTCATATCTCCGTCATGGTTTTGCGATTCACATGTAATTGGTATTTCAAACTTGCTCTAGTATTATCATCACTATGTCCTTCTGATGGAGTTTTGGATATAGTTATTACTTTCTTGTTTATGTTTTATTCTTGTTAAATTATAATTAGGACTGAGATTTGCTATGCTCTGGATATAAGCATTGACTTCAAATTCTGTTGTTATTTGCTTTCAAGCCGGGAGTATATTGTATCAGATCGAGTGATAACGCGTGCCTTGTTGAAAATGCAGGTATACTGCTAACAAGTCAATGGAGAACTCTGCCTTCTGCAATGCTGATGGTGACTTTCTGATTGTTCCTCAAAAAGGAAGTAAGTGTAGACAACTCAGGTGGCATCCGTCTTTTCGTATTCAGCGTCAAATATTTTGACATGTGGTTTGAAACTCTTTCTTTCTCTCTGTTTGTAATGTAGGGCTGTGGATTACTACTGAATGCGGAAAGTTGCAAGTTTGTCCTGGTGAAGTAGTCATTTTGCCTCAAGGATTTCGGTTTGCTGTTGACCTTCCAGATGGACCGTCACGTGGTTATGTCGCTGAAATTTTTGGAACTCATCTTCAACTTCCTGAACTGGGGTCAATAGGTGCTTCATGAAGTGCAAGATAAATTTCTATTTTGGACGGCTGATATTATTTACTGATGATATGCATTTGAATATGTATTTAGGTGCAAATGGTCTGGCTGCTCCGAGGGATTTTCTTGTTCCTGTTGCCTGGTATGAAGATGGCTCCCGTCCAGGTTACACTATTGTGCAGAAGTATGGCGGTGAACTCTTTACCGCGAAGCANGACTTCTCTCCTTTTAATGTAGTTGCTTGGCATGGCAATTACGTTCCTTATAANGCGGGTATTNCTCTATATTTCAGTCTCTCATAANTATGGTTGCCTTGTTCACATTTTATCCAATTTACTTTGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGNNNACCNNAGCGATCCTTNCAATAAACACAGGTGGGTTAAGTTTGAATATTAGCAATGTNCTGTCATCTATTTATNGTCATTGATCTGTGTGAATTTTGTTCTTAAATNGTCGGTGTCGCTAGTTACATTTNCTCTCGTTTCTTAAATTCAATGCAGTTTTGACAGCACCCACAGATAAACGTGGTGTGGCGTTGCTTGACTTTGTCATTTTTCCTCCCCGGTGGTTGGTCGCTGAACACACCTTCCGTCCTCCATATTATCATCGGAATTGTATGAGCGAATTTATGGGTCTAATCTACGGGGGATATGAGGTTGTTTATCTCGCTCTTACATGAAGTCATGCTCAATTCTGGGGTTATTTCATACATTTTTAATGCGGTTAAGCTGGTTTCAGGCAAAAGCTGATGGTTTTCACCCTGGCGGGGCAAGCCTTCATAGCTGCATGACTCCTCATGGTCCTGATACCAAAACATATGAGGTATAAGTCCTGCTCTATTCCTCCCTTCTCTATATATGGCCATGCTTCTTTTCCCTTCCCGCCTATGCGACTTTTTCTGTAAGGAAATTTGTGCCTTTTAGTTCCGCAAACGTCAACAAATTCTGATTCCTGATAGAGCACATTCAACCTTAAGGGGTCATTTGGTTGGCAACATGTTATTCCAGAATAATTAATCCCCGGATAAGTTAGCCTAGGATAAGTTATCCCACCATATATATGGGGTAGCTTATCCCATCACTAAGGCAAAAATGGTGCGAGAAATAGTCCAAANATTACCTTATACCTCCAACCAAACATGGGAAAATAATCCTANATTTTATCCCGGGATTATTATAACTTATACCTCACACTAAAAAACCCCTAAGTGATATGTGCCCTTTTGATCCTTCCACTTGCTTATCTTCACAAATTTTACAATTTCAAGTGCTAAACTATTTAACTGTTGATATGTTATCGTAAATTTGTATTGTTGCTTCACATTTGAGGGTAAAATCTAAAANNN
SNP_position 1345
allele_1 G
allele_2 A
Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 A A
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 G G
Population Linkage Group Position
AL2010 E_10 39.3
LW2010 E_10 37.4
LWA2010 LWA_10 37.977
LWAE2012 E_10 42.828
LWF2_2022 E_10 37.4
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain