+Marker Data: SOL8157

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_02
Marker Type SNP
Map Position 62.4
Annotation
Source Name PER07O03C
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method CAPS
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd aatcaagccacacttcaaggatgc
STS_primer_rev ttggcatggctttcacctcatatt
amplicon_seq CTTAATTTTTGTTTCAATGTAAGTGATGTTTTCTATTTCTAGTATGTGTACAAATTCATTTTTCCCTTCTATGTATTTGTAGATTGTGGCACACTTTACGGCTGTTTGGTGTATTCCCTCTGTGGCTATGAACCCCTTTATGGAGGAGTTGGCTTCGATGTACCAAAATATGTATTTTCTCACAATTGATGTGGATGAGGTCAAGGTAAGGCTTTTTAGCCCTTTTGGTGTAAAACACAACTATATAGGCTAAAAGATGAGAAAAAAAGATGCAGAAATAATTTCCTGTGCTAAACATACTTCTAAGGGCTGGTCTAGTCATGGAAGGTTAATCAGTTGCCTGTGGCATCCCTTTGAGGTATATAAGCTAGTTAATGGTAGCATATATTACTATATTGTATCATTGTGTTTTGGCCGGGTTTTAAAGTTGAAAGCGCACTTACCGACTTGTTTACCTAGGACTTGAGTCATAGCCGAGTGTATGCTAGATGTGGAGTCAGTTTGCAGGACTTAAGCATGTGACATGTCAAAACTTTGGTGCAGATCTGGATATTTTATTTGTCTTGATCATGTCTGATTTGTATCAAGAAATCACAGCAGATACTAGTGCAAATGTTTATTTTCAGGAAGTGCTAGAGCTTATGTTCTCTTGATCAGAGATCACATCAATGACGAGAAGGATAGAGCTGGAAACTTTACAGGAGGGAGGATTnnnnnATAGATATGGAATCTGCATATATTTGGTCTAGGGAAAGGCTTCACCTTTTATCAATCACTTCAGATACTTTCTAGCATTGCTTAAGATATGTTAGATTAAGACTACAAGATTCCCATTTGTGGAGTGAAATTGATCATTATCTAACCGAATTCTTCTGCAGAGATTCCTGATCTTTTGGCTATTATTTTGGATGGAGACCCCAATTAATTTAAGTAGGTTGATGCGCAATTTTGGTATTGCAAAAAAGAATAATTTTAGTTCCAGTTGGTGTGAAGTTGTATTCTAGCAAACCAAATGCATTTGTCATTTTGACATTAGTCATTGAGAAGCTACTAATGAATTTGTTAAGATTTTATTTTGCAACCTAGTTTCTCTGTTCTGTTTTTTTAACAATGCTCCTTTGCTGTCTATTTGATCGTTGAAAATCCAATTGCACATGTTTCCGCAGACAGATGAGTTTCTTATGTGATAGATATAGATGGCTAATACTATAATTATAGGTTACCACTTAGTTTTACAGCCTTGAATATTTGATTGTATAATATTCAGTCCCTTATTGAGATTCAAGTAGCAGTTCCAGTTCTGATATCGATTAATATAAAAGGTGCATGAGGAATCCGAGATGCATCATATTGTCGAGGCTGTTTTCCACTTAATATACACATTATATAG
SNP_position 157
allele_1 G
allele_2 T
CAPS_primer_fwd TGGCACACTTTACGGCTGTT
CAPS_primer_rev TACCTCAAAGGGATGCCACA
CAPS_enzyme TaqI
Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 T T
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 G G
Population Linkage Group Position
AL2010 E_02 62.4
LW2010 E_02 45.6
LWA2010 LWA_02 47.435
LWAE2012 E_02 48.096
LWF2_2022 E_02 70.3
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain