+Marker Data: SOL8272

Crop eggplant
Population AL2010
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 9.9
Annotation
Source Name ROL03L22F
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method CAPS
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd gcgaaagatccttatttcatgcga
STS_primer_rev ttcagcagcaaacaggagaaactg
amplicon_seq TTGCTTGACGTTACACAACAATGAAGGGAATTACTTGGCTCATACTCAAGGAAAACGGCATCAGACTAATTTAGCTAAAAGAGCTGCTCGTGAAGCTAAGGATGCTCCGGCTCAACCTCAGCCTCATAAGCGCAAAGTCACTCTCAAAAGAAACGGTATGATTTGATACAGAAATCGGCTTTTTCGAAGTTTTTATGCAGTTTGTAGGTTGATGAGTTGTGTTGTTTGAATTTCGGAGTTAATTTTGGTGATAGGTAAGAGACGTTAGTGTTATTATTACTTCGTTGAGTTAGGGATAGGATTTAGGATTTGTAAACAGTATGATTCAACACAAAATCAGCCTTTTTCAATTTTCTATACAGTTTGAAGGGTTGATAAGTTGTGTTACTTGAATTTGGGACTTAATTTTAGTGATAGATAAAGAGATCTTAGTGTCATTATTACTTTGCTGAATTAGAGATAGGATTTAGGGTTTAACAGTATCAGTTGTTTATAACCTTAGCGGCAATTCTGCATTGTACGCATGTGGCCTAGCAATCAATGAAGTAGGAATGATCAGTGGAGACCAGGGTTCACATTCAGTAAGGCAAAGTTTATTGCCATTTGCATAAGGCTTGAGCTTTAATGGTCAAAGCTTAGCTACCCTATACATGTGCTCATGAAAGGTAGCAGGATAACATTTGGTTTGTAACCATCCAATCACCCTCATGTGTCCAGCACACATATGCCACCTGTACGGTTGATGCCCAATTGCTTGTTTTTGGCACAGTGATAGACTTGACATACATGCCTnnnnnGTTACACAGTTAGGTAGCTCAACTTTGGCATGTTGCCTTGCCTCAAAAATCAAAATATGAAAAATAAAAACCAATGATCATGTGTTCAAAATCTTGGAGGCTAGTGTTACAACAAAGAGATCAAGTCCTATGTTGTGGATGCAGAGGATGGATTCTTGTTTGTTGTATGAACCATGAAGGTGAAACAGTAAACTAAGGCAGCATAAGGACTTCATCCAAATTATGTGTAATTTTAAAATGCCATTATACAAGAAAATGGTTAAAATAGTTTGACTAACTATAGGTTCCTTAATAGCAGTTGGTCTAACTTCAGGGTTTACTTCGATTATTTCCTGCTACTATAATGCACCAACCTCTGGTAACATAATCAAAATGTGTGTCCTGATAGAAGGTAAAAGTGCTGATTGCAAGAAATGCACTTTTGCCGTATTACAATGCTAGACAAGTATAAGAGGAGTTTTATCTAGTCAAGTTTACTTCCATGCCTTTGGTTTTCCCCTTCTCCTTACTTTATTGAAGTGCGGCACTTGTTAATAGTTTCACGATGGTGGTGAGTGTTGCAGATTGAATATCCTGAAATTGAAGACAACACAAAGCCAAGGCACCGATTTATGTCCTCATTCGAGCAGGTTTGTATGTCCAAAATTCTTTTCTTGAGTGGTTCCACTGTATTTAACAGAGTGCTACTCAAGTGTCCCTTTTCTGGATTTTGCATGTGGGAAGAATAAATGATCTTATATCTTTCCAAGATTAACTAGTTATTAATCTTATATCTCTCTTTTTTTT
SNP_position 173
allele_1 A
allele_2 G
CAPS_primer_fwd AAGAGCTGCTCGTGAAGCTAAGGA
CAPS_primer_rev CATAAAAACTTCGAAAAAGCCGAT
CAPS_enzyme MboI

Line allele-1 allele-2
AE-P03 A A
LS1934 G G
Nakate Shinkuro A A
WCGR112-8 A A

Population Linkage Group Position
AL2010 E_09 9.9
ALF2 AL09 8.8
LW2010 E_09 19.4
LWA2010 LWA_09 20.261
LWAE2012 E_09 7.503
LWF2_2022 E_09 19.5

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain