+Marker Data: es715TC3309S

Crop pepper
Population KL-DH
Linkage Group KL04
Marker Type SSR
Map Position 127.59
Annotation
Source Name TC3309
Source Type misc cDNA
Source Sequence atttgcttactcttttgagttttctcctcctttttagttt aaagatccaatcttttcaccatttctccccattttacccc ccaacttctccctttttactctttctggtcaaaatccatt ctgggttttaagtctttttgcttgaaacccattcaagatc caaccttttgtgttctcttattaactaaaatccattaaag atccaatttttaccccttattctgcccattttaccctcta aaatttctgggtttttagtttttttagctaaaacccatta aagatccaaactcttttttatacaaatttgcgaaccaaac aaaaattaatgcTATATAgaaatttattcatgttcaagat tcatgtctccagttcttagtgaagcccttcgttctggtTA TATAattagttcttcactgagacgccgaacccatcttgtt caatctttttcagtttgctttcctttactggttttactgt ttctcagaattataaaaaatcttaatctatagttcttttt agtagtactactttattatatccacctaccatacccttct ttttattttgcgtacaTATATATAcctgcatagcgacagc tttgacaaaccctgatggctacttcgagtggaaattcatc tcaaattcagactaattcaggttccgaagaggtgttaatg gtggttgatgagaggaagagaaagagaatgcaatcgaatc gcgaatcagcaaggagatcaagaatgagaaaacaaaagca tcttgatgatttaaatggtcaagtaacacaactgaagaat gaaaacagtaacatcctcaacagcatccaatgttacaaca caacagtattctaatgttgaggctgagaattctgtcttaa cagcacaaatgatggagttaactcaaaggttgcaacctct taatgaaatccttaattacatcgncaacaaTAATAATAAc ancaccatTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA ATAAtgggggttttgagattaataattatcatcaagatga ttttcagattaatccatggaacatgatgtatgttaatcag ccaattatggcttctgctgatatgctttatcagtattagt tttttttttttttttaatTGTTGTTGTTGTtctcatggtg gtgtaatgttcaattaatGGTGGTGGTGGTttatttttat tagtatctttattattgttatttggttatgtggttattat aattaagaagtattaccagtaagatttgagttattagaag taatattagaatgagtttaatgtgaaaacagtcaaagagg atgagcttgactgatatttgggcatgtaaaaaaggggtca tgtgttgATATATtattggaatgaatggttgtcaatgaat tgtgttttttctaaaaaaaaaaaaaaaaaataaaaatgaa gccctctgtagtttccattctttcttttTCTCTCttcttT CTCTCccaattcttgctaTCTCTCTCcgaaaggtgcaatc cagatgacaaaaaagccctcttagaaataaaaagaggcct aggcaatccctatgacttgatcacgtgggatcccaaaact gattgttgtactgattgggttaaagctacTCTCTCatgtg atgaaaaaactaatcgtgttactgtcctaaacctcttcca aattaatagccccggtcaccTCTCTCctgccgttggagac ctttcgtacctccaaacgttagacatcaacaatgtccgaa aTCTCTCcggtcctattccacccacaattgctaagctctt gaagctcacattcttgagaattagtcaaacaaacatttca gggcccgtgcctgaatttcttactcatttgaaaaacataa cgtacatcaacctgtcgtacaataatctcgttggtacaat cccaccCTCTCTttctcaacttccaaacttggagttcctg cgtttagataggaacaaagttactggaacaattccagaaT CTCTCagcaacctagctccaaaactcacgtatctttacct tggacacaaccaactaacaggcattgtgccaaattctttt gctggttggagcttcgacacaattgacttgtcaaggaaca tgcttgaaggggatatttcattcttatttggcaaagataa gacaacgtttgaaatgctattggatcataataagttcaac ttcgacttctcaaagctgacatttgggaatagattagcga ggttggatttgaatcataacaagatttatgggagccttcc aacaatcttgacgaagcaatcttggcagctgttcaatgtg agttataacagtctttgtggaaagattccacagggtggat ctatgcagagatttgatcaatattcctattttcataacaa atgctTGTGTGacgcaccattgccaccatgtaaatgatca tgactagtactggtttttccatTATATAttcacagaaata agagtggtaagctactacatgtgttcttgtggtcctacat ccacctatctttctatgtatttcaacCTCTCTttgaatgt tgatataagccagtaataaacttaaggctgtcaataggca tatgaatgtactttagataggcatatctatctatttgtcc ttttcagtaacctcttgatcgatgaattaatgtgcattga atg
Developer NIVTS
Document
old source name
typing_method 13% PAGE
motif (taa)3cancaccat(taa)12
PCR product (bp) 292
fwd primer
fwd primer seq acctcaacagcatccaatgttacaa
rev primer
rev primer seq gtttgcatatcagcagaagccataattgg
PCR condition 95C_1min->(94_30s->55C_30s->72C_1min)x35->72_5min->4C
polymerase Native Taq
comments QV: estimated by sequencer
Line allele-1 allele-2
K9-11 283.3 283.3
MZC-180 (selfed LS2341) 280.2 280.2
Population Linkage Group Position
KL-DH KL04 127.59
KL-DH_2024 KL04 127.59
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain