+Marker Data: gg17961_1016

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_09
Marker Type SNP
Map Position 86.849
Annotation
Source Name FKO03-01.1224.C2
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c17961
454-Contig_seq (unpadded) ATGGCCTCTATGAGAGCGTTGCCGATTTGTAATTGTAGCCTAGCTTGTCAATAGNCAGAAATTAGTGTTGTAGCATGTAAGTTTATGAAGATGAACTCATCTTGCACGCACCAACCACATAATTGTAGGTAATAGTGTTGTCTGTTTAGTTCTCTTGTTCAACTCGGTTTATGGTGCCATGCAGGAGAGGNCCAAAATGGATGAAGATCAGTTCGCTTGATGAACTAAAAACCAAAGTGGGACATGTCATTGTCATGATCCTTCTTGTCAAGATGTTCGAGAGGAGCAAGATGGTGACTATAGCCACTGGTACTGATCTATTGAGTTACTCAGTGTGTATTTTCTTGTCTTCTGCTTCCTTGTATATTCTTCATAATCTGCACAAGTCAGAATAACTGTTGACATGTACCATAATGATAAATATGTACGTAGCCAAGTAATCAAACTTTTGNAAGCTAGTATTATTTTTTNTTCTTTCTGAAAACCTTGTGTGATTCAGTATTAATAGCTCTCTCACTCTTAAGTAGCTCAATATTGCTTACTAAAAGTAAATGTTCCATCAATCCAGTATCTCCCTTTCACCATAGACTAAAGAATGAACATATAATCAGATCCACACATCCAACAAGGAAGCAAGTCTGTAAATTATGNCCCCCAATCTTGTTGAGCCGAGCCTGTCTGTACAAGACAGCATTATAGAGTGACGCAATGGCAACGANGGTACAACAACAACAACATACCTAGTGGAATCCCANCAAGTGGCGTCTNGGGAGGNGTAGAATTTACNCANTACCTTACNAGTAGTAGGGAGGTTGNTTCCTTTTGGAGGTCAAATTGGGTGATTACTTGGTAAGCCTAGTCAAAAGTTGCACTGTTTTTGTGCTTGCACCATCTTGTGATTCGNATGGAAACAAAATTGATCCACTTTTAAGGCAGGAGTAGTTGTACCCTGCAACATGAATAATAGGACATATTGTAATGTATGAATGAGCATGATATGGTGTACTTGTGTGCTAGAGCTAGCAATGGGGTAAGACGTTCAGTTGCTCCCCGGTAGGGTGGNCTTGATGGTAAAAGCCATNAAAAAGTGGAGGACTTTCTGGTCCATCCCATGTACCAAAATAAAAAGTGGAGGTGTAGAAGCCATTTTCTCTTNAAAAATCTGATCTAGGATATTTGTTTTCGTGTCCAATAACTGATGCAAGATTACCTAATCCAATTTGGTAAGAAAATGACTAATATGGCATCTTGCTGTTTGATTTGCAGTTGACAGGTATATCAAGGAAGCAGAAGNAGATTCGCCTCGCTATGTTACCTGTGGACCTAATTAAAAGAGTAGGTGCCNTCCTTTTTCCTTGTTCAGTTGTAGCTGAAGAATTAGGATGTTGTGCATCAATAGTATTAATAATGTTTTGTTCTGTATTCTGTNGCGACTTTTGAAGAACATTAAACCTTCCGTGATGATAGGTGAAGGAAATTCAGAAAGAAGGGCATGTTGAACCAGTTCCTGTCCAACAGAAGGATGCAAAGCAGACTGCTGNCAGTAGACCTCATATCTAGATTGAACAATTATCGGTCATATTCAGATTCAGGCAGCGTTAAAGGTAAATTATCAACAACCCTATGGACACTCTTCTCTTATCTATAGACACAAAAAGACCTCTTTAATGCTTAGCCACATGGTGAGTCCTTCAACAATGTCTTCTGCAACTCTTGGAATCAGTAAAAGAAAATTTGTNGCTGAATTAAAAAGCATAGCAAGCTTCAGTCTGTTGTGTATCTTCTAAGAAGCACAATTATCAATATATCAGTCATCTGACTTCCTTGAATTGACAGTTCATTTGTTTCCTTCTGAATTCAGTCAATGAATTGAGGCTATATGAAGGACAACTTAATTGTCAGTAGGAACACATCAATTTTATTTGTTTTAACTCAATGCTAAGCACATTAACACTTGGAGAAGTACTTTTT
SNP_position 1016
sequence_for_GGdesign ATGAATAATAGGACATATTGTAATGTATGAATGAGCATGATATGGTGTACTTGTGTGCTA[T/G]AGCTAGCAATGGGGTAAGACGTTCAGTTGCTCCCCGGTAGGGTGG-CTTGATGGTAAAAG
GGdesign_Final_Score 0.98
Ilmn_Id 17961_1016-0_T_R_1967852083
allele_1 T
allele_2 G
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_09 86.849
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain