+Marker Data: tbm2058

Crop tomato
Population GM_RIL_4K
Linkage Group T03
Marker Type SSR
Map Position 16.303
Annotation
Source Name
Source Type genomic
Source Sequence GTGGATGGGGGTGCTTAATTAATTTTTTTTTTTtGTATTT TTATTACTTAAAACATCATATTTGGTAGGTTGGAAAATAT TATATACGTCGAACTCATAAATAGTTTCTTAAATTTATTG TTTTTTTTtCTTCTTAAGGTACATTAGTTATGTCATTTTT CTGCTGAATTATTAATGATTTATTTTTTAAAAATATTATT AATTGATTTTGATTGATTTTTTtAATTGTGAATGTCTTTA ATTGTGTTCGTACTATAATGATTTTGATTGAAGGAATGAA GACAAACTGTGTGTTAGTCTTATTTATTTTATAATGTGTT CAAGTGATTTAAAGTATAACATAATTATTCTCGAACATTT TCACTATCAGTTGGACTGATGAGTTTTGAAACAACATGTG TATCCTCTATCAATACTCCTCCCAAAATCTGGTTCTACAT CAACCAACAGTGTGTAAAAGGAACAAATTATGGGTAATTC AATAATTCGAATTGAAATTAATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATAATgCTTTAATTTA ATTAAAAATTTAAATATTAAGTCCGGTTTTAAATAAACAA TTTATTCAAAGTAAATATTTAATTTTGATTTAATGTTCAA TCTATGTCATTTAGATATATATTATTAAATATATAAATGT AGACTTACTCAATTAAATAAACTAAATGAGTTAAGGTCTT AAAAGAGTCTAAGGGATAACTTCGTTCTACCCTTCAAACT TCATTTTATTAAATATGTTCTTATTTATTTTATAAACGAA TCGAATTATTATATGAAGACGTTTGAATAGGTGAAAAGGA GATAACTATACACTTGAAATTTACATATAAAATTTATATT TCCTACATTCACTAAAAAAAAaTACCATTTTTATCCTTTG TAACAAACTTAATTTTTtAAAATTATTTTAAATAAATCAC ACATTGAATCAAGTGGCTCTATTTAAGAGTTATGTCATGT TCCATTTGAACGTATTTAATAGTATTTTTttTTTTtGCAC AATTTAA
Developer NARO
Document
motif (AT)23
PCR product (bp) 176
fwd postlabel primer tbm2058/U
fwd postlabel primer seq aggttctacatcaaccaacagtg
rev postlabel primer tbm2058/L
rev postlabel primer seq gtttaaattgtttatttaaaaccggact
fluor. primer
dye
fluor. Primer seq.
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
BIN C03_02
probe Marker TEI0712
Line allele-1 allele-2
Geronimo 176 178
Momotaro 8 176 180
Population Linkage Group Position
GMF2 GMF2_03 3.482
GM_RIL GMRIL_03 2.6
GM_RIL_4K T03 16.303
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain