+Marker Data: gg10687_668

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_08
Marker Type SNP
Map Position 2.101
Annotation
Source Name CHX02I06W
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c10687
454-Contig_seq (unpadded) TGCATCAGTGTATACTGTCTATTTGCAACAGCCTTATTAAGGGCTNTGTGGCATCTTAGTGCCTGCATTTTTTTAATTTAATGCTTTGTGGTTTCACAGATTGTTCTTCGTATGCTTAAATGATAGTAAGGAAAGATNAAACCGAACAAAATTGTCTGTAGTTTGATAAAATTATTGAATGTTCAATAACCAAGAATATGCTTAAATTTCACTCAGCAGCTTGATGTCAAATGACTGAAAGTTTCAGCCCTTGACACAGTCGTCTATTGGTAAAAGTACAGTAGATAGTTTCTAATCCTTGTTAANTTTTTACAACTATATCTATACTAATTCCTAAAGGAGGGATCCCTTAATAAAGTAACTCGGCGATAACATCCAAACTGTTCGTCTTTATTCTCCTTTNTGCAAGGGTATTACCATAGGTTCATGAGAAAAATCTGGGATTATCGAATGGGAAGTTTGGATCTAACTCCAAATGGTCAAGTGAAAAGTCGCCCACAATTGGAGAACTCGTTGTGGAAGTGTTGGCTGAGAATATATCGGTGANGGTCTGATTCTGAATGATGCAAGTTATGAACCATTCCGTAACCATTCATCTGGCTGCTGCTTGATATTGAGAAGTAGTTTGATTCAGGGGTTGTAGGAGAGATAAAGGACGGTGAATAGCCGTTACCAATCAGATTTTCATCAACATGGGAAATCTGGAAATGCCGATTATCGTCTGTCAAACCAGAAGNAAGAAAACGTTGNTAGGAAAGGTGAAATGACATGCTGCTGTCTCATTCTTGTCCAAGTCATTCGTATTGACTCTCAGGTTTGCTCTCNAAATTCATCAACACTTGATTTGAATACTGCCCTGATTGATATACAGCTTGGTTCTTGAATTCTGGTTTCTCTGGCGATGTTGGTTGTAGTGCAGAATAAGTAGCATGATGACAATTATGAGAGCCTCGGTATGTGATATCGAATACAGTCGGATCATCGTCTGATCGCTGCACTTGNTTGGTTGCCCAACAATTTTGCATGTGACGATACGTGCATCGGTAGTAGCTTCTGCAGAACACATGAAACTTGGTATCAGAACGCAGAACTATATTTGATCAATCGATTTGAGTAAGTTTGGTTTTCGTTTTTATGTAGTTTTATGGTCTTTTATGCAGATTAATAAAAATGACGTATTACCTAGGATATTTAGCTCCTAGAATATCCTTCTGTCCGTACTTTCTCCAGCTATATCCATCANTCAGTAGGACCCTCAAATCCGCTCTCCGCGCTGACTTTGACTTGTTCCGTCCATGTGGGCTGTGATTTTCTGNCAATTTCCATCAAGAAACAGGTTAGTTGACCNTTAGAAAATCAACTATTGAAAGTCTGAAACTTTTTCCTTCTTCNGTAAACAGTCTCTATATCTCTATGAGGTAGTGGTGAGTTGTTATTTTATAGAGCAGTATTTGACTAGACATGGATTTTTNTGAAAATAAAGACTTTTTGGCACATAAGAAAGTATTACCCTTAGANTTTTTGCGGTTATAAACATGTCATGGCATTTCTACGGCTATAAAAGCAGGTTATTAAAGGTTAAATGTCATTTTTAGTGGAATTTGATCTTCTACCTCTTCTTTGAAATATTAATGAGCTCATGATGATCTTGGAAACTTCTTTTCATGTCATCACTCTTAGGACTTCCATCAACGGATACCGAAGATTCAATCGCCCCACACGTTGGCGGCAGAGGCTGAGGGGATTGTACTGTTGAGCCACTCCATTTGAGAATCAACAGAGATTGCTCATAAGAAGAAAGAATCTTCTGAAGAAGCAATTCTTGATTCTCAAAAGTGGAACCTGTAGAGTGGAAGTGTTCTCTAAGTTGCTTTGTGTGTTCAATACCTTGAGTTAGCTCATTGATGACTGTCTTGTATTCCCAGTTGGATGGACAATCCATATTGTGAAAGACGGAATCGGAAAAGAAAAGGGGGANGCTATTCTGAAGTCTAGTAAGGGTGTTCGATTGGTGTAATACACTTGACACGACGTTAACTTACTTACGAATGGAAAAAGANTTTTATTTATTTTTTATTTTTTNTGTGGGATNTTTAGAATCTTGATGAGTTTTTGTGAAATTTGATGAGTTTGAGACATTTGAATTTAAAAGGGAAGAATTTATAGTGAAATATAAAAAAGGCATGTGGAAAAAANAGGGCAATTGGAATGGTGACTTTTGAAAGTTGACTGATGAAAACGAGTTATTCTAAAGTGGACTGGTCTTTGGTCATCATAATTAGAAAGTCCAAATGTTGAGTGCTGACCAATNTCAAAATTAAAATAGTCTCACTATATCTTCAAATCTTCGAGACGTGTTAATTAGNCTGTGTCGCTTTTGTAAGAATTATGTAAGTTTTAATATGAGATATTTTTTNTANTTCTTAANTTAGATGTGTTGTTTTTATTAGAAATATGTAAGTTTTAATATGAGATATTTTTTTAATTCTTTATTAGATGTTTGTATACATTATACTCTTTCCAGACTTCATAAGTTATCATTGGGTATGTGTTATTGTTTTATTAGATGT
SNP_position 668
sequence_for_GGdesign TGATATTGAGAAGTAGTTTGATTCAGGGGTTGTAGGAGAGATAAAGGACGGTGAATAGCC[A/G]TTACCAATCAGATTTTCATCAACATGGGAAATCTGGAAATGCCGATTATCGTCTGTCAAA
GGdesign_Final_Score 0.931
Ilmn_Id 10687_668-0_T_F_1951736091
allele_1 A
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_08 2.101

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain