+Marker Data: tbm1463

Crop tomato
Population GM_RIL
Linkage Group GMRIL_07
Marker Type SSR
Map Position 48.1
Annotation
Source Name C07SLm0034N13
Source Type genomic
Source Sequence TCACATTTTAAGACACTAAACATAAAAAAAAATTAAAAGA AAAATCAAAAAGAAAATTTTAGATGAGAAACACAAAATTA ATATCGACAATAATTATTAAATACATAAAATAGAAGTAGA GAATTTGATAATTATAAAAAAGAAATATAATTGAGTGTTT GATATCATTTTAACATAATTAATAATATTAAGCATTTAAA TATATCAAGTGGTTATACCATAAATAAAATAAAAATGTAT TGGACAATTAAGAATTGAGTAATTAAAACTAAAATTTCAT AAAATAAATTAATGACTAAAATTTAAATAATTTTAAAAAA TTGCATAGTTTGTAATAAATAATGTCAATTGAATTTTAGT AGATTAATTAGTTAATTACCTTGATATTTACTTTGTTAGA GAAAGTTCTATTTTATTTTAATTTCACAATGTTCAATTTC TTTTACTTCATAAATTAAATTAAATTTTTCTGACATATTA CATTAATTTTCCCTCAAATAATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATAAATAATCACTA TAAGAGTTACCAAGCAAAAAGAAAAAAAGAAAAGCAAAAT CACTATATATACAATGATATTTGGATCAAACTAATTAACT AATTTACCATGATTAATTAACTATATATGAGGTTAAAATG TCCATGAATTAACTACTATATAATTGGCTTATAATAGTTT ATAGTAGAGCATATGCCATACAATGTCAAATTTTCTGACT TAAAGGCATATTTGCGTACCTGGCCCTTTAAACAACACAA TTCAAAGTATTTGAACTTATAATTTAAATTAAAGATAAGT GTCAAAAACATATTAAATTATATCTTTTTTTTTAGTTTCA TACCTGAACTATTAACATATCTAAACTATATCTTTTTTTT TTAGTTTCATACCTAAACTATTAAAAGTTTGAGGTTCATA CCTAAACTATCACTTTTTAGTATAAGAAAGACACCTCTCT CTTTCTCAAACTAAAAAAATAGTTTAGATATGAAACTCAC ACTTTCAAT
Developer NARO
Document
motif (AT)24
PCR product (bp) 162
fwd postlabel primer tbm1463/U
fwd postlabel primer seq ATCAATGTTCAATTTCTTTTACTTCA
rev postlabel primer tbm1463/L
rev postlabel primer seq GTTTCTTTTTCTTTTTGCTTGGTAACTCTT
fluor. primer
dye
fluor. Primer seq.
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
BIN C07_05
probe Marker TES1567
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
GM_RIL GMRIL_07 48.1
GM_RIL_4K T07 41.26
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain