+Marker Data: tbm0387

Crop tomato
Population GM_RIL
Linkage Group GMRIL_07
Marker Type SSR
Map Position 103.8
Annotation
Source Name C07HBa0175E07
Source Type genomic
Source Sequence AAGGCTCATTGGCGGCTGAGCCTTACAAGGCTCATCGGAA TTTGAGTTTTGTAAAACTCGTTGAAATTTGAGCCTCGTTT AGAAAATCTGATTTGTATGGTGTTAAAATTGTTGCTCTTT TGGTTTCAAAAATAATTGAGTTGCCCTTTTAGATTTTTCA AAAAAAATTGTTACCCTTTTGATTCCAAACTCGTATTAAT TACTTTTGTGTGCGGCCGTCGGCCACCTAAGCAACAACTC CAAATTACTTGTCTTCCGTGGTGGCTCAATGGCTTAAAAA ATGAGGCATACGCCTTAGGCTTCCAAAAATAGAATGCCCT AATTTTTTACTAATATAAAATTATTATAAGTCCTTTTAAA CAAAAAATAATATAATATGTTTTATTTATTTATTTGTCTT TTTAGTTTGTTCCGAATCTTTTAAAACATATTTTTATGAA TCAGTCTTGAAATTTAATTTTCATGTGATAAGTTTAAGAT CACAAGATGAAAAAATATGGTATATATATATATATATATA TATATATATAAACTTATTTAAAAAAATAACTTTGAATCTC ATATATAAAAATAAAATAAAATTTAGGTGTGCAATTTATT TTTGACTTTAGGCCACTAATTAGTTTGAATTGTATCTTTC ATTTATTAACATAATAGTAGTTCGTAATAAAAGTGGGAGT ATATATTAAGTATTTTGAATGACAGATCAATATATATTGG GAAACTTTCACATATAGCCACTTAAAAATACCTAATTATT TTCAATACTTATAGTTTGATAATTACAATTCGTATCTATA TGTTATATGGAGGAGAGCAAATTTGATTCTGTTATATTGA GAATAATATTTGGAGGCCACTCCCTTTTAATTTAACATAT TCATACCTTCAATAATTAGTAATTAATTCTTTAAATTTCC CTAATTTAGTGATCATGAAGTTGACTTTGTAACACAATCT ATGACATAGTAAACATATTATCGTAATTGAATTTGCATTC TCTTTTCTTTGTATTTTTAGATTATTTATCC
Developer NARO
Document
motif (TA)15
PCR product (bp) 222
fwd postlabel primer tbm0387/U
fwd postlabel primer seq ATTGTCTTTTTAGTTTGTTCCGA
rev postlabel primer tbm0387/L
rev postlabel primer seq GTTTGGCCTAAAGTCAAAAATAAATTGC
fluor. primer
dye
fluor. Primer seq.
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
BIN C07_10
probe Marker TES1284
Line allele-1 allele-2
Geronimo 227 229
Momotaro 8 229 229
K03 225 225
K09 227 227
Population Linkage Group Position
GMF2 GMF2_07 102.059
GM_RIL GMRIL_07 103.8
K39_RIL K39RIL_07 67.16
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain