+Marker Data: gg10651_1560

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_07
Marker Type SNP
Map Position 65.628
Annotation
Source Name FKO03-01.732.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c10651
454-Contig_seq (unpadded) CCGGCAAAATCTGTATGTAATCATTTTTCTATATTTATAATTGAAAAATACTTTCTTTGAGGTTTAATATTTATATTACAATTTAATTAAATTTAAATTCATACTAGACAATTCTATATAATGGGTGAAGTCCACTAAATAACGGCAATAATGTATTTCATAAAAATTTGAATTTGAGATCTTTAATTAAGAATAATAGTTGGAAAATAATACTATGTCTCGTAAAAATATCTTAAAGTTAAAATAATATAAAACAGGAAGAGCGACGTGATTTATAATCATACTTATGTCTGTTTTACAAATTTNAAGATCTTTCNCCNNNNNNNNNNAANAGTTAATTTTTATTTTAAGTGAAATGAAGAGCATTTAGTGAACTTCCATTCTTTTAAGACCGACCCGGCAACGAAAGCGATGACATATAGGACCGTGTATGGACACCTAACAAATCTGTAGTAGCAATTTNTGGGGGNAGAAATTTNTCTTTCTTCCTTCTTCTTCTTCTTCACTTGCCTGGCTTATTCGTACAACAAAAATGGCTAAAAATGAGGTAATTCTGTTGGATTTTTGGCCTAGCATGTTTGGCTTAAGGCTGAGAATTGCACTTGCTGAAAAAGAGGTGAAATATGAGTACAAAGAAGAGGATTTGAGGAACAAAAGCCCTCTGCTTTTGCAGATGAATCCTATCCACAAGAAAATCCCTGTTTTGATTCACAGTGGGAAACCAATTTGTGAGTCTCTTATTGGAGTTGAGTATATTGATGAAGTTTGGAAGGATAAAGCCCNCGTNTGCTCCCTTCCGATCCTTATGAGAGGGCACAAGTTAGGTTCTGGGCTGACTATATTGACAAGAAGGTAAATTGATAGCCCTTTTCCCCCCNCTGTTTTCGATTTTCGATTCACTAATTAGGTTTCTTTAGCTGATTCCGCACTAATTTGTGATTGAAGCTTTGTTATTTTGGATTGTATTGTTGAAGTAATTTCACAGTGTCTTTGATTGGCTTGATTAATGGTGACCTAATAAATTAGGTAAACGCCTAATGTAGGCCCTTTTACTGTACTGTTTGTGCTCAAATTTTTACTTTTGGGAGTGTAGAATTTATATACATCTATCTCGTGGAGGTTAAGGATTTGATAATCCTCACTACATAAGNATAGTGTTCCTTATGATCCAAANTGTGTAATCCTCGGCATGTGGTGTGTTAGAGTTTTACGTTGGTTGATGAAATGGAAAATTATCTCATTATATTGTCTTGGTTAATCCTCACTTCGTAAGCTATGTTATATGCTCCGGATGTTCACTCCTAGGTGTNGGGGTTGTTAGAGTTTCACATTATTTGAAGAATTGGAATTTTGTCTTGTTTATGTAGTCTTGGTTAATCTACACTCATATGGTAGGTTTCGCTAGTGTCTAAGGTCCATTTTCTTAAAATGAACCTTACTAGGACTTGCCGGAAACAGTCTTTCTATCTCTACGAGGTAGTGGTAAGGTCTGTGTACATTTTACGCTCCTCAGACCCCATTTGTGGGATTCCACTGGGTATGTTATTGTTGTTGAAGCTTACTAGGACTTTTATTTTTGTGGCAACAAGTGATAACCCTTTTCTTGTTCTGTGTTTGTTGAAATTTTCAGCTGTATGTTTCTTCAAGGAAAGTATGGGGAACAAAGGGAGAAGAGCAAGAGTCAGNGTAAGAAAGATTTCATAGAATGCCNTTAAAGTGCTGGAGGGAGTACTAGGCGACAAGCCTTACTTTGGAGGGGATAACTTTGGTTTCGTGGATATAGCTCTAATTGGGTTCTACTGCTGGTTTTATGCTTATGAGACTTATGGTAACTTTAGCACAGAGGCTGAGTGTCCAAAGTTTGTGGCTTGGGCCAAGAGGTGCATGCAGAGGGACAGTGTGGCCAAGTCTTTGCCTGACCAACACAAGNGTCNCTCGAGTTTGTGAANAGTGGTTAGGCAGAGGTTTGGAATCGAATAAGAATATGCTTATGCAATTATGCATCATAATGTATTGGAAAAGGGNGCACTTCATTGTGCCATCTTGTGTTGTTGTTTCAAGATTTGAAATGTTTGTTTGGTCACAGCGTAAGTTCCACGTTTCGTAATAAAGGACTCTTAGCTTGTGTCTTGTTGAGTGTTGGTTTTTGTAGTCCTTGTATGTAATTATGGGACTTCTCTTCTTTGTAATGAGAAGTAATCACTTCTTCATGAGCATCTACTATCATAATAATTATGCAACAGTTCTAAACAAGTTGAGATCGATTATATCATGGTTTTGCCAAATAATTTTTTCTAGGNTGGTTTCTTATTAGAGGTCCACGTCATCAAAACTAAACCATTCAAATTAAATCAAATTAAAAATTTACACCACCCACCCTAACCCATTATTNGGTGATGCGTTATTCAAGATTTGTGNTTTTACAGGACANTGGGCTAAAGTATCTGACCCATCACCCAAGCATGAAGTGTGAATTAGTTCATGGAACAGCAGCCCATTACC
SNP_position 1560
sequence_for_GGdesign TTACGCTCCTCAGNCCNCATTTGTGGGATTCCACTGGGTATGTTATTGTTGTTGAAGCTT[A/C]CTAGGACTTTTATTTTTGTGGCAACAAGTGATAACCCTTTTCTTGTTCTGTGTTTGTTGA
GGdesign_Final_Score 0.891
Ilmn_Id 10651_1560-0_B_R_1967851702
allele_1 A
allele_2 C
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_07 65.628
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain