+Marker Data: gg12487_1848

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 104.592
Annotation
Source Name FKO03-01.9741.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c12487
454-Contig_seq (unpadded) GACGATCTTTTTTTCAGAATAGCTAATCATACAATGACGATCGTTGAAGCAGATGCATCTTATGTCAAGCCATTTGAAACAGACACAATTTTAATTACTCCTGGACAAACCACAAATGCCCTCCTTAAAACACATCCTAATCCACAACAAACCACNTTTTGTTATGGCAGCTAGACCTTATTTCACTGGCCAAGGCACATTNGGATAANTTCCACAATTGCTGGATTTCTTGTGTATGATCATCATCAAAANTTTATCACCACCATCATCTAACAATATTTCAATTCCAACACTTCCACCAATTAANTTCCACTTCATTTGTATCGAATTTTTCTAACAAATTTCGCGCATTAGCTAGTGAGAAATTCCCANGTTAATGTTNCCGCGAAACGTCGATAAACATTTTTNTCNTTACCGTAGGGCTAGGTAGCAACCCGTGCCCAAAAAACCAAACATGTNCAAGGTCCTAATAATTCCTCAAAATTTGCTGCTTCTGTTAATAATGTCTCTATGATTCTACCAACAACAGCAATGCTCCAATCCTATTTTTNTCAGAAAATCAAATGGAGTATACACTAGTGATTTNTCCAAGTTTTCCTTTAATTCCTTTTAATTACACTGGCACCCCTCCAAATAACACAAATGTCTCTAATGGCACAAAAGTTGTGGTGCTTCCATTTAATACTTCAGTGGAATTGGTACTGCAAGGCACTAGTANTTCTTGGTGCTGAAAGTCATCCTCTTCATCTTCATGGATATAATTTCTATGTTGTTGGACAAGGTTTNTGGTAATTTCGACCCGAAAAAAGATCCTGCTAATTACAATCTTGTTGATCCTGTTGAAAGGAACACCATTGGAGTTCCATCTGCTGGTTGGGTTGCCATTCGTTTTCTAGCTGACAATCCAGGTGAGTTATTTTTTCCTATAGTAACATTGACGTTGTAAAAATATTTAAAAACGATCATATAACTGGTAACATGTGTATATAACTTAAATTCTTGAAAGGATGAAAGGTTTACCATATAAATTCCCTATTGACTTTGACTTTTATAGATCTACAATGATCGTATAGACCAGAAGATAATTAAAGTGATAGTTTTACAAAAGTAGGATTAGGAATTACCAGAAAATAATAAGATAGATTATCTGTTACAGTAAATTAAATTGTAAATGTTAATTCACATTGTCGGTGTACATAAATTAGACAGATGAGACGAACTTGTGGTAAGGTCTCTAGAAGATAGTGATAAGGTCTGCANTACATTAATTTTACCCTTCCCAGACCCTACTTGTGGGATTTCACCGGGTATATTGTCGTTGTTTATTGACTAACTTGGTTATTTTTGGGTGATATGAACAGGAGTTTGGTTGATGCATTGTCACTTTGATGTGCATTTGAGTTGGGGATTGAGAATGGCTTGGCTAGTATTAGATGGAAAACTTCCTNAACAAAAATTGCTCCCACCTCCAGCTGATCTTCCAAAGTGTTAACAAATTCATCAGTTCTGATTCTTNCTTTCAATATGTTAATTATTCAACTTGTATTTTGACTTGTTTTGCAGTTGTGTGTTTTGTTTTTCTTTTGCCTGAGAATGAGAATGGAATTACAAGAGTGGTTGAGGGAGATTTTGTTTGTGTAAAACTTTTGCCTCATGAATCAATAAAAGCNATTTTTTATTATCTCCTGGTTTGTTCAGCACAAATGCACAATTAATGATGCGGAATTTTATTCGCATATCCAATGATATCAATAGCTCCNAAATTATATTATTATATGATAAATTAGNTCTTGTGTACTTGCTTTNAAACAAAAAGCCTCGATAATAAGTCATGTCAATTATATTGATTCATCATTGTGTATTTGCTTTAAAGAAAGGCCAATCAAGTATGTTTCCTGT
SNP_position 1848
sequence_for_GGdesign TCTTGTGTACTTGCTTT-AAACAAAAAGCCTCGATAATAAGTCATGTCAATTATATTGAT[T/C]CATCATTGTGTATTTGCTTTAAAGAAAGGCCAATCAAGTATGTTTCCTGT
GGdesign_Final_Score 0.667
Ilmn_Id 12487_1848-0_T_R_1967851587
allele_1 T
allele_2 C
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_06 104.592
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain