+Marker Data: gg1207_427

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 53.473
Annotation
Source Name FKO03-01.7007.C6
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c1207
454-Contig_seq (unpadded) TTTTTAACTGTCAATTATAATACCACTAATAATGAAATTGCAGGGAAATTAAAAGCTACAAGAAGGGGAGTGATTTATATCCATAGATTAATGTAACTGTGAATACATAGAGGGAGTGAAGGGGCATTTCCAAGATGATAGTTCGTTGTTGAGCAATCTTGGGGTTAAGATGTAAATGNTTTAAATCTTTGTCAGGAATACATGTTNGCACCAAATTTAACTAGAAGNATCCAGATAAACTAAATTGAATGTCCAATCGAGCATTCATGCGACTTTATAAAACTTGTAACAACAAAAAGAGAAAAAGAGAACGAGGTNGACAAGTATNCAAATTCACATTATTGATCACTTGCGTTATTTTTTCAAATCTATGATTAAAGCCAATGTGGATGACANTTTTGGCCAAAAACTAAGATTTATGACACTTTGTATTAAGAGATCCATGAACTTTGCCAAGATAAGTGGAGGTTTCTCAGTGGGCTTTGCTTTGTTCTTGAAAGATGGATGGATACCAGAGCTTNGGTTTTAGACATAGAAAGAAACTTCGAGACTCCNAAATTCGGCAACNTTCTCTTCTACATTCAAGCCTGCATATTCCCATCGCGAAAAATAGTTAGTCAAATAGACATTGCATCTAGGTGCAAGAGAACAACAACAACATAACCATCGAATCCCACAAATAGAGTCTGGAAGGATAAAATGTACGTAGTACTTACCACTACCTCATAGAGTATGATAGAGAGCTATTTTTGGAAGAACCTCATCTTAAATATATCAAGTCCCAAAAGCAGAAGATGCTGGATATGAAAACACATGATAGTATATAAATANCGATAAAATTAACATATANNTAAGATGGATAATGACAACACAGGATATAAAGACACGACTAATNCTACTACCCTACTATACCCCAAATCCAGACATCAACCTATCCCTACTAGCCTATTAGTCTGCTACTCTAATTTGCGACCTCCACTCTTTTCTATCTAAGGTCATGTCCTCGGTGATATCAAGATGCTTACAATTACCAAATGGTCTTATGCAGACAGGCATTTACTTGTTCAAAGGAGGAAGACNAAACAAACCTGCTGTTTCTGCAGATGTGTACGGGACGTTAAACCGAAGCCATTAGATCCAGAGGAGGCATATCAGNCAGTTTGAGATATGTCTATATGGTATATGTTGCAAANGCCAAAGGTAACTTTTTTGCCAAGTCTCTTGCACCTGATGGTTTTCCACCAAACNTTTCTAAGGCGAAAAGGTTGGCATATCAGTGCCGAAAAGCCTAAACATTATGAACTAAATGATGATGCTCTAGGCCTCAATGCTGAATTGAGGCAACAACTTCCAGAGTTCAATTTCACATCATCTTGTAAGAGTTCTGAAGTTGTCGTCGTGGGAAAATGGTATTGTCCTTTCGTGTTTNNATCAAAGATGGAACAGAACTTAAACAACAGATGAAGAGATCAATGTTCTATGAAATGACACTTGAGCAGAGATGGGAGCAGTTTTTCACTTGTCAAAACGACATAATTAATGAAGGGAATTCAGTACTTGTGGATGTTGCACTTGACACAGAAGTTGTCCTTATTGGCGGAACTAACAAAGCAACGTGGGATGATAAAAACGTTGTTGAAGGAGTGATATGGTTTAGAAGCTATGGTAAAGATGGAAATGAAGTAACTAGTTTGGGATTGAGACGAGAAATAGTTCAAAGAATGAAATGGGAACAAGAAAGAGGTGGATGGCAAAATCAAGCGAGAATCAAACAAGTTGAAGAAAACAGAGAAAATGGTACTAAATGGAAAAGATTCAGTTGTTATGTTTNTGGTTGAGAAGTTTGCGTTGAGACGAATGGATAAAACCTTGGCGATGACTTACGANTTTCNAAGCACATTGACAAGGTTAAAAGCATATGGGAGTAAGATAGTATGAGACAACATGTAGTTGTTGATGTTTCTGTGTGCATGTGTGAGCTATGTTGCTCGGACTCCTAAAAANATGTTGCCGCACTTACATTAGGTCCTTCAGAAGTACGCTACTTTTGGNAGGATCTGACACACACGGACATAGTGGCCTTATTTAAGAGTCCAAGGAATATACTGTGTGAATANNTTTTTATTAAAGGTTTAAGCTATATACGCGTGCTGAGAATGTATTGAATTCTGTTAGTGTGATTTAACAGATTGCAGTAGGTTGTTACTCTATTTTCCATTTTGCAATATCAGACTTACTATTAAGAATGTACGGTTATGTATACTGTGTATGTCACACGTATATCTTGCGTATACGTCTTATATATTCGTATTTAGNTGAAAAAGGATCCTATTTATGGTCAATATTTCTGGCACTTTGTGATATAACCAANAGATATTTGATCCAATACAGAACCTTTCAACTAGCTGANTTTTTGAAACAAAACCAATTTTCTTATATTCATATAGTAGTGGATCAAGGTATACAACCAACAGCGAAGTCATGATAACTAGTTCCAGTCTCAGAAGAGATACAACAGTATGAGTTATTTGTTGAAGTGGTATACTATTGACTTTCATATGATGAGAAGTAACTCCTATGTAACATAATGGTTGTAGACGTCCAAAAAAAAGATGCGTATAGAACGAATGAATGAAAAAATCTCAAAAGAAGTAAAAGATTCGA
SNP_position 427
sequence_for_GGdesign TCTATGATTAAAGCCAATGTGGATGACA-TTTTGGCCAAAAACTAAGATTTATGACACTT[T/C]GTATTAAGAGATCCATGAACTTTGCCAAGATAAGTGGAGGTTTCTCAGTGGGCTTTGCTT
GGdesign_Final_Score 0.855
Ilmn_Id 1207_427-0_T_R_1967851298
allele_1 T
allele_2 C

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_06 53.473

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain