+Marker Data: emx60204

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_06
Marker Type SSR
Map Position 13.093
Annotation
Source Name Sme2.5_01765.1
Source Type genomic
Source Sequence AGAAGGTGAAAGTCTTGGTAGATGGCTTTTAAAAACAAGC TCTCTGGGAAAAATTCAATCAGATATAAATATATACTATA TTAAAAGCGTGAAGATCTTTAGAAATATTATTTAAACTTT TTGCCCTTCATTAAAATATCCCTCTTTAGATAAAATCATC TTTTCATCATCTTTTTTGAAATGTTTTATTATTATTTTAA TAATATTAAATATATTAAAAATTAAATTTAGAAAATTTAC TTATTATAGTTAAATCTCTACACAAAAAATCTTTTTCCAA CTAAAAATAAATGTATAGTCAAAGAATCTTTTTTCAACTA AAATAGACTTGATCTAAAAAAAAGCCAAAAAAATTTAAAT TGACACAACACATACGTGCAAAATACGTACGCTAAATTAA TATAAATATAAATATAAATATCTAGTTTAGGGTATAACTA GTACTGCACGACTTATGAATTGTGAGACTGATGTGGGTTA TGTTGTTTGATAGTGGTAACATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATATATATATACAGATTCCCAATACA AATTGATGAAATATATAAATTAATTAATTGATGAAATATA TAAATTAATTAATTAATAAATAAATAAATAGGGGAAGTTG TCACTTGGGAGTTGGGTCTACAAAAATATAAAAATCCATG TGCAACACTTGCCACTTCAAATTTTCTTGGGGCAGATACA TCCCCCTTTGCCAAAATGCAAAAATGGAAAATGGGTCCTA TCAATAAATTGGAGCTCTTTATTTTTTTTATTATTTTCAT CCATGGTAAATTTTTTAAAAAAAATTCCTTCTTTTTATTC GGATACATTAATTTAGTAATTCAGATAAATTAATTATGAT TCTTAAATTATCTCTATGTTCAGTGTATCATACTTTAAAT GTTACGTGTTGATACTTAAAAACCCCAATTTTTATATTCG AAACTGGATTAATATAGCCAAATTATTGAATTAATATATC CAAATTGACATATTTTAAAGAATTTCTGGAAATTAAATAA GAATT
Developer NIVTS
Document
motif (AT)22
PCR product (bp) 300
fwd primer emx60204/F
fwd primer seq. TGGGTTATGTTGTTTGATAGTGG
rev primer emx60204/R
rev primer seq. TGACAACTTCCCCTATTTATTTATTT
fluor. primer emx60204F_VIC_s12
dye VIC
fluor. Primer seq. VIC-AGGGTTATGTTGTTTGATAGTGG
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_06 13.093
N28F2 E_06 0.0
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain