+Marker Data: emx60203

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_06
Marker Type SSR
Map Position 19.57
Annotation
Source Name Sme2.5_08933.1
Source Type genomic
Source Sequence AATTCATACCTAACACAGTTTACTTTCTCCAAGAATTTAA ATATTCATTTTGGAAAAAAAATACTAATAAAAAAATAGAG GACCAAGTTGACTTTCTCTTAAGAAAAGGGGTGTCCTCGT GTTGCACGACGGGTAATAAATAAATAAATCTTGTATTTTT TTATAAATAAAAAATTTTAAATTTGAGCATTTTAAAATAA TTTAATATAAATATTAGATATGGGATAAGATTTAAAATAG AAAAACAATTCCTTCACAATACACGCAAAGCAATTTTTAT TAGTTAAGCATCTCTTTCTCACAAAAGATATTTAAAATAT GGTTATTTTGGGATTTGCTTTGTGAAAATTCAATTTTTTT ATTTAGAAAAAAATAATAGCTTGTGTTTAATCAATAATAA AGATATTGCATGTTTTTATCAGTAAATAGTGATGGAATCA AAATTTTAATTAAGAAAATTCAAAATTTAAAAAATTAATC ACACAAATTAAAAGAATTTAATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATATATATTAAAAAATATTTTTTAAT TTTATATAAATAATATAATCTTTTGCTAAATAAAATTCAA ATCACTGTATGGTAGCTCCATCCCTATTTGTAAGTAATTA ATGTTTGAACAAAATTTTTTTATATCATCTATGAACATTG TATAAATCTTATCATAAACTTAATTATGACATATTTCATT CAATTTGAAATTATTTTATCTAATTTTGTTGTCGATATAA ATTGTTCAAAATTTATAATTTCAAAATAATTTAATTTGCA TATATATTATAGTTCATTAAAAAGACATGCAATCAAGTGA GTGGCTTATAAATAATTCGAGCAGTCAGTTTGTGAAAAAT TTTACAATAATCTTTTTTTGCAGTAGCTGTAATAAATATT TTCTTACTTTAATAAAATGCTAAATCAGTTTATTTATACA TTAATTTCAAAAAAGAAAACTACATTTTGTTGCCTTATAT TTTTTATATTATTTCATAATAATTACTTTCGCAAAGTTGA AGA
Developer NIVTS
Document
motif (AT)21
PCR product (bp) 294
fwd primer emx60203/F
fwd primer seq. TCAGTAAATAGTGATGGAATCAAAA
rev primer emx60203/R
rev primer seq. GGGATGGAGCTACCATACAGTG
fluor. primer emx60203F_PET_s12
dye PET
fluor. Primer seq. PET-ACAGTAAATAGTGATGGAATCAAAA
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_06 19.57
N28F2 E_06 1.6
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain