Typing_Method |
GoldenGate
|
454-Contig_ID |
eggplant_rep_c4927
|
454-Contig_seq (unpadded) |
TAGAACATTGACTCGGCGGCTAAATATAATATATTTGTTGAGTCAATGGAATCCACTTCACCTAACGCGTTCTCTTCTTCTTTCCCCTAAACTTCCTTCCTTCTTCCTTCCTTCCTGCAATTCCTCCATTGACANTTTGACGAGACCCTCTCCAACTGTANCANTATTATATATACATATCATGATATTGTGTAAATTAATTTTTATCAATCTCAAATATGGTTGATGCAAATATGGGCAGTGGTCAATTCCCTGAGTTTCCTAGAATTGTGACTCATGGTGGACAATATGTTCAGTATGACATTTTTGGTAATTTCTTTGAGATCACCACAAAGTATCGACCTCCTATCATGCCTATTGGTAGGGGAGCTNTATGGAATCGTCTGGTAACAAATATCTTCCATTTTCCGTTAATGCTTTTTTTGGTGGGGTAAAATTNATCGGTTCAGATCTGATATTTNATTGAAATTTTGTCATTTNTTCTCATGTGTATCTGTGTTTCGATANCCCTTTTATGTCTGTGAAAGTATTTGATTGGATACATAGAGTAAAGAGAGTACTTTATAAATATGTGGTCTNAAAAAAGAAAGAGACACTTTTCAGTTACAAACNATNAAAAGGAAANATAAANACACAANATTGAAGCTGACATATTATTATTGATATAGAAATTTTATAAATATGTATTGAATTTTGGATTGCGTATGAATGTTGAGTGACTAAATTATGGTGCTAATATGTGTGAAGCTCGGTGTTTAATGCGGAGTTGAATGAGATGGTTGCAGTGAAGAAAATTGCCAACGCATTTGATAATTACATGGATGCTAAGAGGACACTGCGCGAGATTAAGCTTCTTCGCCATTTAGACCATGAAAATGTGAGTCTTCTTTTANTAGATTAGCATTGAATGAGGATTAACTCAACACAANTTTGGATGCCTCATTTAGTATAAGTACTTCATACTNTTNTGCTTATAAAGGAAATCAAAAATGCTATGCAGGTCATTGGTTTAAGAGACGTGATTCCTCCGCCCTTAAGAAGGGAGTTTTCTGATGTTTATATTGCTACTGAACTCATGGATACTGATCTTCACCAAATAATTAGATCGAACCAAGGTTTATCAGAGGATCACTGCCAGGTAAACTCAAGCCCTGCTCGCGTAAATGCTTTCATGGATACTGTCTTTGTAGTTTCTCGAAATAATAATTTTTNACAAATGTTTGGTTTGCAGTACTTCATGTATCAGCTTCTCCGTGGGCTAAAGTACATACATTCCGCACATGTTATTCATAGAGATCTCAAACCAAGTAACCTTTTGCTAAATGCAAATTGTGATCTTAAGATATGTGATTTTGGTCTTGCTAGGCCAAACCTAGATAATGAGAATATGACGGAATATGTAGTAACCAGATGGTACAGAGCACCGGAGCTTTTGTNTGAACTCTTCAGATTACACTGCTGCCATAGATGTTTGGTCTGTGGNGTTGCATCTTCATGGAGCTTATGAATAGAAAACCTTTGTTNTGCTGGAAAAGATCACGTACATCAAATACGCTTGCTAACTGAGGTAAAGACGGATTCATGAAGATATATACAACAGAATAGGATACACCTTTTTCATGCTTTTACATGGAATGGCTTTTTATGCATGGATTCTTGATAGATGTTGTCAAATGCTTTGTTTATATTGCTGTGGATATCATCTGTTCGAGCTGTACAAATGGGAAAATTTTCCTTCTCTCTAAACAACCATTAATATCCGCTTANTTTTGGACTGCAAATAACAACTNCAACATACCATTCTGAGTGATCTTGTGAGAAACAAACGCTCATTTCTGCCTTTATTTTTCTCAGCTTCTTGGCACCCCTACAGAGTCTGATCTTAGCTTCCTCCGAAATGAAGATGCAAAGAGATATGTCAGGCAACTCCCGCAACATCCACGCAAGCAGTTAGCAGAAGTGTTCCCTCATGTGAATCCATTAGCCATCGATCTTATAGATAAGATGTTGACACTCGACCCTACTAAAAGAATTACAGGTAATATTACTCTCTGTACTGCTATTTAAGATGAGACGGNAAAACTTGAAAGATCAACTATTTTGACTCAAAAGAATCTCNTTTTGTAATTNAAAAAACCATAATATACCNTTTTTTCTTGAATATATTTACNACTTCAACTCTATGGAGTCCAATTTGCCTCATCTTTTTACNACCCCCTANTGCTACACTAAAGGATTATTCATGCCGCAGTATTTTCCANTTCATTCTCGTTTAACCTCATCGTTTAATATANTATCTGTCTTCGATTGCAGTTGAGGAAGCATTAGATCATCCCTACCTTGCTAAGCTCCATGATGCAGCTGATGAACCAGTCTGCCCNCATTCNCATTCTCTTTCGACTTTGAGCAACAAGGGATAGGAGAAGAACAGATTAAAGAGATGATTTATCAGGAAGCCTTGGCGCTGAATCCTGAATATGNCTTAAANATACAAGAGAAGTCAGTTCTTCTTCTCTTTCTTCCCTTTTGATCTGGAGTGCCTACTTTACCTAGTGTGGGTTTTCTTGCTTGAACCATCCCTCGCNAAAGTTTTNTGTTTCACAGAGTCAGTAGTCCTTTGCAACTTCAATGTAAGGCAGCCTTCAATGTGCAGCTATTAATATACCTTTCTTTATTTATTTTTNTCTTAATTATGGAGGTATTCGAGCTAGCTTGTACCTCGACTATTTCATTGAATTATATCCACTACCTCCCATCAGCACAGACATTTATATGTCTTCCGCTCATTCTTATGACTTGTATCTTGTGTCCTGTTTTCAGGTTGTNTGTAGTTTCTATTTTTTGTTNTAGTTAAGAGGGCAATTCGGTNGCACTAAAACTCTTGCTATGTGCTGGGCTCGATGTATTATGTACAGTGTATAGAAAATCTATCAAGAATTTATTTGTCATTTTGAAGATTTGGGTGTAAATTGAAGGTATTACCAGGGGNTGACAAAATATCTATGTAATAGTTAAGAAGAAAGAAGAAGATAGTATAAAGAGGGTCACTTGTTAACTTTNCTGTATTCAAGTTGTATTTACAAGAGATAAGTATAAAANATACGCCTAAACTATTCTCTTTTTGTGAGTTCATACCTAAATTATTAGGAGTGT
|
SNP_position |
924
|
sequence_for_GGdesign |
AGACCATGAAAATGTGAGTCTNCNTTTA-TAGATTAGCATTGAATGAGGATTAACTCAAC[A/G]CAA-TTTGGATGCCTCATTTAGTATAAGTACTTCATACT-TT-TGCTTATAAAGGAAATC
|
GGdesign_Final_Score |
0.658
|
Ilmn_Id |
4927_924-0_T_F_1967851413
|
allele_1 |
A
|
allele_2 |
G
|