+Marker Data: gg4927_924

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_06
Marker Type SNP
Map Position 43.374
Annotation
Source Name FKO03-01.2890.C2
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c4927
454-Contig_seq (unpadded) TAGAACATTGACTCGGCGGCTAAATATAATATATTTGTTGAGTCAATGGAATCCACTTCACCTAACGCGTTCTCTTCTTCTTTCCCCTAAACTTCCTTCCTTCTTCCTTCCTTCCTGCAATTCCTCCATTGACANTTTGACGAGACCCTCTCCAACTGTANCANTATTATATATACATATCATGATATTGTGTAAATTAATTTTTATCAATCTCAAATATGGTTGATGCAAATATGGGCAGTGGTCAATTCCCTGAGTTTCCTAGAATTGTGACTCATGGTGGACAATATGTTCAGTATGACATTTTTGGTAATTTCTTTGAGATCACCACAAAGTATCGACCTCCTATCATGCCTATTGGTAGGGGAGCTNTATGGAATCGTCTGGTAACAAATATCTTCCATTTTCCGTTAATGCTTTTTTTGGTGGGGTAAAATTNATCGGTTCAGATCTGATATTTNATTGAAATTTTGTCATTTNTTCTCATGTGTATCTGTGTTTCGATANCCCTTTTATGTCTGTGAAAGTATTTGATTGGATACATAGAGTAAAGAGAGTACTTTATAAATATGTGGTCTNAAAAAAGAAAGAGACACTTTTCAGTTACAAACNATNAAAAGGAAANATAAANACACAANATTGAAGCTGACATATTATTATTGATATAGAAATTTTATAAATATGTATTGAATTTTGGATTGCGTATGAATGTTGAGTGACTAAATTATGGTGCTAATATGTGTGAAGCTCGGTGTTTAATGCGGAGTTGAATGAGATGGTTGCAGTGAAGAAAATTGCCAACGCATTTGATAATTACATGGATGCTAAGAGGACACTGCGCGAGATTAAGCTTCTTCGCCATTTAGACCATGAAAATGTGAGTCTTCTTTTANTAGATTAGCATTGAATGAGGATTAACTCAACACAANTTTGGATGCCTCATTTAGTATAAGTACTTCATACTNTTNTGCTTATAAAGGAAATCAAAAATGCTATGCAGGTCATTGGTTTAAGAGACGTGATTCCTCCGCCCTTAAGAAGGGAGTTTTCTGATGTTTATATTGCTACTGAACTCATGGATACTGATCTTCACCAAATAATTAGATCGAACCAAGGTTTATCAGAGGATCACTGCCAGGTAAACTCAAGCCCTGCTCGCGTAAATGCTTTCATGGATACTGTCTTTGTAGTTTCTCGAAATAATAATTTTTNACAAATGTTTGGTTTGCAGTACTTCATGTATCAGCTTCTCCGTGGGCTAAAGTACATACATTCCGCACATGTTATTCATAGAGATCTCAAACCAAGTAACCTTTTGCTAAATGCAAATTGTGATCTTAAGATATGTGATTTTGGTCTTGCTAGGCCAAACCTAGATAATGAGAATATGACGGAATATGTAGTAACCAGATGGTACAGAGCACCGGAGCTTTTGTNTGAACTCTTCAGATTACACTGCTGCCATAGATGTTTGGTCTGTGGNGTTGCATCTTCATGGAGCTTATGAATAGAAAACCTTTGTTNTGCTGGAAAAGATCACGTACATCAAATACGCTTGCTAACTGAGGTAAAGACGGATTCATGAAGATATATACAACAGAATAGGATACACCTTTTTCATGCTTTTACATGGAATGGCTTTTTATGCATGGATTCTTGATAGATGTTGTCAAATGCTTTGTTTATATTGCTGTGGATATCATCTGTTCGAGCTGTACAAATGGGAAAATTTTCCTTCTCTCTAAACAACCATTAATATCCGCTTANTTTTGGACTGCAAATAACAACTNCAACATACCATTCTGAGTGATCTTGTGAGAAACAAACGCTCATTTCTGCCTTTATTTTTCTCAGCTTCTTGGCACCCCTACAGAGTCTGATCTTAGCTTCCTCCGAAATGAAGATGCAAAGAGATATGTCAGGCAACTCCCGCAACATCCACGCAAGCAGTTAGCAGAAGTGTTCCCTCATGTGAATCCATTAGCCATCGATCTTATAGATAAGATGTTGACACTCGACCCTACTAAAAGAATTACAGGTAATATTACTCTCTGTACTGCTATTTAAGATGAGACGGNAAAACTTGAAAGATCAACTATTTTGACTCAAAAGAATCTCNTTTTGTAATTNAAAAAACCATAATATACCNTTTTTTCTTGAATATATTTACNACTTCAACTCTATGGAGTCCAATTTGCCTCATCTTTTTACNACCCCCTANTGCTACACTAAAGGATTATTCATGCCGCAGTATTTTCCANTTCATTCTCGTTTAACCTCATCGTTTAATATANTATCTGTCTTCGATTGCAGTTGAGGAAGCATTAGATCATCCCTACCTTGCTAAGCTCCATGATGCAGCTGATGAACCAGTCTGCCCNCATTCNCATTCTCTTTCGACTTTGAGCAACAAGGGATAGGAGAAGAACAGATTAAAGAGATGATTTATCAGGAAGCCTTGGCGCTGAATCCTGAATATGNCTTAAANATACAAGAGAAGTCAGTTCTTCTTCTCTTTCTTCCCTTTTGATCTGGAGTGCCTACTTTACCTAGTGTGGGTTTTCTTGCTTGAACCATCCCTCGCNAAAGTTTTNTGTTTCACAGAGTCAGTAGTCCTTTGCAACTTCAATGTAAGGCAGCCTTCAATGTGCAGCTATTAATATACCTTTCTTTATTTATTTTTNTCTTAATTATGGAGGTATTCGAGCTAGCTTGTACCTCGACTATTTCATTGAATTATATCCACTACCTCCCATCAGCACAGACATTTATATGTCTTCCGCTCATTCTTATGACTTGTATCTTGTGTCCTGTTTTCAGGTTGTNTGTAGTTTCTATTTTTTGTTNTAGTTAAGAGGGCAATTCGGTNGCACTAAAACTCTTGCTATGTGCTGGGCTCGATGTATTATGTACAGTGTATAGAAAATCTATCAAGAATTTATTTGTCATTTTGAAGATTTGGGTGTAAATTGAAGGTATTACCAGGGGNTGACAAAATATCTATGTAATAGTTAAGAAGAAAGAAGAAGATAGTATAAAGAGGGTCACTTGTTAACTTTNCTGTATTCAAGTTGTATTTACAAGAGATAAGTATAAAANATACGCCTAAACTATTCTCTTTTTGTGAGTTCATACCTAAATTATTAGGAGTGT
SNP_position 924
sequence_for_GGdesign AGACCATGAAAATGTGAGTCTNCNTTTA-TAGATTAGCATTGAATGAGGATTAACTCAAC[A/G]CAA-TTTGGATGCCTCATTTAGTATAAGTACTTCATACT-TT-TGCTTATAAAGGAAATC
GGdesign_Final_Score 0.658
Ilmn_Id 4927_924-0_T_F_1967851413
allele_1 A
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_06 43.374

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain