+Marker Data: SOL7056

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_05
Marker Type SNP
Map Position 27.547
Annotation
Source Name CHX05H11A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd CGTGATCACCTTTTTCAGACCATT
STS_primer_rev GCCTTGTATTCCATCTTTGTTGCC
amplicon_seq NNNNNNNNCCGTTTCTCCAGCCACCTTCACCACAGTAGTGTTCAGTTTTAACCACAAACTTTAAATAATGTAAGCAGAAGATAACTAAAATAAACTATCCAGTTAATATCAGTTATGGGATCATTGACTGATTTATTGGGTTCGGATAATCTGCTATGTAAAACATGCTGTTAAACTTTTGGGTGAACATTGATATCGGGACCAGGTTGTTAAAAAAATTAGAAAAAAATAGTTACTTAAATAGCCGCCCACACAACCGATTAAACCACACAAAGCCTATGAATGTATAATATATGTATGATTCATGTATAATATGTATATAAAATCCGTGCATAATCAATGTATATGGCTACAGAAGTAAACAATGAATTCATCCAGCTATTTGTGTAAAGATCCCAAAAACTCTTTACTCCTTCACAAGTAAGTCCAAAGAGATGAGCACCTTAGGGTCATGGATGAAGCTATGACCAGAGCGAGCATTTGGCGGCAATTCACCAGTGCAGGCAACCTTCAAGCACTCAATTATAGTCTGCCATAGCAAGAAGAATAATGAACATACAACTTACTCTGGCAATGAAAAGACTTTTTTTTATCACATGAAAGTCATCTTCAACTAATTAACTGGACTCTACCCTGATATCTCCTAGTTGACAAANATTATGATGGATGCAGAGCACAACTAAATTTTATCTTCAATGCATGAACAAATAATTTTAAAAACAAACGGCTGGGTGACCAAAAATTGATGAACTTGTTGAAATGCTATAATCAAGCCAAACAAATAAAGTATGAAACATGTTTAAATTTTGTAATGGTCAGTTTTTTNACACTAAAACTCTAATTTCTTTTTACACAAAAACTCTAATTTCTTATAGCTAATCACTTTGTCAACTATAGCTTCCACTACAGCGCTTAAAGTGCCAAATCCGAGCTTAGACAAATACCGGCAGTTGCATTTTAAGTAACCTGACAGTATAAAAGAATTTTACACCGCCACTTCATAGAACTTATACTTGAAAGGGTTTAGAACCAAAATTTATGCAACCATTAATACCATGCACTAAAGCCTCAGCAGAACAAAATACCCAACTTGAGCTTAGAGAATCACCTACAGTTGCATTTTAGTGTAAATTTCTTTTTACANAGTCAATGGGCGGAGCCAGGTAAGGCCATGGGATTCATCTTACACTGTTTACATATGATTAAAATTATATATAGCATATGTTGAACTCCCTTGATCTTCTTTGCATGTTTATTTCTCATATTTTGAACCACTAAGTAAAATACTGGCTCCGCCACTTACACAATCAGTTCATGGATCTTACAATCGCTTAAAATAGACGTTCAACTCGAACAAAACTAGAATTAAAATAATAAAAAGTAAATACATGAATGAAGTTGAGCAACAAATTTAGGCAACAACTAAAATACCTTACGAACAAACATTTTATGCAGAAATTACACTTCCATAGCAN
SNP_position 938
allele_1 C
allele_2 G
ASP_primer_S GCGGGCCTTAAAGTGCCAAATCCGAGCTTAGAG
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCCTTAAAGTGCCAAATCCGAGCTTAGAC
Common_primer CAGGTTACTTAAAATGCAACTGCCGGT
enzyme Native Taq
dye SYBR Green I

Line allele-1 allele-2
AE-P03 G G
LS1934 G G
Nakate Shinkuro G G
WCGR112-8 C C

Population Linkage Group Position
LW2010 E_05 27.3
LWA2010 LWA_05 26.702
LWAE2012 E_05 27.547
LWF2_2022 E_05 28.4

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain