Typing_Method |
Tm-Shift
|
Marker_Class |
SOL
|
STS_primer_fwd |
CGTGATCACCTTTTTCAGACCATT
|
STS_primer_rev |
GCCTTGTATTCCATCTTTGTTGCC
|
amplicon_seq |
NNNNNNNNCCGTTTCTCCAGCCACCTTCACCACAGTAGTGTTCAGTTTTAACCACAAACTTTAAATAATGTAAGCAGAAGATAACTAAAATAAACTATCCAGTTAATATCAGTTATGGGATCATTGACTGATTTATTGGGTTCGGATAATCTGCTATGTAAAACATGCTGTTAAACTTTTGGGTGAACATTGATATCGGGACCAGGTTGTTAAAAAAATTAGAAAAAAATAGTTACTTAAATAGCCGCCCACACAACCGATTAAACCACACAAAGCCTATGAATGTATAATATATGTATGATTCATGTATAATATGTATATAAAATCCGTGCATAATCAATGTATATGGCTACAGAAGTAAACAATGAATTCATCCAGCTATTTGTGTAAAGATCCCAAAAACTCTTTACTCCTTCACAAGTAAGTCCAAAGAGATGAGCACCTTAGGGTCATGGATGAAGCTATGACCAGAGCGAGCATTTGGCGGCAATTCACCAGTGCAGGCAACCTTCAAGCACTCAATTATAGTCTGCCATAGCAAGAAGAATAATGAACATACAACTTACTCTGGCAATGAAAAGACTTTTTTTTATCACATGAAAGTCATCTTCAACTAATTAACTGGACTCTACCCTGATATCTCCTAGTTGACAAANATTATGATGGATGCAGAGCACAACTAAATTTTATCTTCAATGCATGAACAAATAATTTTAAAAACAAACGGCTGGGTGACCAAAAATTGATGAACTTGTTGAAATGCTATAATCAAGCCAAACAAATAAAGTATGAAACATGTTTAAATTTTGTAATGGTCAGTTTTTTNACACTAAAACTCTAATTTCTTTTTACACAAAAACTCTAATTTCTTATAGCTAATCACTTTGTCAACTATAGCTTCCACTACAGCGCTTAAAGTGCCAAATCCGAGCTTAGACAAATACCGGCAGTTGCATTTTAAGTAACCTGACAGTATAAAAGAATTTTACACCGCCACTTCATAGAACTTATACTTGAAAGGGTTTAGAACCAAAATTTATGCAACCATTAATACCATGCACTAAAGCCTCAGCAGAACAAAATACCCAACTTGAGCTTAGAGAATCACCTACAGTTGCATTTTAGTGTAAATTTCTTTTTACANAGTCAATGGGCGGAGCCAGGTAAGGCCATGGGATTCATCTTACACTGTTTACATATGATTAAAATTATATATAGCATATGTTGAACTCCCTTGATCTTCTTTGCATGTTTATTTCTCATATTTTGAACCACTAAGTAAAATACTGGCTCCGCCACTTACACAATCAGTTCATGGATCTTACAATCGCTTAAAATAGACGTTCAACTCGAACAAAACTAGAATTAAAATAATAAAAAGTAAATACATGAATGAAGTTGAGCAACAAATTTAGGCAACAACTAAAATACCTTACGAACAAACATTTTATGCAGAAATTACACTTCCATAGCAN
|
SNP_position |
938
|
allele_1 |
C
|
allele_2 |
G
|
ASP_primer_S |
GCGGGCCTTAAAGTGCCAAATCCGAGCTTAGAG
|
ASP_primer_L |
GCGGGCAGGGCGGCCTTAAAGTGCCAAATCCGAGCTTAGAC
|
Common_primer |
CAGGTTACTTAAAATGCAACTGCCGGT
|
enzyme |
Native Taq
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dye |
SYBR Green I
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