+Marker Data: emx50204

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_05
Marker Type SSR
Map Position 14.253
Annotation
Source Name Sme2.5_00584.1
Source Type genomic
Source Sequence ATGAGCTCAAGGTATGTTTTTTTTGTAAAAAAAAATTTAT ATGTATATATCTGTATGTGTGTGTGATATAGATAAAATTT GAAGAGTTGATTAATTTTTTAATGTGACTTTAAAATATAT GAAATTGTTAATTGATGTAATTTATAATATTTTATTTATA TAATTTTTAATAATATATATTGCTCCATCTATTTCAATTT ATGTGGCACTGATAAAATTTTAAAAGTCAATCAATTTTTT TATACATTTAAATGGTTAGTTATTGTGTTTTATGGTACGT TTTACATCATTTTTAAATAATATATGTTACTCACTCTGTC CTAATTTACGTGATATTGATAAACTTTCGGAATTCAATTT AATTTTTATACGTCTTTTAAATTTTTAAGTTGTCAATTAT TGTGAATTATAATACTTTTTACCTTTTTTCAAATGTTATA TCTTACGGAACTTTTTGTCTCAATTTTTTGTGGTGTTGAT AGAATTTTGAAACTTAACAAATATATATATATATATATAT ATATATATATATATATCTTTTAAGTTGTTAATATAAAAAA ACATATTAAAAAAATAAGATGAATAAGTTAAAAAAGAAAG AAGAAAAAATACAAAAATATTCTTAAGTAGAAGCAAACAT TTGGAGAGTGTTTTTATAAATACTTAAAATAAATCTATTT CTATTAGTAGAAAGACACTATATGCTTTTATAATCATTAA AATATCAAAATGATTTTCACTTTATGATCTTCACCAATTT ATAATTATTTTACATACTAAATTATGTTATTATTATTTGT ATTCCTTTGATGTTTTATAATTTATTGGTAATTTTACTTT CACGAGAATATTTTTTCAAAATTTTTAATCTAATTATGTC ACAAATTAATTTGTATATAACATAGACAATAGAGGTGGGA AAGGGACCATTGTGTTTTTATTAAGTGGAGAAATTAGAGG ACCACATAATCCTGTCCTTTCTTTATCATTTCCTAGGCCA AGTAAATAACAATAATACTAAATCATAGAAAACCTTA
Developer NIVTS
Document
motif (AT)18
PCR product (bp) 207
fwd primer emx50204/F
fwd primer seq. CGGAACTTTTTGTCTCAATTTTT
rev primer emx50204/R
rev primer seq. AACACTCTCCAAATGTTTGCTTC
fluor. primer emx50204F_VIC_s10
dye VIC
fluor. Primer seq. VIC-AGGAACTTTTTGTCTCAATTTTT
PCR condition 94C_3min->(94C_30s->65C_60s,-1C/cyc->72C_60s)x10->(94C_30s->55C_60s->72C_60s)x30->75C_5min->10C
polymerase Roche Taq
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_05 14.253
N28F2 E_05 12.9
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain