+Marker Data: gg2497_1724

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_05
Marker Type SNP
Map Position 20.06
Annotation
Source Name FKO03-01.11677.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c2497
454-Contig_seq (unpadded) GGATTATTTGTGAAATTGAGCAGATGTTGATAGGACAATTGGACCCTTTAACAGAGCAACAAGTAGTTGGAATATACAGCCTCCAGCAATCTTCCCAACAGGCAGAGGAAGCCCTTTCGCAGGNGACTGGAACAACTTCAACAATCNTTTAATCGATACTATTGCCACTGCTTCTCTCCATGATGGAATNGCATCACATGGCTCTTGCNATTGGGGAAGCTCTCCAACCTTGAAGGATTTGTTCGTCAGGTAACATTAGTCCTGACTCTACGCGTGACTTCTCTTATTCTTCCTTTTCATTTGATATCTATATCATCAGTNCATGGAGACAGGAGTTTCATCATTTGANTCACTTCTTATTTGTGCATATATCCAGGCTGATAANTTTGAGACAACAAACATTGCATCAATTACACAGAATATTGACAGTTAGGCAAGCAGCCAGGTGTTTCTTGGTGATTGGAGAATATTATGGTCGACTACGAGCTCTAAGTTCTCTGTGGTTATCTCNGTCCACGAGAGTAAGATTCTACAAGTAACATGTTTTTGTCATTNTTCACATTAATTAGTGTAATTAACCGTAATCTTATTTTAATTATCTATATGGNTTTAGGACACTGATCGCGGATGATAATTCTTGTCAAACAATAACGGGATTACAAATGGTACAATCTTCTCAGAACCACTTCTCAAATTTCTGATCATATCATTATTATGAGCCAGCTAAATCTCTTCATCATGATGATCAAATTGTATTTCTGAGAGCTACGTACTTAGTTGAGTNNTTATTTTTAAATNTATTTNNTGTTAGCTTCTTAATATTATGACTTAAGTGATCTTGTAAATGTAAGGAATCAAGAATATGTGCAAGAGGAATTGAAGTTACCTTTAGGGTGATCTGTTGGTCCAAAATCAGGTTATTCTAGGCTATAATTAGGATTTTGCATCTACAACAACATACCCAGTGAAATCCCACAAGTGAGGTCTGGGAACGGTAGAATGTACGCAGACCTTACCACTACCAAAGTGGAAAGGCTGTTTCCTAGGGAGGATGTTTGCATCTAGCAATATAAAAAATATAGTTAATGCTTTCTTGATGCATTAATTTGTAAATAAATATACATTGATCAAATTAACGAGTGAAAGCATAAAGAACAATACAAACATAAATAAGGAGCCCNCAATGGAACGAACATCACAAGTGGAACAACAGCTCCATAAGTATGCATACTTCCACATCCCAAAATTCCAAGCTTAATTTGAACCACATTGATCAAAGCAAGCATCAAAAAGACCGACCCGAGAACCGACCCGGCCGCCGAGACCAAGTACCCGACCCGGAGAGCCTTNTTTGTTGATTAGGGCTAGGTCAAAAGTGAAGACGGTGGGAAAGTGAGCTGACTTAGCCAGTCGAATAGCCTGCTTGAGACACAAGGCAATGAGNGCTTGAAAAGAGGAAACAACTAAATGAGTACACGTGGAAGGCTACAAGGTCCTCCGCGACCTTGGGCCCAGCTAAACAGCTCGGGTCTTGGGAGAGACTGTTGCCCTGGTCGTGTGGGTTCCAAGCTAGCCCGATGAACACGGCTAGGGTGAAAAGGGAGTTAACGTTGATGATTCCATCGAGCGTTGTGATGTGGATGGTGGTGCCGAGTTTTGGGATAGCTCCTTCGCACATTTTGTCTCAAGGAACGAATCAGCCAGAGGAGGATTCAGGATTTTGATGGTTATAAGTTCCTGCAACGACTTCAAGTAAATATGACACTAATAACTAAGTTCACAAAATCACAATCAAACACTTNAGAAAATTTTNTCAANATGTATATACAGGATGTGAGTAAAGAGTATGATTTTANATAGTATGATTAAATTTCAATTAAATTTTAACAATTAAAAATTGGTAAATAGTATGATTCTCCTCTCCTTTTNTGGGAATTTCTACTTGTTTTAAATATTCATATTAGAATTTAAATTCAAAAATTAAAAACGATATATATTTTAGAAAGGCATATACATAAGTATATTTTTTAATTTGATCTCACTTCATATTTTTTTTCTTCAATTTTGATGGGCACAAACAAACTCTTNAACAACAACAACAATATACCCAATGAAATCTCACAAGTGGGGTCTNGGGAAGGTAGAATGTACGCAGACCTTACCACTACCTAAGTAAAAAGGCTGTTTTCTGGAAACCTCATGCTAGAAATAAAAATACAACTACTCAACCCTGCTGCCAGCCTTGCCTGCACCTTAGCAAAGCTGCTGCCATGTTGTATAAAT
SNP_position 1724
sequence_for_GGdesign GCTCCTTCGCACATTTTGTCTCAAGGAACGAATCAGCCAGAGGAGGATTCAGGATTTTGA[A/T]GGTTATAAGTTCCTGCAACGACTTCAAGTAAATATGACACTAATAACTANGTTCACAAAA
GGdesign_Final_Score 0.98
Ilmn_Id 2497_1724-0_T_F_1967851348
allele_1 A
allele_2 T
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_05 20.06
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain