+Marker Data: gg17707_956

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_05
Marker Type SNP
Map Position 49.247
Annotation
Source Name FKO03-01.10478.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c17707
454-Contig_seq (unpadded) CGTTTTTGAACTTGGCTTAACTTTGGAGGTTCCTTTATGACCTTAAAACACATTTAATACACTTTAAATACTTAGGAAAGAACCTTAACATATATTCACTACTTAGAATTTTTTGATCACCTAACTTCATAGAATCTCATATCAAGACTCAATCAGTAAGGAAGGTTTCGACTTAACTTTATGCTAAGGAATTCTTATGGCCTTAATTCATCTCAAATCTATTATTCCCCTATAGATTTGGCCTTAACACCTATATGCAAAGTTAGTACCACTTGTATGATCCTGTATGCATAAGAAGAATGGTTCAAATCTTAGCTTAGAAATTTTCAAGGTGTTATACCCTTACCCCCGAGCNACNNNNNNNNNTTTTATNTCTTNCAAAATNNATTTTTTAAAACTAAATTTTTGAGCTCAAGGCTCATTTTATTCGAGCAAAACGAAATTGTCCNAAACNTTAACAAAGTAAAATAATAAAAGTTAGNNCAANATAAAACNCCATCAACCTGGCCCACTATCCCTATTGAAAATATGTACACTCATATATTCTATACTATTCGTTCCTTTCAATTTTCCAGTTCATATCTCTAAGCNATGTCTTCCTTCTGGAAGACTTTTCTCTTCGTCTTCGTTCTTTGATGTGTCTTCAGATCTTCATATAGCTTCTGATATTCACTTTTCCAACAACTTCCAAAAGGCATGAAGAAGCTTTTATTTGTATCATTTCCTCTTTTTGCTTCAATATCCTCATGTAGCTCTATGGTTTTAGGNTAGTGGATCCCTCTTCGTCCACTTCAAAACTAATGGAGGAGCATACATCTCTTTCTACTTCNAGACTTAGGNTACTNTCTTTTGTTTNTATTTTTTTNTGGNAGNATTTTCCTTCCTTTTATGTCAATATTAAATTNCTTCTCTATTAAACCAGTGAATGTTGCAAGATCGAACCATCTGAACATGAGGACCCTGTTGATTCTGCTCCTTGTTAATTGTACCAATGTAATTACAAAAACTTTTGNAAAGACTNAAAGGTCTCCTTTTTGTGNACAAAACTCNTTTTTGNAGTCTTTTTTGATTTGATCCTGGACTAAGATGCCCACAGTGATTTGAGCCAAAAAAGGNCTCAAATCTTGTGAAATATTTTGTTGTGTNGGCTATCCTGTATTTTGTAGAGGCTAACTTATGCTTGTTCTGTATATACAACTATGAAGCTATGACGATTAGCTTGTATTTAGCCTGTAATCTAATATGCACACCTGAATTGTGCAAATATGTGATACTTTTTTAAAACTGCTTAATTTGCCTTGTTCTAATACATAGATAGCCCACTTGCATCTTGTCCATATTCATCTGTACTTTACACTATTTACGTAATTAGTTAAATTGGTTGTAGTTGCTTCTGTTACCC
SNP_position 956
sequence_for_GGdesign ATTAAATT-CTTCTCTATTAAACCAGTGAATGTTGCAAGATCGAACCATCTGAACATGAG[A/G]ACCCTGTTGATTCTGCTCCTTGTTAATTGTACCAATGTAATTACAAAAACTTTTG-AAAG
GGdesign_Final_Score 0.896
Ilmn_Id 17707_956-0_B_R_1967852768
allele_1 A
allele_2 G

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_05 49.247

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain