+Marker Data: gg15087_1554

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_04
Marker Type SNP
Map Position 88.977
Annotation
Source Name FKO03-01.6814.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document
Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c15087
454-Contig_seq (unpadded) AGTTTAGCACCTCTCCAAAGGAAGTGAAGACAATATTAAAGAGTGTTAGTTGGAAAAGCGAGGTCATTTTGGTAATTAAACTCCCTGCCTCATTGTATAAGATGAGGTTGCCTCAGCATGTTTGATACACCACACTAAGAATTCTTGAGAAAGTTGTTCAATTTCAACTCAAAAATATTTTCAAGTTTTATTGTACCAAATGGCTGAGAAAAGCAAAGTTCTAATCATTGGAGGAACAGGGTATATTGGTAAATTTGTAGTGGAAGCAAGTGCAAAATCTGGACACCCAACATTNTGCTTNTGGTTAGAGATGCCACAGTTTCAGACCCTGTTAAGGGCAAAATTGTTGAGAATTTCAAGAATTTGGGTGTCACTATTATTAGTGTATGTATTACATAATAATAATATTGTTAATGAATTGTACATGCAAGTANTTTTAATTTCTTGTTTTTGATCAGGGGGANTTTGTATGATCATGAGAGCTTGTTGAAGGCTATAAAACAAGTGGATGTGGTGATATCAACTTTGGGTTCAATGCAATTGGCTGATCAAGTTAAGATTATTGCTGCTATCAAAGAAGCTGGAAATATTAAGGTTAATTGCTTCTTATTTTTCATTACTTGAGCATCCAATTAGCATGAGTATTCTGTTATTATTGCCTTCCGTGCCCACATTGGACTCAGGCCGATTTATGGGGTGTGGGGGTGTGTGGGGTGGGGTGCATGTGTGTTGCTTGAACCGAGACGTTTGGTTAAGGATGAATGGATCTTATTCATGAATTTGTAGATCACATTTGAATTAGAGAATCTAGAGTACTATCAAAGCAATCTTAAATCTATGTTGCACGGATTCTTCAATGATGTTGATGGTTGCTTGTTGGATTTTTTAAAGTGCATTTGGGAGAGTCCGAGCTAACATAGGCATAAAATGAGTTAGACTAGGTAGCTGTTAACAAGTTTTTGTAAACGCCTCAAATTTGAAAGAGTATTTCACTAGAAAATCTGAAAATGATCAAGATAATCTGTTCACAGAGCTAAATTATCTTGTGCTCNAAAATATTTCAGAGATTCTTCCCTTCGGAGTTCGGTATGGATGTCGATAAGATGAATGCTGTGGAGCCAGCAAAGTCTGTATTTGCTGTGAAAGTCCAAATCCGGAGAGCTATTGAGGCGGCAGGAATTCCTTATACTTATGTCTNCATCCAACTGTTTTGCTGGTTATTTCTTACCAACTTTGGTCCAGCCAGGAGCCACTGCTCCTCCTCGAGACAAAGTCATCATTCCTGGAGATGGAAATGTTAAGGGTAACTCGAAAAAATTCCTTACTAGAACAAGTTTATGACTGAATCACTCATTTTCTTGTCCATTTTGTTCTGTTTNCTCTGCAGCCGTATTCAACGAAGAGNCATGACATTGGCACCTATACCATTAAGGCTGTTGATGATCCGAGAGCATTGAACAAGACCCTTTACATCAGGCCTCCCAAGAATACCTTATCGTTCAACGAGCTTGTGGCGCTATGGGAGAAACTGATTGGTAAAACTCTCGAGAAAATCTATGTTCCAGAGGAGCAAATTCTCAAAGACATCCAAAGTCAGTACTCTTTATCATTAGTTTTAAGTCAAAGATTGTTTCTTTTCNGATTTCACACAGGNTAATCCTGNACATTGTGTGTTNTGTATAATGTTGCAGCATCTCCAATGCCTATCAATGTCATACTAGCAATCAACCACTCCACATTCGTGAACGGTGATCAAACCAATTTTGAGATCGAGCCNATCGTTNTGGGGTTGAGGCCTCCCNAACNTTTATCCTGATGTCAAGTACACCACCGTCGNAAGAGTANCCTACNGCCANCTTTGTCTAAATATTCACACGTTTGATGTCTCCGATCACTTGAATNAAAATTGCTAGACGATGAGTGTTGTCNAAACATATGAGNTTCCTGTTAAGTATGTCATCGGAGACACGTAAAATGGTANTGTTTTAAGTCTGNTTTTACCATCCATACTATGATGAAACTACATAAAATGGAAGACATTTGTGTCATTTTGCTTTTCCCTTGTTGCTCTACCATCATGTACCAGATTTTAAGTTGTGAGGTATTATGNAAAGCGTCTTGTTGTCAATAAGGATCAATCAAAGAGGACAAGCTACCGTTTATATATGNAGGCTTGNCTTATTTCAGTTTTCTCTAGTTTTATCATATGGAACATAATCAACGATCGAGAAGACATGAGTTCCCTAACTGTAATAACATCTATGATACANTTTTCCGTTTTGTTTGTTGACTCTTCATTTCATAGTATCCCGATCAAATAGCTGATGCG
SNP_position 1554
sequence_for_GGdesign ATCGTTCAACGAGCTTGTGGCGCTATGGGAGAAACTGATTGGTAAAACTCTCGAGAAAAT[C/G]TATGTTCCAGAGGAGCAAATTCTCAAAGACATCCAAAGTCAGTACTCTTTATCATTAGTT
GGdesign_Final_Score 0.949
Ilmn_Id 15087_1554-0_B_R_1951735402
allele_1 C
allele_2 G
Line allele-1 allele-2
Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_04 88.977
DB Program Definition E-Value
EST Name Species Strain