Typing_Method |
GoldenGate
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454-Contig_ID |
eggplant_c12974
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454-Contig_seq (unpadded) |
TCCAGGTAGTATAGAGATATAGATTCATAATTNTCTTGCAAGCTTTNGATGTGTAGAAGTACTTTCTGTGAATTTTTTCCNTAATGTTCAGGCCAGCCCATCTGATCCTGAGAACTTTCCGTTTGTTGTATTGGGGAATAAGATAGATGTTGACGGTGGCAATAGTCGAGTGGTAAATTAATTTCTCGATGATTCTTCCTCACTTGAGTGATGCTTTTATTGAAAATTGGTATCTTTGGATGGGTGTAAATGGAGAGATCATTGGTTTCATACGATTGGTTTGTGCGGATTACAGGTGTCTGAGAAGAAAGCGAAGGCATGGTGTGCCTCCAAGGGGATACCTTACTTTGAGACCTCCGCAAAAGAGGGATTCAATGTGGATGCAGCTTTCCAGTGTATAGCTAAAAATGCTCTGAAAAATGAACCTGAAGAAGAAATGTGAGTACCTCTTCCAAACAGTATAGTATCTATATTTCTAATTTATCTGGGAAGGGGATGCATTTGGCTTACAGCAGTGTAAAATATTTTGAACCATAGTTGGTTCTTAAAGGCCTGCGCTTATGACTNGGGAAAAAGAGAAAGTGCTTGTTGTTTTAGAAGTGGAAGTGTCTGAAGAACTATTTCAAAGGAGTCAGTCAATGGCTTTGTCATNGAAAAAACTGTCTTCTAGGCGAGGGATGATCTCAGAAAACTGATAAGTCTTTGATCTTGATAGATATATTTTGATGNAAAATTTAATCAAGGACCTTGAAAATTATTTCTTCTGCTCCCCGNTTGATTNGTTCTATTTTTCATTTGGAGAATAATTTGACGAAATTCGTTCTGAAGTTGGAAATACCTTAACAAGCCTTTATAATTTAACTTTAGAAGTTTGAAAGTCATTTGAGAGGCATAATGAAGTCGCCAATTTTTGNTATGTACATTTAGGATCCCCTTTAAGATTTTNTGTTGNAATTTAATTGNCNTCNTTTTCATNCTTTTCCCTTGTAGATACCTTCCGGATACTATTGATGTTGCTGGAGGAAATCAACCAAGATCAACAGGATGTGAATGCTGAAGNAGTTCCNTTTGGTTGNCATTATTCCGTAGATTGCTAGTGCAAGTTCCCTTTATCTAATGATTTATTTACTACNAAGACAGTTAAATTCTCTTCTATCTGCTTTNTAGATTCTGGATTCCTCTCTTCAGAAGTGTAATTANTGATGNTTGCNACCTNTATTTTTNTCCCCNTCCTTGGATACTTATCTGTGTTCAGACTTATGATGATACATGATAATATACTCATGCACTTGACTGCATGTTTNAAAATGTTGCCCTTTTCCGGTGATGCAAGAAATTGCTCTNAAAAAATGAGTTGGGTGNAAAACAGATGTTTGACTTGTTTTTGCACGACTCATTTCAGATTGTATGCTGTATGAATGGGCTTGTAAATTAATGTTTGAACTTTGAGCACTGACGTATTTTGTGGTCAACAACTAACCATATATGACAGGAGATAGCTCAGAAGGACCAGACAAA
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SNP_position |
1162
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sequence_for_GGdesign |
GTTCCCTTTATCTAATGATTTATTTACTAC-AAGACAGTTAAATTCTCTTCTATCTGCTT[T/C]-TAGATTCTGGATTCCTCTCTTCAGAAGTGTAATTA-TGATG-TTGN-ACCT-TATTTTT
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GGdesign_Final_Score |
0.67
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Ilmn_Id |
12974_1162-0_B_F_1967850958
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allele_1 |
T
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allele_2 |
C
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