+Marker Data: gg12974_1162

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 114.69
Annotation
Source Name FKO03-01.13813.C2
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_c12974
454-Contig_seq (unpadded) TCCAGGTAGTATAGAGATATAGATTCATAATTNTCTTGCAAGCTTTNGATGTGTAGAAGTACTTTCTGTGAATTTTTTCCNTAATGTTCAGGCCAGCCCATCTGATCCTGAGAACTTTCCGTTTGTTGTATTGGGGAATAAGATAGATGTTGACGGTGGCAATAGTCGAGTGGTAAATTAATTTCTCGATGATTCTTCCTCACTTGAGTGATGCTTTTATTGAAAATTGGTATCTTTGGATGGGTGTAAATGGAGAGATCATTGGTTTCATACGATTGGTTTGTGCGGATTACAGGTGTCTGAGAAGAAAGCGAAGGCATGGTGTGCCTCCAAGGGGATACCTTACTTTGAGACCTCCGCAAAAGAGGGATTCAATGTGGATGCAGCTTTCCAGTGTATAGCTAAAAATGCTCTGAAAAATGAACCTGAAGAAGAAATGTGAGTACCTCTTCCAAACAGTATAGTATCTATATTTCTAATTTATCTGGGAAGGGGATGCATTTGGCTTACAGCAGTGTAAAATATTTTGAACCATAGTTGGTTCTTAAAGGCCTGCGCTTATGACTNGGGAAAAAGAGAAAGTGCTTGTTGTTTTAGAAGTGGAAGTGTCTGAAGAACTATTTCAAAGGAGTCAGTCAATGGCTTTGTCATNGAAAAAACTGTCTTCTAGGCGAGGGATGATCTCAGAAAACTGATAAGTCTTTGATCTTGATAGATATATTTTGATGNAAAATTTAATCAAGGACCTTGAAAATTATTTCTTCTGCTCCCCGNTTGATTNGTTCTATTTTTCATTTGGAGAATAATTTGACGAAATTCGTTCTGAAGTTGGAAATACCTTAACAAGCCTTTATAATTTAACTTTAGAAGTTTGAAAGTCATTTGAGAGGCATAATGAAGTCGCCAATTTTTGNTATGTACATTTAGGATCCCCTTTAAGATTTTNTGTTGNAATTTAATTGNCNTCNTTTTCATNCTTTTCCCTTGTAGATACCTTCCGGATACTATTGATGTTGCTGGAGGAAATCAACCAAGATCAACAGGATGTGAATGCTGAAGNAGTTCCNTTTGGTTGNCATTATTCCGTAGATTGCTAGTGCAAGTTCCCTTTATCTAATGATTTATTTACTACNAAGACAGTTAAATTCTCTTCTATCTGCTTTNTAGATTCTGGATTCCTCTCTTCAGAAGTGTAATTANTGATGNTTGCNACCTNTATTTTTNTCCCCNTCCTTGGATACTTATCTGTGTTCAGACTTATGATGATACATGATAATATACTCATGCACTTGACTGCATGTTTNAAAATGTTGCCCTTTTCCGGTGATGCAAGAAATTGCTCTNAAAAAATGAGTTGGGTGNAAAACAGATGTTTGACTTGTTTTTGCACGACTCATTTCAGATTGTATGCTGTATGAATGGGCTTGTAAATTAATGTTTGAACTTTGAGCACTGACGTATTTTGTGGTCAACAACTAACCATATATGACAGGAGATAGCTCAGAAGGACCAGACAAA
SNP_position 1162
sequence_for_GGdesign GTTCCCTTTATCTAATGATTTATTTACTAC-AAGACAGTTAAATTCTCTTCTATCTGCTT[T/C]-TAGATTCTGGATTCCTCTCTTCAGAAGTGTAATTA-TGATG-TTGN-ACCT-TATTTTT
GGdesign_Final_Score 0.67
Ilmn_Id 12974_1162-0_B_F_1967850958
allele_1 T
allele_2 C

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_03 114.69

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain