+Marker Data: gg11748_1013

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 115.698
Annotation
Source Name FKO03-01.11353.C1
Source Type 43k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method GoldenGate
454-Contig_ID eggplant_rep_c11748
454-Contig_seq (unpadded) CAATCAAAACAGGCTTTTAGTTGTCATAATTCTCCGTCCCCAAGTTTAACTTTCTTCGTCGTTTTTTTAGTTGTCATAATCTTTCATTTTTAAAATCAAACTACACAAATTTTGATCAATATTTTAATGTATTTTTTCACAATATTGAAATGAAAAAAGTTGCAAACACTAATACTTTTTCATATAGCCTTTGAATATCTAAATTATTGTTTTAAAATATAAAATTAAGTTCAATTTAATTTAATTTTAAAAATTAGTTATATTGACTTTGTTTAACATGACAACTAAAGAGGGAGGATTTATGTTGNCATTTTNGATTTGTTTTTGNCCCCAATATTAGTTACTCGAATTTAACATTTTGGGTNAAAATNCAACAAACGGGTCANTGATCCAATCAATAACCAATGTATACGTTTTGATGAATTGATTTTGCCACGTCTCTTACTTCAGGATTTGTATGGGCAAGGAGCAAGAAGAATTGGGGTCACTTCATTGCCACCATTGGGCTGTCTCCCAGCTGCTAAAGCAATGTTTGGATTTCATAAGACTGGTTGTCTCTCNAAAGATAAATACAGTTGNCCNAAACAATTCAACNAAAAAGATCAATTCAACTGCAACTCAATTGNCAAAAGCAACTTCCTGGCCTTAAGATTNGCTGTATTCGACGTTTTCCNAGCCCATATATGACCTCGTCAAATCTCCATCAGACCACGGTAATTTTTCCATACANAAGTTCTACTATTCTACGCCCCTTNATTAAAAATNCCTGACTGACACTGACACAATATATGTATCTTTNTGTGATAATTAGGATTCGCGGTAGCGAATAGAGGGTNGCTGCGGNGACAGGAAAAGTNGGCGACAACATCACTATTTTGCAACCCAGAGTTAGCAAGGAGTTGCAGCAATGCAACAGAGTATGTGTTTTGGNNGATGGCATGCATTTATCTGAAACTGGTAACCAAGTCCTAGCTGATGCGCTCATTATGCAAGGCATATACCTAATTGGATAACTAATCCAACGAAATTTGTTATTGTTATGCCTTTCTTTTTNTGCNTCCAATTGAAGAATCTTAATAATTCAGNTTGATTGATTATTTGAAACTTTTTCGATTTGTAATTCTCATTTTCTGTTTGAGACAGTGAAGATGAAAATGATGTTCCTAGTTGTCATTAGTTATTCCTGAATGTACCATGTTGCGTGTGCATCTCCCACAGTATTTATGTATTAAATCCCAAATGACATCTCCTGTCGTCCTGTTAGATTAAATATATTAATTTGANTTTTTAAATAAGAATTTAGTTAGATATTCAAAAATTTTATAAAAG
SNP_position 1013
sequence_for_GGdesign ACTGGTAACCAAGTCCTAGCTGATGCGCTCATTATGCAAGGCATATACCTAATTGGATAA[T/C]TAATCCAACGAAATTTGTTATTGTTATGCCTTTCTTTTT-TGN-TCCAATTGAAGAATCT
GGdesign_Final_Score 0.891
Ilmn_Id 11748_1013-0_B_F_1951735165
allele_1 T
allele_2 C

Line allele-1 allele-2

Population Linkage Group Position
LWAE2012 E_03 115.698

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain