+Marker Data: SOL7148

Crop eggplant
Population LWAE2012
Linkage Group E_03
Marker Type SNP
Map Position 43.777
Annotation
Source Name YFR05B21A
Source Type 16k_SmUnigene
Source Sequence
Developer NIVTS
Document

Typing_Method Tm-Shift
Marker_Class SOL
STS_primer_fwd GGCTTATGAAGCTAATAACCGCCA
STS_primer_rev AAAAAGAGTGCAGCTCCAACCAAG
amplicon_seq ATTTGTATANGCANCTAGAAAGGAAACATCCCAGTGTCAGCATCCGACGTCAAGCTGCAGAGCTTCGTTATATATTGCAAGCACCTAAGTTGAAGATATCTCAAGAAGAAATGGTTACAATACCACTTATTGGTTCTAGCTATGATAGGTAAGGCCCATTCATCTGATATTATATTTCGTATGTTAGCTAAATAAAACACTACCAATTACTTTCTTCTATGCAGCGGGCATGATATGCAAGTGCCTGCGGAAATCAATATGGTTCATTAGTGGTTTGTTTGTTTTAATATGATAATGACTTGAGCATAGAGTTAATATAATTTAATTAAACACCACTTAGTGGTAAATGAAGTGTGTGCAAACTAAACCATACTTCAACTTCCAGCAGAGATGAAATTCTAGGTAATTTCTTTCAATCTGCTGAAGCCTTGATAAGCATTGGGCAAAGTTACCTGATATATGTATGTACTGGTGGGACATAGCAGGTATGTGGTGAAATAATCTAATGAAAGTGACTATGACACAACTATTATTTATGGGCTACTTTTTGGCATCCATGGACTGTAGAAAAATTTTGTAGTAAATGCCTCCAAGATATCATTGTTTAAAACATAGAAGTAGCTGGGCAGGTGAACACTTGACATTATCTTTTGTTTTTGGGGTAAGTAAAAGAAATTATATTTACCAAGTGAAATATTTACAAAGTGAAAAAGTACTTGAAACTAACCGACGCTGGGGAAAATGGCTTCAGCATCAGTTGTTAGCTACTCTTCTACTGGTCCATGCACTCCTCAATCTTATCGTGCATCAACAACCTATGTTGCTGGGACTCTTCAAAAATGTTGCAGCACCCGTATCAAATCCCCCAAAATGCATTACTACCTTTGGAGGATCCAACATGCACCCGTCAATGTACTTGANGAGTTTGAGCANCATAGTCAACANTACCATACACGGTCAAATCTGACAGTGGAGTTAGAGCGAATAATACCTTCTCCCATATAACCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNCCTCTTCTGTTAATAAATGCAAANTTTCTCNTATGGTAGTTGCAGGGGTCCAGTGGTTAGGAATGTGACTNCAGATTATTAACATCAANCTGAGAACTTTTTCTTGTGAACTCGATTTTCAACATATAATGTGCTCACTTTTAAGGGATATTAGATATAATACCTTTCTAAAGGGCTGAGTTTGTTACTTCTTGGGTAATCTAATTAGTTGTATTAGAGACAGACCTTCCGAAGTTAGAAATTGATTGAATGAAGCTCATTTAAGACTCATTTAACTATGCGAGAAGATTAATGGTAACTGAATGACAACATGTGTGTAGTACGTGACGCCATCATCTGATGTAATATGCTTTAACAGTTCTAACATATCAGCGTGGAGATTTCAGCATATTGATTTAACAGATACACATGATGAATTGTGGGTGACATTGTTTTCTTCTTTACTAAATGTTAGGTGTTTTCTCATTTTCACAACTTCAGGGACTACTCATTGTTCACAATAATATTTATACAAAGAACTCTTTATATTTCAATTCGTTAGTCTTATTTTCCTTTTTAGTCTCTTTAAAAAAGAATGTCCCTTTCCTTTTTTGGCTATTCCTGAATTCCAACATTTCACCTGACATAAGACCACAAAGTTAAGGGAATTTTAGTATATTCTACATATCTTTAGTTTAAAATCACAACGTTCAGAAGTCTCTTAATTTTTTAAACTTCGTGCCAAGTCAAAATTAGTCAAACAAATTGCAACCGAGGGAGTAATTCTTTTAAGGGACTCATGCTTCTTATGGCTGAGTGATTCCAGTCATCCCTGAAGATCAACACTTAAATTCCCCTCCTTTTTTGGTGTAGTTATGCTGGATCATGGACTGACAAAAACAAGGACAAAGATGACAGACAAAGTCGGTCTACAACGAATCAGCTTCCATCAAGTAGGGACTGGGTGGGGGACTTTCTGGTCTGGAAGCCTCCAGTTGGTTTGGAGAAAAGCCAATCATTCTGGGNNNNN
SNP_position 1186
allele_1 C
allele_2 T
ASP_primer_S GCGGGCTCGATTTTCAACATATAATGTGCTCAT
ASP_primer_L GCGGGCAGGGCGGCTCGATTTTCAACATATAATGTGCTAAC
Common_primer AGAAGTAACAAACTCAGCCCTTTAGAA
enzyme Stoffel frag.
dye EvaGreen

Line allele-1 allele-2
AE-P03 T T
LS1934 C C
Nakate Shinkuro T T
WCGR112-8 T T

Population Linkage Group Position
LW2010 E_03 37.0
LWA2010 LWA_03 37.244
LWAE2012 E_03 43.777
LWF2_2022 E_03 36.8

DB Program Definition E-Value

EST Name Species Strain